[일반용역](중앙,협상)미진단 희귀질환 멀티오믹스 데이터 생산

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진행 중

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공고 개요

재공고 · 질병관리청 국립보건연구원 · 실험실 분석

추정가격

1.27억원

참가자격 등록 마감

10/19(월) 18:00 · D-6

낙찰방법

협상에의한계약 · 기술 90 : 가격 10

참가 자격

학술.연구용역

무슨 일

미진단 희귀질환 멀티오믹스 데이터 생산

걸리는 것

추가 자격 요건 · 행정처분 이력

요약 AI 요약

기존 기술로 원인이 밝혀지지 않은 미진단 희귀질환을 대상으로 첨단 다중오믹스(Long-read 전사체 및 단백체) 데이터를 생산·분석하여 질병 원인을 규명하고 정밀 진단·맞춤형 치료 전략의 과학적 근거를 마련하는 사업이다.

• 미진단 심근병증 환자 조직 시료에서 고품질 RNA를 추출해 PacBio Revio 기반 Long-read RNA-seq(Iso-Seq) 데이터 생산(30건 이상, 샘플당 20M HiFi reads 이상)
• GRCh38 기반 매핑·전사체 어셈블리, full-length isoform 식별, 대체 스플라이싱 탐색, 이형질체 단위 발현량 정량화
• 전사체 수준 구조적 변이 탐색 및 SNP·삽입결실(Indel) 변이 발굴, 기확보 WGS 데이터와 연계한 통합 분석
• 미진단 희귀질환(대사·면역·내분비 등) 혈장 시료 70건 이상에 대해 5,300개 이상 단백질 마커를 포함한 대규모 단백체 데이터 생산
• 단백체 데이터 정규화·품질관리(internal/external control, CV 평가, bridge sample, batch effect 보정) 및 차등 발현 단백질(DEPs) 분석
• DEPs 대상 Gene Ontology·KEGG enrichment·STRING 기반 PPI 네트워크 등 기능적 분석과 무료 분석 Tool·사용 매뉴얼 제공

핵심요약

걸리는 것

추가 자격 요건 · 행정처분 이력

추가 자격 요건

중소기업·소상공인 확인서를 소지해야 하며, 미확인 시 입찰참가자격이 없다. 비영리법인은 확인서 없이 참가 가능.

‘중소기업ㆍ소상공인확인서’가 중소기업제품 공공구매 종합정보망(http://www.smpp.go.kr)에서 확인(전자입찰서 제출 마감일 전일까지 발급된 것으로서 전자입찰서 제출 마감일까지 계속 유지되어야 함)되지 않을 경우 입찰참가자격이 없습니다.

행정처분 이력

조세포탈 등 유죄판결 확정 후 2년이 지나지 아니한 자는 입찰참가자격이 없음.

- 「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조의5 및 같은 법 시행령 제12조제3항에 따라 ‘조세포탈 등을 한 자’로서 유죄판결이 확정된 날부터 2년이 지나지 아니한 자

가격

추정가격

127,272,727원

배정예산

141,374,000원

예정가격 방식

비예가

참가 자격 · 제한

업종제한

학술.연구용역(1169)
문서: 업종·면허 조합 · 한 업종

지역제한

제한 없음
문서: 지역 조건 · 없음

실적경쟁 · PQ

해당 없음
문서: 실적 · 없음

제출 방법

전자입찰
문서: 입찰 전 절차 · 따로 없음(나라장터만)

공동수급

공동수급불허
문서: 공동수급 · 막음

입찰참가 제한

없음

국제입찰

국내입찰

입찰 일정

평가 · 배점

기술 : 가격 — 기술 90점 · 가격 10점

협상 대상 기준 · 기술능력평가 점수가 기술능력평가분야의 배점한도의 85%이상인 자 중에서 선정합니다.

사업 내용 · 이 공고에 든 일

중심 · 미진단 희귀질환 멀티오믹스 데이터 생산

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

환자 조직·혈장 시료로부터 Long-read RNA-seq 및 단백체 데이터를 생산·분석하는 실험실 분석 위탁연구로, 시퀀싱·검체 분석을 수행하는 연구기업이 맡는 일이다.

걸리는 것 · 입찰 전 할 일

걸리는 조건

추가 자격 요건

중소기업·소상공인 확인서를 소지해야 하며, 미확인 시 입찰참가자격이 없다. 비영리법인은 확인서 없이 참가 가능.

‘중소기업ㆍ소상공인확인서’가 중소기업제품 공공구매 종합정보망(http://www.smpp.go.kr)에서 확인(전자입찰서 제출 마감일 전일까지 발급된 것으로서 전자입찰서 제출 마감일까지 계속 유지되어야 함)되지 않을 경우 입찰참가자격이 없습니다.

행정처분 이력

조세포탈 등 유죄판결 확정 후 2년이 지나지 아니한 자는 입찰참가자격이 없음.

- 「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조의5 및 같은 법 시행령 제12조제3항에 따라 ‘조세포탈 등을 한 자’로서 유죄판결이 확정된 날부터 2년이 지나지 아니한 자

더 확인할 것

회사 규모·신분

중소기업만 · 소기업·소상공인만

중소기업 또는 소상공인으로 한정하며, 비영리법인은 확인서 없이 참가 가능.

○ 「중소기업기본법」 제2조에 따른 중소기업자 또는 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 중소기업ㆍ소상공인 확인서를 소지한 자

대학·연구소 참가

그렇다

비영리법인은 중소기업·소상공인확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있다.

* 중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령 제2조의3 제1항 제2호에 따라 비영리법인은 중소기업·소상공인확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있습니다.

하도급

막음

공동계약 및 공동수급을 허용하지 않으며, 수행기관은 본 과업의 전부 또는 일부를 제3자에게 하도급하거나 재위탁할 수 없음.

• 하도급 한도 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

본 용역은 공동계약 및 공동수급을 허용하지 않음

수행기관은 본 과업의 전부 또는 일부를 제3자에게 하도급하거나 재위탁할 수 없음

일하는 주기

한 번·정해진 횟수

계약체결일로부터 2026년 12월 18일까지 시료 정도관리, 데이터 생산·분석, 최종결과보고서 제출을 한 번에 수행하는 연구용역.

○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

수행 기간

사업기간 (계약체결일부터) 2026-12-18

사업기간은 계약체결일로부터 2026년 12월 18일까지이며, 납품기한도 2026/12/18이다.

• 옮길 수 없는 끝 날짜 · 있음 사업기간·납품기한이 2026년 12월 18일로 정해져 있다.

  ○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

○ | 납품기한: | | | | | | | | | 2026/12/18 |

여러 해 계약

단년 한 번

사업기간이 계약체결일로부터 2026년 12월 18일까지로 단년 계약이며, 차수·연장·주기별 재입찰 기재는 없다.

○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

여러 과제로 나뉨

나뉘지 않음

단일 입찰(공고번호 R26BK01759767-000), 수량 1식, 총액계약.

• 여러 개 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 나뉘지 않아 해당 없음.

계약구분: 총액계약

수량: 1

총액·단가 방식

총액

총액계약으로 계약구분이 명시되어 있고, 사업예산 140,000,000원(VAT 포함)이 전체 사업기간 기준으로 산출되었다.

• 정산 · 확정 금액 총액계약으로 사업금액이 정해져 있고, 실적·실비 정산 조항은 없다.

  ○ | 계약구분: | | | | | | | | | 총액계약

• 단가 조정 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 계약 기간 중 단가 조정에 관한 조항이 문서에 없다.

○ | 계약구분: | | | | | | | | | 총액계약

◇ | 이 입찰의 사업금액은 전체 사업기간을 기준으로 산출되었으며, 가격입찰은 반드시 전체 사업기간에 해당하는 금액으로 입찰하여 주시기 바랍니다.

큰 배점 항목

연구내용(제안요청서에 대한 이해 정도 및 연구목표와의 부합성) 20점, 연구수행능력(연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력) 20점, 연구내용(연구목표의 달성가능성, 연구종료 후 활용방안 및 공공적 기대효과) 10점.

기술평가 90점 중 배점이 큰 항목 순.

▫ 제안요청서에 대한 이해 정도 및 연구목표와의 부합성 | 20

▫ 연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력 | 20

▫ 연구목표의 달성가능성, 연구종료 후 활용방안및 공공적 기대효과 | 10

평가 자리 발표

서면 평가만

제안서 평가는 서면심의를 통한 평가로 적혀 있고, 평가일시·장소는 수요기관이 별도 공지하되 별도 공지 없이 서면 평가할 수도 있다고 적혀 있다.

• 빠지면 · 해당 없음 발표가 없어 해당 없음.

- 선정방식: 서면심의를 통한 평가

제안서 평가는 수요기관에서 직접 평가위원을 구성하여 평가하며, 평가일시 및 장소는 수요기관에서 별도 공지할 예정입니다. 다만, 별도 공지 없이 서면 평가할 수도 있으니 평가관련 사항은 반드시 수요기관에 문의하시기 바랍니다.

무상·저가 추가 일

의무 · 계약 뒤 지킬 일

생산된 데이터 분석·확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

• 대상 · 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공 필요시 관련 교육 제공

  - 생산된 데이터 분석, 확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

- 생산된 데이터 분석, 확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

보관 조건

의무 · 계약 뒤 지킬 일

데이터 생성 후 잔여 조직·추출물(RNA)·잔여 혈장은 전수 폐기(또는 발주부서 반환)

• 대상 · 기타 인체유래물(조직·RNA·혈장) 잔여분 폐기·반환

  - 데이터 생성 후 잔여 조직 및 추출물(RNA)은 전수 페기함(또는 발주부서 반환)

- 데이터 생성 후 잔여 조직 및 추출물(RNA)은 전수 페기함(또는 발주부서 반환)

- 데이터 생성 후 잔여 혈장은 전수 폐기(또는 발주부서 반환)

공고 정보

공고종류

재공고 (재입찰공고)

게시일

10/07(수)

공고번호

R26BK01759767-000

참조번호

-

공고기관

조달청 충북지방조달청

수요기관

질병관리청 국립보건연구원

계약방법

제한경쟁

낙찰방법

협상에의한계약

계약유형

총액계약

예정가격 방식

비예가

추정가격

127,272,727원

배정예산

141,374,000원

공공조달분류

연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 보건복지연구조사서비스

사전규격번호

R26BD00269741

재공고

재공고

출처

나라장터

문서 분석 전체

이 분야에서 갈리는 것 · 이 일에 맞는 지정·등록과 숙련도 적합·CAP 같은 외부 인정을 갖췄나, 특정 병원체 이력·상급종합병원 거래 같은 좁은 실적 벽이 있나, IRB·IND 승인을 마친 과제여야 하나, 건수와 현장 채혈·매일 수거 같은 손이 감당되나에서 갈린다.

질문 91개 · 꼭 5 · 좋음 18 · 안 봐도 됨 68

주제 · 참가 자격 10개

업종·면허 조합

한 업종

학술연구용역[업종코드:1169] 하나만 등록하도록 요구하며, 코드 밖 자격으로는 중소기업·소상공인 확인서 소지(비영리법인은 면제)가 있다.

• 코드 밖 자격 · 벽 · 못 맞추면 탈락 중소기업·소상공인 확인서를 소지해야 하며, 미확인 시 입찰참가자격이 없다. 비영리법인은 확인서 없이 참가 가능.

  ‘중소기업ㆍ소상공인확인서’가 중소기업제품 공공구매 종합정보망(http://www.smpp.go.kr)에서 확인(전자입찰서 제출 마감일 전일까지 발급된 것으로서 전자입찰서 제출 마감일까지 계속 유지되어야 함)되지 않을 경우 입찰참가자격이 없습니다.

- [학술.연구용역(1169)] 업종을 등록한 업체

○ 「중소기업기본법」 제2조에 따른 중소기업자 또는 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 중소기업ㆍ소상공인 확인서를 소지한 자

면허 세부 범위

없음

업종코드 1169 등록 외에 주력분야·종별 같은 세부 범위 요구는 없다.

지역 조건

없음

본점 지역 제한 외에 지역 조건은 문서에 없다.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 대상 · 없음

실적

없음

참가자격에 실적 요구가 없고, 평가표에도 실적 배점 항목이 없다. 수행실적총괄표·수행실적증명서 서식은 있으나 배점표에 반영되지 않음.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 조건 · 없음

업력

없음

업력 요구나 배점이 없다.

• 요구 업력 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

공동수급

막음

• 자격을 나눠 채우기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

- 본 용역은 공동계약 및 공동수급을 허용하지 않음

회사 규모·신분

중소기업만 · 소기업·소상공인만

중소기업 또는 소상공인으로 한정하며, 비영리법인은 확인서 없이 참가 가능.

○ 「중소기업기본법」 제2조에 따른 중소기업자 또는 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 중소기업ㆍ소상공인 확인서를 소지한 자

대학·연구소 참가

그렇다

비영리법인은 중소기업·소상공인확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있다.

* 중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령 제2조의3 제1항 제2호에 따라 비영리법인은 중소기업·소상공인확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있습니다.

사업 성격

아니다(적지 않음)

행정처분 이력

벽 · 못 맞추면 탈락

조세포탈 등 유죄판결 확정 후 2년이 지나지 아니한 자는 입찰참가자격이 없음.

• 보는 기간 · 2년 이하

  - 「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조의5 및 같은 법 시행령 제12조제3항에 따라 ‘조세포탈 등을 한 자’로서 유죄판결이 확정된 날부터 2년이 지나지 아니한 자

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

- 「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조의5 및 같은 법 시행령 제12조제3항에 따라 ‘조세포탈 등을 한 자’로서 유죄판결이 확정된 날부터 2년이 지나지 아니한 자

주제 · 인증·보유 요건·직접 수행 7개

안전보건수준평가

없음

안전보건수준평가 대상 사업이라는 문장이 없고, 중대재해처벌법에 따른 안전·보건 의무 준수만 적혀 있다.

제조사 확약서

없음

제조사·공식 공급원에게서 받아 오는 확약서·증명서 요구가 없다.

• 대상 · - 해당 서류 없음
• 조건 · 없음

제품 인증

없음

제품 인증·허가·시험성적서 요구가 없다.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 대상 · -
• 조건 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

장비·시설 보유

의무 · 계약 뒤 지킬 일

계약 전 발주부서 요구에 따라 사업 수행 관련 실험 장비, 인력 등 관련 증빙자료를 제출·검토 받아야 함. 평가표에 기자재·시설 등 연구환경 확보 및 관리 운영 능력 10점 배점.

• 갖출 때 · 계약 전(낙찰 뒤)

  계약 전 발주부서 요구에 따라 사업 수행 관련 실험 장비, 인력 등 관련 증빙자료를 제출 및 검토 받아야함

• 크기 · 2~10점

  ▫ 연구수행에 필요한 기자재ㆍ시설 등 연구환경 확보 및 관리 운영 능력 | 10 | □ □ □ □ □

  ▫ 연구수행에 필요한 기자재ㆍ시설 등 연구환경 확보 및 관리 운영 능력 | 10 | 10 8 6 4 2

• 조건 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

계약 전 발주부서 요구에 따라 사업 수행 관련 실험 장비, 인력 등 관련 증빙자료를 제출 및 검토 받아야함

▫ 연구수행에 필요한 기자재ㆍ시설 등 연구환경 확보 및 관리 운영 능력

하도급

막음

공동계약 및 공동수급을 허용하지 않으며, 수행기관은 본 과업의 전부 또는 일부를 제3자에게 하도급하거나 재위탁할 수 없음.

• 하도급 한도 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

본 용역은 공동계약 및 공동수급을 허용하지 않음

수행기관은 본 과업의 전부 또는 일부를 제3자에게 하도급하거나 재위탁할 수 없음

직접 생산

없음

직접생산확인·제조 등록·OEM 금지·한 제조사 제품 요구가 없다. 참가자격은 학술연구용역[업종코드:1169] 등록 업체.

• 참가 등록 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 직생 범위 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 대상 · -

품질 인증

없음

품질·환경·안전·정보보호 인증이나 업무 절차서를 참가 조건·점수로 보지 않는다.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 대상 · -

주제 · 결과물·검수·보고 10개

지정 제품·공법

지정 — 동등 이상 허용

시퀀싱 플랫폼을 PacBio Revio로 지정하고, 단백체 분석은 최소 5,300개 이상 단백질 마커 정보를 포함하는 대규모 단백체 분석 플랫폼을 이용하되 발주부서와 협의하여 분석플랫폼을 결정한다고 적었다. 동등 이상 허용 문구는 없다.

• 동등 입증 때 · 해당 없음 동등 이상 허용 문구가 없어 동등 입증 시점도 없다.

· 시퀀싱 플랫폼: PacBio Revio

※ 발주부서와 협의하여 분석플랫폼 결정, 발주부서에서 수행기관에 분석 대상자(대조군, 희귀질환군 등) 및 시료 제공

검수

발주처 검수만

검사/검수기관은 수요기관/수요기관이며, 결과 완료 및 검수 후 잔여 시료 폐기확인서 제출로 끝난다. 외부 기관 심의·승인·검사는 없다.

○ | 검사/검수기관: | | | | | | | | | | | | 수요기관 / 수요기관

○ 결과 완료 및 검수 후 용역 시 사용하고 남은 시료는 폐기 후 폐기확인서 제출

합격선

숫자 기준 있음

시료당 최소 2,000만(20M) HiFi reads 이상, 대상 시료 30건 이상, 혈장 70건 이상, 최소 5,300개 이상 단백질 마커 정보 포함 등 수치 합격선이 있다.

• 따를 표준·지침 · 인간 최신 표준 유전체(GRCh38) 기반 매핑 및 전사체 어셈블리, PacBio Iso-Seq(Long-read RNA-seq), Gene Ontology·KEGG Enrichment·STRING 기반 PPI 네트워크 분석, 발주부서 기확보 WGS 데이터와 연계 통합 분석 GRCh38, Iso-Seq, GO/KEGG/STRING, WGS 연계 등 방법론을 지정했다.

  - 인간 최신 표준 유전체(GRCh38) 기반 매핑 및 전사체 어셈블리 수행

  ※ Gene Ontology, KEGG Enrichment 분석, STRING 기반의 PPI 네트워크 분석 등 포함

· 데이터 생산량: 샘플당 최소 2,000만(20M) HiFi reads 이상

- 최소 5,300개 이상의 단백질 마커 정보를 포함하여 혈장 70건 이상에 대한 단백체 데이터 생산

성과 목표

목표 없음

숫자로 정한 성과 목표·성능 보증과 못 채울 때의 불이익은 문서에 없다.

• 목표의 성격 · 해당 없음 성과 목표 자체가 없다.

시험·검사

시험·검사 없음

이 공고가 정한 별도 품질 시험·검사·분석 비용 조항은 없다. 시료 정도관리(RNA 농도·순도·온전성, 용혈·지질혈증 확인, internal/external control, CV 평가)는 수행기관이 수행하는 실험 품질관리로 별도 시험 비용 조항은 없다.

• 시험 단위 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 시험 단위를 정한 문장이 없다.
• 시험 장소 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 시험 장소를 정한 문장이 없다.

- 실험을 수행하기 전 모든 시료에 대해 3단계 정량·정성적 정도관리를 통해 최소 품질을 만족하는 시료만 선별하며 실험을 진행

원자료

나눠짐

시료는 국립중앙인체자원은행 분양 또는 발주부서로부터 제공받고, 발주부서가 기확보한 WGS·유전변이 데이터를 연계하며, 나머지 데이터 생산·분석은 수행기관이 한다.

- 수행기관은 사업수행을 위해 질병관리청 국립보건연구원 국립중앙인체자원은행 분양 또는 발주부서로부터 시료를 제공받음

- 발주부서에서 기확보된 동일 환자의 WGS 데이터 (short-read/ long-read seq)와 연계하여 통합 분석 수행

시안 승인

해당 없음

본 작업·제작 전 시안·샘플·제작도·중간검수 승인 단계를 정한 문장이 없다. 사업 착수 보고 회의만 있다.

• 수정 횟수 · 해당 없음 수정 횟수를 정한 문장이 없다.
• 승인 기간 · 해당 없음 승인 기간을 정한 문장이 없다.

인허가·검사

절차 없음

이 일에 필요한 인허가·신고·심의·법정 검사를 정한 문장이 없다.

• 비용 · 해당 없음 인허가·검사 절차가 없어 비용 조항도 없다.

보고 주기

수시

사업수행에 필요한 전반적인 추진 상황은 발주부서와 사전 논의하여 진행할 것이라고만 적혀 정기 보고 주기는 없다. 착수 보고 회의가 있다.

• 보고회 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 착수 보고 회의 외에 중간·최종 보고회 횟수를 정한 문장이 없다.
• 작업 기록·증빙 · 요구 없음 수행을 확인받거나 대금을 받으려고 내는 작업 기록·증빙을 정한 문장이 없다.

○ 사업수행에 필요한 전반적인 추진 상황은 발주부서와 사전 논의하여 진행할 것

- 사업 착수 보고 회의를 실시하고, 발주기관으로부터 제공받은 시료를 수령하여 엄격 정도 관리를 수행함

넘길 산출물

편집 가능한 원본·작업 파일 · 원자료·해석 입력 자료

원시데이터(FASTQ, BAM), 데이터 품질관리 결과, 분석 파이프라인 및 주요 파라미터, 전사체 및 isoform 구축 결과, 발현 분석·alternative splicing 분석 결과, 단백체 raw data 파일, QC 정보, 가공 정보, 시각화 자료, 전처리 완료 산출물(BAM, GTF, 발현량 Matrix 등) 일체를 제출한다. 파일 형식·프로그램 버전·저장매체는 정해 적지 않았다.

• 정해진 형식 · 아니다 파일 형식·프로그램 버전·저장매체를 정해 적은 문장이 없다.

- 원시데이터(FASTQ, BAM), 데이터 품질관리 결과, 분석 파이프라인 및 주요 파라미터, 전사체 및 isoform 구축 결과, 유전자·isoform 발현 분석, alternative splicing 분석 결과, 기존 유전체·전사체 데이터와의 통합 분석 결과 등 모든 실험·분석 결과와 잔여 시료 제출

- 수행기관은 전처리 완료된 산출물(BAM, GTF, 발현량 Matrix 등) 일체와 원시 데이터 및 최종 결과 보고서를 발주기관에 납품함

주제 · 인력·수행 방식 8개

인력 자격

감점 · 점수에 반영

평가표 '연구수행 능력' 항목에 연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험·기술력 등 전문성과 수행능력이 20점 배점으로 반영됨. 별도의 참가자격상 자격·학위 요건은 없고, 참고자료의 참여연구원 등급별 기준(책임연구원·연구원 등)은 인건비 계상 기준임.

• 크기 · 4~20점 연구수행 능력(연구책임자 및 참여연구원의 전문성·수행능력) 배점 20점, 등급별 20/16/12/8/4

  ▫ 연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력 | 20 | □ □ □ □ □

  20 16 12 8 4

• 대상 · 책임자(PM·책임기술자·현장대리인) · 투입 인력 전반 연구책임자 및 참여연구원

  ▫ 연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력 | 20 | □ □ □ □ □

▫ 연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력 | 20 | □ □ □ □ □

▪의사, 약사, 수의사, 기술사 취득 후 해당분야 경력 5년 이상

근무 장소

모름 · 문서로 확인 안 됨

시료를 제공받아 수행기관이 실험·분석을 수행하는 구조로, 작업장소를 특정하지 않고 '과업내역에 따름'으로만 기재됨. 원격 접속 관련 규정 없음.

• 현장에 있을 사람 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 원격 접속 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

○ | 납품장소: | | | | | | | | | 과업내역에 따름

수행기관은 사업수행을 위해 질병관리청 국립보건연구원 국립중앙인체자원은행 분양 또는 발주부서로부터 시료를 제공받음

소속 직원

없음

투입 인력이 자사 소속 직원이어야 한다는 요구 없음. 참여연구원이 주관기관에 소속되지 않은 경우의 정산 증빙만 규정.

• 재직 기간 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 조건 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

고용승계

없음

고용승계 관련 요구 없음.

근무 시간

해당 없음

근무 요일·시간·교대 형태가 정해진 일이 아님(연구용역).

보안 조치

없음

제안요청서에 '참가업체는 제안서 작성과정에서 획득한 국립보건연구원에 대한 정보를 대외에 누설하거나 본 용역 수행 이외의 다른 목적에 사용할 수 없으며'라는 일반 보안 문구만 있고, 출입·서약·교육·반입·망 통제·자료 반출·개인정보 위탁계약을 이 일에 요구한 조항은 없음.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

신원 조건

없음

투입 인력에 대한 범죄경력·신원조회·운전적격·건강검진 요구 없음.

• 갖출 때 · 모름 · 문서로 확인 안 됨
• 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

일하는 주기

한 번·정해진 횟수

계약체결일로부터 2026년 12월 18일까지 시료 정도관리, 데이터 생산·분석, 최종결과보고서 제출을 한 번에 수행하는 연구용역.

○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

주제 · 과업 범위·규모·기간 11개

다른 업 섞임

섞이지 않음

본 용역은 학술연구용역[업종코드:1169] 단일 업종이며, 공동수급·하도급을 금지하고 있다. 다른 면허·공종·품목의 일이 섞였다는 기재는 없다.

「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령」제12조 및 동법 시행규칙 제14조의 규정에 의한 유자격자로서 동법 시행령 제76조에 해당하지 않으며 견적서 제출 마감일 전일까지 국가종합전자조달시스템에 학술연구용역[업종코드:1169] 으로 입찰참가 등록한 업체

- 본 용역은 공동계약 및 공동수급을 허용하지 않음

- 수행기관은 본 과업의 전부 또는 일부를 제3자에게 하도급하거나 재위탁할 수 없음

하는 일

미진단 희귀질환 환자의 조직 시료로부터 고품질 RNA를 추출해 PacBio Long-read RNA-seq(30건 이상) 데이터를 생산·분석하고, 혈장 시료 70건 이상에 대해 5,300개 이상 단백질 마커를 포함한 대규모 단백체 데이터를 생산·분석한다. 생산된 다중오믹스 데이터의 전처리·정규화·통계 분석과 기능·경로 분석을 수행하고 원시데이터·분석 결과·최종 결과보고서를 제출한다.

○ 환자 조직 시료로부터 고품질의 RNA를 추출하고, 전사체 전장 분석을 위한 Long-read RNA-seq 데이터 생산 (30건 이상)

○ 미진단 희귀질환 환자 유래 혈장 검체를 대상으로 대규모 단백체 분석 플랫폼을 이용하여 단백질 프로파일링(5,300개 이상 단백질 마커 정보 포함) 데이터 생산 (70건 이상)

기존 시스템과 이어짐

기존 시스템·설비와 연동 · 이어지는 연속 사업

발주부서에서 기확보된 동일 환자의 WGS 데이터(short-read/long-read seq)와 연계한 통합 분석, 기확보된 유전변이 데이터와 연계한 통합 분석을 수행해야 한다. 관련 연구과제(다중오믹스 기반 희귀 유전성 심근병증 원인인자 발굴 등)에 이어지는 사업이다.

- 발주부서에서 기확보된 동일 환자의 WGS 데이터 (short-read/ long-read seq)와 연계하여 통합 분석 수행

- 발주부서에서 기확보된 유전변이 데이터와 연계한 통합 분석 수행

※ 관련 연구과제: 다중오믹스 기반 희귀 유전성 심근병증 원인인자 발굴, 대사 및 면역이상 희귀질환 원인인자 발굴 및 병인 분석 연구

일의 분량

Long-read RNA-seq 데이터 생산·분석 대상 시료 30건 이상 · 단백체 데이터 생산·분석 대상 혈장 시료 70건 이상 · 단백질 마커 정보 5,300개 이상

사업예산 140,000,000원(VAT 포함), 추정가격 127,272,727원(부가가치세 제외). 수량은 공고상 1식.

• 열린 분량 · 정해짐

  - 대상 시료 수: 30건 이상

  - 분석 대상 시료 수: 혈장 70건 이상

- 대상 시료 수: 30건 이상

- 분석 대상 시료 수: 혈장 70건 이상

- 최소 5,300개 이상의 단백질 마커 정보를 포함하여 혈장 70건 이상에 대한 단백체 데이터 생산

수행 기간

사업기간 (계약체결일부터) 2026-12-18

사업기간은 계약체결일로부터 2026년 12월 18일까지이며, 납품기한도 2026/12/18이다.

• 옮길 수 없는 끝 날짜 · 있음 사업기간·납품기한이 2026년 12월 18일로 정해져 있다.

  ○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

○ | 납품기한: | | | | | | | | | 2026/12/18 |

여러 해 계약

단년 한 번

사업기간이 계약체결일로부터 2026년 12월 18일까지로 단년 계약이며, 차수·연장·주기별 재입찰 기재는 없다.

○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일

최소 투입 인원

해당 없음

최소 투입 인원·공수(MD)가 정해져 있지 않다.

• 조 편성 · 해당 없음

다른 일정에 묶임

아니다

다른 공사·사업 일정에 묶였다는 기재는 없다.

부가 작업

시료 정도관리(3단계 정량·정성 QC, 용혈·지질혈증 확인), 잔여 조직·추출물(RNA)·잔여 혈장의 전수 폐기(또는 발주부서 반환) 및 폐기확인서 제출, 생산 데이터 분석·확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공, 사업 착수 보고 회의 실시, 계약 전 실험 장비·인력 등 관련 증빙자료 제출.

- 실험을 수행하기 전 모든 시료에 대해 3단계 정량·정성적 정도관리를 통해 최소 품질을 만족하는 시료만 선별하며 실험을 진행

- 데이터 생성 후 잔여 조직 및 추출물(RNA)은 전수 페기함(또는 발주부서 반환)

- 생산된 데이터 분석, 확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

○ 결과 완료 및 검수 후 용역 시 사용하고 남은 시료는 폐기 후 폐기확인서 제출

교육·기술이전

모름 · 문서로 확인 안 됨

「필요시 관련 교육 제공」이라고만 적혀 있어 횟수·무상 여부가 정해지지 않았다.

• 무상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 교육 제공 조건·대가에 대한 기재가 없다.

- 생산된 데이터 분석, 확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

일의 형태

조사·측정 · 계획·연구·자문

시료를 직접 실험·분석해 데이터를 생산하고(조사·측정), 생산된 데이터를 분석해 후보 유전자·변이·바이오마커를 발굴하고 기능·경로 분석 결과를 낸다(계획·연구·자문).

- 시료를 이용하여 고품질 RNA 추출, 라이브러리 제작, PacBio 시퀀싱 및 대규모 단백체 데이터를 생산함

- 생성된 다중오믹스 데이터를 바탕으로 기초 데이터 전처리, 정규화 및 통계 분석, 분자 네트워크 기능 및 경로 분석 과업을 수행함

주제 · 입찰 절차·보증 7개

참가 범위

공개 경쟁

제한경쟁입찰·협상에 의한 계약. 학술연구용역(1169) 업종 등록, 중소기업·소상공인 확인서 소지 등 조건을 갖춘 자면 참여 가능.

입찰방식: 제한경쟁입찰, 협상에 의한 계약

[학술.연구용역(1169)] 업종을 등록한 업체

여러 과제로 나뉨

나뉘지 않음

단일 입찰(공고번호 R26BK01759767-000), 수량 1식, 총액계약.

• 여러 개 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 나뉘지 않아 해당 없음.

계약구분: 총액계약

수량: 1

입찰 전 절차

따로 없음(나라장터만)

제안서·가격입찰서 모두 나라장터를 통해 전자 제출. 별도 방문·우편·팩스 제출이나 사전 참가신청 절차 없음.

제출장소 : 국가종합전자조달시스템(나라장터)

본 사업은 「협상에 의한 계약체결기준」, 「조달청 협상에 의한 계약 제안서평가 세부기준」에 따라 제안서(증빙서류 등 포함)는 반드시 입찰자(공동수급체 경우 대표자)가 국가종합전자조달시스템(나라장터)를 통하여 전자적으로 제출하여야 합니다.

현장설명회

없음

현장설명회·현장답사 관련 조항 없음.

공채·채권

모름 · 문서로 확인 안 됨

공채·채권 매입 비율을 이 공고에 적지 않음.

입찰보증금

면제·지급각서로 갈음

일부(채무불이행·금융질서문란자, 입찰참가자격 제한자)만 실제 납부, 그 외는 면제하고 지급각서 제출. 계약보증금은 조달청 내자구매업무 처리규정 제48조의2, 하자보수보증금은 용역 계약금액의 100분의 2.

• 입찰보증금 비율 · 5% 이상 입찰금액의 100분의 5 이상(기획재정부장관 고시 시 1천분의 25 이상) — 실제 납부 대상자에 한함.

  입찰금액의 100분의 5이상(「국가계약법 시행령」 제37조 제1항 단서조항에 따른 기획재정부장관이 기간을 정하여 고시한 경우에는 1천분의 25이상)의 입찰보증금을 납부 하여야 합니다.

• 계약·하자 보증 비율 · 2% 하자보수보증금 용역 계약금액의 100분의 2(물품은 3). 계약보증금은 조달청 내자구매업무 처리규정 제48조의2 적용.

  용역의 경우 계약금액의 100분의 2

(납부면제) 위 사항을 제외하고는 이 입찰에서 입찰보증금의 납부는 면제하되, 입찰보증금 지급각서를 제출하여야 합니다.

용역의 경우 계약금액의 100분의 2

문서끼리 다른 곳

아니다

입찰공고서와 제안요청서가 다르면 입찰공고서 우선이라는 정형 조항만 있고 실제 어긋난 값 없음.

이 입찰집행과 관련하여 입찰공고서와 과업내용서(제안요청서 등 입찰 첨부서류 일체)의 내용이 서로 다를 경우 입찰공고서가 우선하여 적용됩니다.

주제 · 현장 작업·유지보수 9개

출동 시한

해당 없음

연구용역(데이터 생산·분석)으로 고장·장애·긴급 호출에 따른 현장 출동·착수 시한 규정이 없다.

• 도착 시한 · 해당 없음 현장 출동·착수 시한 규정 없음

처리 시한

해당 없음

요청·장애를 받아 처리·복구하는 유지보수 성격의 일이 아니다. 결과물 제출 시한은 용역 마감일 제출이다.

• 기점 · 해당 없음

부품·소모품

해당 없음

유지보수 계약이 아니라 데이터 생산·분석 연구용역이다.

현장·납품지

1곳

납품장소는 과업내역에 따름(수요기관 국립보건연구원). 시료는 국립중앙인체자원은행 분양 또는 발주부서로부터 제공받음.

• 열린 분량 · 정해짐 납품장소는 과업내역에 따름

  납품장소: 과업내역에 따름

• 범위 · 없음(국내 보통 현장) 국내입찰, 해외·섬·개별 배송 없음

  국내/국제입찰 구분: 국내입찰

납품장소: 과업내역에 따름

현장 여건

실험실에서 시료를 받아 RNA 추출·라이브러리 제작·시퀀싱 및 단백체 분석을 수행하는 실내 연구용역이다. 별도의 부대공사·현장 준비나 위험작업에 대한 규정은 없다.

• 부대공사·현장 준비 · 해당 없음
• 위험작업 · 없음

작업 시기

해당 없음

연구용역으로 일할 때의 외부 제약(야간·운영 중·교통통제·기상 등) 규정이 없다.

경비 부담

우리 부담(대가 안)

사업예산 140,000,000원(VAT 포함)에 시약·연구용재료비, 전산처리비, 여비 등 경비가 포함됨. 관급 없음.

• 관급 금액 · 해당 없음
• 관급 설치 · 해당 없음

(사업예산) 140,000,000원 (VAT 포함)

폐기물 처리 몫

우리 몫

데이터 생성 후 잔여 조직·추출물(RNA)·잔여 혈장은 전수 폐기(또는 발주부서 반환)하고 폐기확인서를 제출한다.

데이터 생성 후 잔여 조직 및 추출물(RNA)은 전수 페기함(또는 발주부서 반환)

데이터 생성 후 잔여 혈장은 전수 폐기(또는 발주부서 반환)

결과 완료 및 검수 후 용역 시 사용하고 남은 시료는 폐기 후 폐기확인서 제출

하자보수

해당 없음

연구용역으로 결과물의 무상 하자보증·교환 기간 규정이 없다.

• 기점 · 해당 없음
• 보증 기간 정기점검 · 해당 없음
• 소모성·정기정비 부품 · 해당 없음

주제 · 가격·대금·계약 조건 11개

대금 방식

발주처가 대금 지급

질병관리청 국립보건연구원이 발주처로서 사업예산 140,000,000원(VAT 포함)을 지급하는 연구용역이다. 이용자·수혜자가 비용을 대는 수익형 요소는 문서에 없다.

• 이용자 몫 수납 · 해당 없음 본 답이 발주처가 대금 지급이므로 이용자 몫 수납은 해당 없음.

○ (사업예산) 140,000,000원 (VAT 포함)

○ 사업금액: 140,000,000원(부가가치세 포함)

총액·단가 방식

총액

총액계약으로 계약구분이 명시되어 있고, 사업예산 140,000,000원(VAT 포함)이 전체 사업기간 기준으로 산출되었다.

• 정산 · 확정 금액 총액계약으로 사업금액이 정해져 있고, 실적·실비 정산 조항은 없다.

  ○ | 계약구분: | | | | | | | | | 총액계약

• 단가 조정 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 계약 기간 중 단가 조정에 관한 조항이 문서에 없다.

○ | 계약구분: | | | | | | | | | 총액계약

◇ | 이 입찰의 사업금액은 전체 사업기간을 기준으로 산출되었으며, 가격입찰은 반드시 전체 사업기간에 해당하는 금액으로 입찰하여 주시기 바랍니다.

물량 변동

일부 미정

대상 시료 수(Long-read RNA-seq 30건 이상, 단백체 혈장 70건 이상)는 확정되어 있으나, 필요시 발주부서와 협의하여 분석 샘플 수 증가·교체 등 변경할 수 있고, 분석플랫폼·분석 대상자·데이터 생산 프로토콜 등은 발주부서와 협의하여 결정한다.

※ 필요시 사업수행 기간 중 발주부서에서 용역 수행기관과의 협의 하에 분석 샘플 수 증가, 교체 등 변경할 수 있음

※ 발주부서와 협의하여 분석플랫폼 결정, 발주부서에서 수행기관에 분석 대상자(대조군, 희귀질환군 등) 및 시료 제공

발주처 단가 기준

산정 기준만 적혀 있음

연구비 계상 기준(인건비 기준단가, 일반관리비 6% 이내, 이윤 10% 이내, 부가가치세 1/11 등)이 참고자료로 제시되어 있으나, 이 공고가 특정 단가·금액을 정하여 적은 것은 아니다.

◦ 일반관리비는 부가가치세를 제외한 (∑인건비~연구과제추진비) × 6% 이내로 계상한다.

◦ 이윤은 영업이익을 말하며, 인건비, 경비 및 일반관리비의 합계액에 10%를 초과하여 계상할 수 없다

계약 상대

공고 낸 기관 직접

조달청 충북지방조달청이 공고를 냈고 수요기관은 질병관리청 국립보건연구원이며, 계약·대금 상대가 다른 곳이라는 문장은 없다.

그대로 넘길 돈

아니다

계약금액 안에서 다른 곳에 넘기거나 정해진 곳에 그대로 써야 하는 돈을 적은 조항이 없다.

• 넘길 돈 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 조항이 없다.
• 투찰 때 반영 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 조항이 없다.

견적 근거

공개 안 됨

설계서·내역서·도면 등 견적 근거가 입찰 전에 공개된다는 안내가 문서에 없다.

• 이윤 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 원가계산서·산출내역이 공개되지 않았다.

대금 받는 때

끝난 뒤 한 번에

결과 완료 및 검수 후 결과물을 제출하고, 제출 시기는 용역 마감일에 제출한다. 선금·지급 기한에 관한 이 공고의 조항은 없다.

• 선금 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 선금 비율을 적은 조항이 없다.
• 지급 기한 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 청구 뒤 지급 기한을 적은 조항이 없다.

○ 결과 완료 및 검수 후 용역 시 사용하고 남은 시료는 폐기 후 폐기확인서 제출

○ 제출 시기는 용역 마감일에 제출하되, 필요시 발주부서와 용역 수행 업체 간 협의하에 조정이 가능함

보험 가입

없음

이 일 때문에 들어야 하는 보험·공제를 요구하는 조항이 문서에 없다.

• 보상 한도 · 해당 없음 보험 요구가 없다.
• 보험료 · 해당 없음 보험 요구가 없다.
• 대상 · 해당 없음 보험 요구가 없다.

계약 변동 가능

아니다

예산 확정 전이거나 보조사업자와의 계약 같은 조건으로 계약이 안 되거나 금액·물량·기간이 바뀔 수 있다고 적은 문장이 없다.

• 바뀔 수 있는 것 · 해당 없음 해당 조항이 없다.

부가세 과세

모름 · 문서로 확인 안 됨

이 일·품목의 과세·면세를 적은 문장은 없고, 사업예산·사업금액이 부가가치세 포함으로 표기되어 있을 뿐이다.

• 투찰가에 부가세 · 넣는다 입찰금액은 부가가치세를 포함한 가격으로 투찰하라고 적었다.

  ◇ | 사업예산 및 입찰금액은 부가가치세를 포함한 가격입니다.

○ | 사업금액: | | | | | | | | | 140,000,000원(부가가치세 포함)

뽑는 방식 · 입찰 방식 10개

회사 속성 우대

없음

평가표(연구내용·연구수행능력·수행방법·연구추진적정성 90점)에 회사 속성 우대 항목이 없고, 참가자격은 중소기업·소상공인 확인서 소지 등 자격 요건일 뿐 우대가 아니다.

• 우대 대상 · 없음 문서에 회사 속성 우대 대상이 적혀 있지 않다.
• 가점 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 회사 속성 우대 가점이 없어 크기도 없다.

신용등급·경영상태

없음

평가표에 신용평가등급·기술신용평가·재무비율·매출·지급여력 점수 항목이 없고, 참가자격에도 신용 관련 조건이 없다.

• 등급이 없을 때 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 등급이 없거나 유효기간이 지난 업체를 어떻게 매기는지 적혀 있지 않다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 신용평가 관련 배점이 없다.
• 대상 · 없음 신용평가등급·기술신용평가·재무비율·매출·지급여력 어느 것도 평가 대상이 아니다.

보유 인력

없음

평가표의 「연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력」은 투입 인력의 전문성 평가이고, 회사 보유 인력 수·등급을 참가 조건이나 점수로 보는 항목은 없다.

• 기준 인원 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 기준 인원이 적혀 있지 않다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 보유 인력 수·등급 배점이 없다.

전담 인력

없음

투입 인력의 전담·겸직 금지, 참여율 상한, 업무중첩도 감점 규정이 없다.

• 참여율 상한 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 참여율 상한이 적혀 있지 않다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 업무중첩도 배점이 없다.
• 대상 · 없음 전담·겸직 관련 대상이 없다.

큰 배점 항목

연구내용(제안요청서에 대한 이해 정도 및 연구목표와의 부합성) 20점, 연구수행능력(연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력) 20점, 연구내용(연구목표의 달성가능성, 연구종료 후 활용방안 및 공공적 기대효과) 10점.

기술평가 90점 중 배점이 큰 항목 순.

▫ 제안요청서에 대한 이해 정도 및 연구목표와의 부합성 | 20

▫ 연구책임자 및 참여연구원의 연구수행 경험 및 기술력 보유 등 전문성과 수행능력 | 20

▫ 연구목표의 달성가능성, 연구종료 후 활용방안및 공공적 기대효과 | 10

가점

없음

평가표에 특허·신기술·수상·우수업체 선정·기술개발 투자·신규 고용 가점 항목이 없다.

• 가점 대상 · 없음 해당 가점 대상이 없다.
• 가점 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 가점이 없어 크기도 없다.

샘플·시안 선제출

없음

입찰·제안 단계에서 시안·샘플·견본·시연·성능시험을 요구하는 규정이 없다.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 관련 배점이 없다.
• 대상 · 없음 해당 대상이 없다.

무상 추가 제공

없음

무상 유지보수·사후지원 기간이나 과업 밖 추가 제공을 점수로 보거나 최소한을 요구하는 규정이 없다.

• 요구 기간 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 유지보수·사후지원 기간이 적혀 있지 않다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 관련 배점이 없다.
• 대상 · 없음 해당 대상이 없다.

평가 자리 발표

서면 평가만

제안서 평가는 서면심의를 통한 평가로 적혀 있고, 평가일시·장소는 수요기관이 별도 공지하되 별도 공지 없이 서면 평가할 수도 있다고 적혀 있다.

• 빠지면 · 해당 없음 발표가 없어 해당 없음.

- 선정방식: 서면심의를 통한 평가

제안서 평가는 수요기관에서 직접 평가위원을 구성하여 평가하며, 평가일시 및 장소는 수요기관에서 별도 공지할 예정입니다. 다만, 별도 공지 없이 서면 평가할 수도 있으니 평가관련 사항은 반드시 수요기관에 문의하시기 바랍니다.

차등점수제

아니다

차등점수제 적용 문구가 없고, 평가는 위원 점수의 최고·최저 제외 산술평균 방식이다.

• 순위 간 점수차 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 순위 간 점수차가 적혀 있지 않다.

카테고리 · 시험·분석·측정 8개

시험기관 인정

없음

참가자격은 학술연구용역(1169) 업종 등록과 중소기업·소상공인 확인서 소지뿐이며, KOLAS 인정·정도관리 검증서·인증기관 인정 요구가 없다.

측정·분석 대상

그 밖(짧은 글)

대상은 미진단 심근병증 환자 조직 시료(RNA)와 미진단 희귀질환(대사·면역·내분비 등) 혈장 시료로, Long-read RNA-seq(전사체)와 대규모 단백체 데이터를 생산·분석한다.

• 항목 변동 · 그렇다 발주부서가 협의 하에 분석 샘플 수 증가·교체 등 변경 가능

  ※ 필요시 사업수행 기간 중 발주부서에서 용역 수행기관과의 협의 하에 분석 샘플 수 증가, 교체 등 변경할 수 있음

○ 환자 조직 시료로부터 고품질의 RNA를 추출하고, 전사체 전장 분석을 위한 Long-read RNA-seq 데이터 생산 (30건 이상)

○ 미진단 희귀질환 환자 유래 혈장 검체를 대상으로 대규모 단백체 분석 플랫폼을 이용하여 단백질 프로파일링(5,300개 이상 단백질 마커 정보 포함) 데이터 생산 (70건 이상)

무상·저가 추가 일

의무 · 계약 뒤 지킬 일

생산된 데이터 분석·확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

• 대상 · 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공 필요시 관련 교육 제공

  - 생산된 데이터 분석, 확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

- 생산된 데이터 분석, 확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공)

채취 전 조건

지점·범위·일정 사전 협의·승인

시료 제공 및 고순도 RNA 추출 방법, PacBio 시퀀싱 세부 매뉴얼, 단백체 분석 기준·전처리 파이프라인 구성을 사전 협의하여 확정

- 발주부서는 수행기관에게 시료를 제공하고 고순도 RNA 추출 방법, PacBio 시퀀싱 세부 매뉴얼, 단백체 분석 기준 및 데이터 전처리 파이프라인 구성 등을 수행기관과 사전에 협의하여 확정함

분석 품질 보증

정도관리(QA/QC) 계획 제출·내부정도관리

3단계 정량·정성 정도관리, internal/external control 배치로 inter·intra-assay 재현성(CV) 평가, QC plots 이용 정도관리, 데이터 정규화·검증

- 실험을 수행하기 전 모든 시료에 대해 3단계 정량·정성적 정도관리를 통해 최소 품질을 만족하는 시료만 선별하며 실험을 진행

- Plate 분석과정에서 internal controls, external control 배치를 통해 inter 및 intra-assay의 재현성(CV) 평가를 통해 실험 품질 모니터링

- QC plots 등을 이용한 단백체 데이터 정도관리 및 기본 통계 분석 수행

일의 법적 성격

법정 틀 없이 발주처가 스스로 사는 일

미진단 희귀질환 원인 규명·정밀 진단·맞춤형 치료 전략 수립을 위한 과학적 근거 마련 목적의 연구용역

○ 본 사업은 기존 기술로 원인이 규명되지 않은 미진단 희귀질환을 대상으로 첨단 다중오믹스(Long-read 전사체 및 단백체) 데이터를 생산·분석하여 질병의 원인을 규명하고 정밀 진단 및 맞춤형 치료 전략 수립을 위한 과학적 근거를 마련하고자 함

보관 조건

의무 · 계약 뒤 지킬 일

데이터 생성 후 잔여 조직·추출물(RNA)·잔여 혈장은 전수 폐기(또는 발주부서 반환)

• 대상 · 기타 인체유래물(조직·RNA·혈장) 잔여분 폐기·반환

  - 데이터 생성 후 잔여 조직 및 추출물(RNA)은 전수 페기함(또는 발주부서 반환)

- 데이터 생성 후 잔여 조직 및 추출물(RNA)은 전수 페기함(또는 발주부서 반환)

- 데이터 생성 후 잔여 혈장은 전수 폐기(또는 발주부서 반환)

연구 윤리 승인

없음

입찰 전 IRB·IND·IACUC 승인을 마친 과제여야 참가할 수 있다는 요구가 없다.

문서 발췌

과업·요구

Ⅰ 사업 개요

1. 사 업 명 : 미진단 희귀질환 멀티오믹스 데이터 생산

2. 사업목적

○ 본 사업은 기존 기술로 원인이 규명되지 않은 미진단 희귀질환을 대상으로 첨단 다중오믹스(Long-read 전사체 및 단백체) 데이터를 생산·분석하여 질병의 원인을 규명하고 정밀 진단 및 맞춤형 치료 전략 수립을 위한 과학적 근거를 마련하고자 함 ※ 관련 연구과제: 다중오믹스 기반 희귀 유전성 심근병증 원인인자 발굴, 대사 및 면역이상 희귀질환 원인인자 발굴 및 병인 분석 연구 ○ 고도화된 다중오믹스 분석 파이프라인을 활용하여 신규 후보 유전자, 유력 후보 변이, 단백체 등 진단 바이오마커를 발굴하고, 발굴된 질병 원인인자 간의 분자 네트워크를 규명함

3. 사업기간 및 예산

○ (사업기간) 계약체결일로부터 ~ 2026년 12월 18일 ○ (사업예산) 140,000,000원 (VAT 포함)

4. 입찰방식

○ 입찰방식: 제한경쟁입찰, 협상에 의한 계약 ○ 협상에 의한 계약체결기준(계약예규)에 따라 제안서 서면평가 90%와 가격평가 10%의 비중으로 적용하여 종합평가 실시

5. 주요과업

○ 환자 조직 시료로부터 고품질의 RNA를 추출하고, 전사체 전장 분석을 위한 Long-read RNA-seq 데이터 생산 (30건 이상) ○ Iso-seq 기반으로 생산된 Long-read 데이터의 전사체 구조를 심층 분석하여, 기존 방식으로 찾기 어려웠던 신규 유전자 및 질환 연관 후보 변이 발굴, 유전자 발현 양상 및 통합 분석 수행 ○ 미진단 희귀질환 환자 유래 혈장 검체를 대상으로 대규모 단백체 분석 플랫폼을 이용하여 단백질 프로파일링(5,300개 이상 단백질 마커 정보 포함) 데이터 생산 (70건 이상) ○ 생산된 단백체 데이터에 대한 그룹간 단백체 발현 패턴 분석을 통해 차등 발현 단백질(Differentially Expressed Proteins, DEPs)을 발굴하고, 이들 단백질에 대한 KEGG enrichment, Gene ontology 분석 등을 통해 기능적 분석 수행 ○ 최종 결과물 제출

Ⅱ 사업 수행 범위

세부 과업내용

(1) 미진단 심근병증 환자 조직 시료 대상 PacBio Long-read RNA-seq 데이터 생산 및 분석 ① 시료 정도관리 - 수행기관은 사업수행을 위해 질병관리청 국립보건연구원 국립중앙인체자원은행 분양 또는 발주부서로부터 시료를 제공받음 - 실험을 수행하기 전 모든 시료에 대해 3단계 정량·정성적 정도관리를 통해 최소 품질을 만족하는 시료만 선별하며 실험을 진행 · RNA 농도 측정, 순도 확인, RNA 온전성 측정 등 - 최소 품질 불만족 및 성별 불일치 시료가 발생할 경우 국립중앙인체자원은행 또는 발주부서와 상의하여 시료 교환 및 재분양 등을 수행 - 데이터 생성 후 잔여 조직 및 추출물(RNA)은 전수 페기함(또는 발주부서 반환) ② PacBio Iso-Seq(Long-read RNA-seq) 기반 유전체 정보 생산 - 대상 시료 수: 30건 이상 - 전사체 전장 분석 전용 라이브러리 제작 · 시퀀싱 플랫폼: PacBio Revio · 데이터 생산량: 샘플당 최소 2,000만(20M) HiFi reads 이상 · 시퀀싱 원시 데이터의 Read length 분포, 에러율, Q-score 등 품질 평가를 수행하고 통과한 데이터만 선별

※ 상기 조건에 모든 샘플이 만족해야 함 ※ 필요시 사업수행 기간 중 발주부서에서 용역 수행기관과의 협의 하에 분석 샘플 수 증가, 교체 등 변경할 수 있음 ③ 생물정보학 기반 분석 - 인간 최신 표준 유전체(GRCh38) 기반 매핑 및 전사체 어셈블리 수행 - 유전자별 Full-lengh isoform 식별, 대체 스플라이싱(Alternative splicing) 탐색 및 이형질체 단위 발현량 정량화 - 전사체 수준의 구조적 변이 탐색 - 전사체 내 단일염기다형성(SNP) 및 삽입결실(Indel) 변이 발굴 - 발주부서에서 기확보된 동일 환자의 WGS 데이터 (short-read/ long-read seq)와 연계하여 통합 분석 수행 ④ 결과물 제출 - 결과보고서 작성 및 제출 - 원시데이터(FASTQ, BAM), 데이터 품질관리 결과, 분석 파이프라인 및 주요 파라미터, 전사체 및 isoform 구축 결과, 유전자·isoform 발현 분석, alternative splicing 분석 결과, 기존 유전체·전사체 데이터와의 통합 분석 결과 등 모든 실험·분석 결과와 잔여 시료 제출 (2) 미진단 희귀질환(대사, 면역, 내분비 등) 혈장 시료 대상 대규모 단백체 데이터 생산 및 분석

① 분석 대상 시료 분양 및 정도관리 - 분석 대상 시료 수: 혈장 70건 이상 - 수행기관은 사업수행을 위해 질병관리청 국립보건연구원 국립중앙인체자원은행 분양 또는 발주부서로부터 혈장 시료를 제공받음 - 실험을 수행하기 전 모든 시료에 대해 용혈, 지질혈증이 없는지 확인후 실험을 진행 - 데이터 생성 후 잔여 혈장은 전수 폐기(또는 발주부서 반환) ② 대규모 단백체 분석 플래폼을 이용한 단백체 데이터 생산 - 최소 5,300개 이상의 단백질 마커 정보를 포함하여 혈장 70건 이상에 대한 단백체 데이터 생산 ※ 발주부서와 협의하여 분석플랫폼 결정, 발주부서에서 수행기관에 분석 대상자(대조군, 희귀질환군 등) 및 시료 제공 ③ 단백체 데이터 정규화 및 품질관리 - Plate 분석과정에서 internal controls, external control 배치를 통해 inter 및 intra-assay의 재현성(CV) 평가를 통해 실험 품질 모니터링 ※ 두 개 이상 plate를 이용한 경우, batch effect를 고려하여 bridge sample 포함(전체 생산량에 미포함) ※ 데이터 생산 프로토콜 및 품질관리 모니터링 계획은 실험 수행 전 발주부서와 협의하여 결정 - 분석 플랫폼의 효율, QC 지표 및 plot을 확인 중앙값 기준, Plate 간 변동 보정 등을 통환 데이터 정규화 및 검증

④ 단백체 데이터 정도관리 및 분석 - QC plots 등을 이용한 단백체 데이터 정도관리 및 기본 통계 분석 수행 ※ Z-score box plot, Heatmap, MDS plot 등 이용 - 샘플 혹은 그룹에 따라 다르게 발현되는 차등 발현 단백질(DEPs) 비교 분석 - 차등 발현 단백질(DEPs)들을 대상으로 Gene-Enrichment, Functional Annotation, Protein-Protein Interaction을 확인할 수 있는 분석 tool을 사용하여 기능적 분석 수행 ※ Gene Ontology, KEGG Enrichment 분석, STRING 기반의 PPI 네트워크 분석 등 포함 ※ 기본통게분석, 기능적 분석 등 데이터 분석 계획은 분석수행 전 발주부서와 협의하여 결정 - 발주부서에서 기확보된 유전변이 데이터와 연계한 통합 분석 수행 - 생산된 데이터 분석, 확인을 위한 무료 분석 Tool 및 사용 매뉴얼 제공(필요시 관련 교육 제공) ⑤ 결과물 제출 - 전체 분석 결과에 대한 통합보고서 작성 및 제출 - 단백체 데이터 원천 정보(raw data 파일), QC 정보, 가공 정보(QC된 데이터, 분석에 바로 활용할 수 있는 형식의 데이터 등), 관련 시각화 자료(분석결과 이미지 등) 등 일체 제공 - DEP 분석결과 및 기능적 분석 수행 결과(시각화 결과 포함) 제공

2. 추진체계 ① 발주기관(유전체연구기술개발과) - 수행기관은 국립중앙인체자원 또는 발주부서로부터 유전체정보 생산을 위한 시료를 제공받아 수행함 - 발주부서는 수행기관에게 시료를 제공하고 고순도 RNA 추출 방법, PacBio 시퀀싱 세부 매뉴얼, 단백체 분석 기준 및 데이터 전처리 파이프라인 구성 등을 수행기관과 사전에 협의하여 확정함 ② 용역 수행기관 - 사업 착수 보고 회의를 실시하고, 발주기관으로부터 제공받은 시료를 수령하여 엄격 정도 관리를 수행함 - 시료를 이용하여 고품질 RNA 추출, 라이브러리 제작, PacBio 시퀀싱 및 대규모 단백체 데이터를 생산함 - 생성된 다중오믹스 데이터를 바탕으로 기초 데이터 전처리, 정규화 및 통계 분석, 분자 네트워크 기능 및 경로 분석 과업을 수행함 - 수행기관은 전처리 완료된 산출물(BAM, GTF, 발현량 Matrix 등) 일체와 원시 데이터 및 최종 결과 보고서를 발주기관에 납품함

3. 과업 수행 요구사항

○ 사업수행 관련 업무 협의 및 최종결과보고서 제출 ○ 사업수행에 필요한 전반적인 추진 상황은 발주부서와 사전 논의하여 진행할 것 ○ 계약 전 발주부서 요구에 따라 사업 수행 관련 실험 장비, 인력 등 관련 증빙자료를 제출 및 검토 받아야함

2) 보고서 등 제출

○ 용역사업에 의해 생산된 모든 결과물에 대해 보고서로 작성하여 제출함 ○ 결과 완료 및 검수 후 용역 시 사용하고 남은 시료는 폐기 후 폐기확인서 제출 ○ 제출 시기는 용역 마감일에 제출하되, 필요시 발주부서와 용역 수행 업체 간 협의하에 조정이 가능함

Ⅲ 참가자격 및 계약 방법

1. 참가자격 조건(아래 조건을 동시에 충족할 것)

○ 「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령」제12조 및 동법 시행규칙 제14조의 규정에 의한 유자격자로서 동법 시행령 제76조에 해당하지 않으며 견적서 제출 마감일 전일까지 국가종합전자조달시스템에 학술연구용역[업종코드:1169] 으로 입찰참가 등록한 업체 ○ 「중소기업기본법」 제2조에 따른 중소기업과 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 ‘중·소기업·소상공인 확인서(입찰참가자격등록마감일까지 발급된 것으로 유효기간 내에 있어야 함)’를 소지한 자 ○ 중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령 제2조의3제2호에 따라 비영리법인은 중·소기업ㆍ소상공인확인서가 없어도 입찰에 참가 가능 ○ 공동수급 및 하도급 - 본 용역은 공동계약 및 공동수급을 허용하지 않음 - 수행기관은 본 과업의 전부 또는 일부를 제3자에게 하도급하거나 재위탁할 수 없음

참가자격

○ 각 평가위원의 평가점수 중 최고점수와 최저점수를 제외한 나머지 점수를 산술평균 하며, 기술능력평가 분야 배점한도의 85% 이상인 자를 협상적격자로 선정 ○ 기술능력평가(90%)와 가격평가(10%)를 실시하고, 합산점수의 고득점 순에 따라 순차적으로 본 사업에 가장 유리하다고 인정되는 자를 우선 협상대상자로 선정하여 협상 ○ 종합평가 결과 동점을 얻은 업체가 2개 이상일 경우에는 기술능력 평가점수가 높은 제안자를 선순위자로 하고, 기술능력 평가점수도 동일한 경우에는 기술능력의 세부평가항목 중 배점이 큰 항목에서 높은 점수를 얻은 자를 우선순위자로 함 ○ 선정결과는 서면으로 통보하며, 미 선정업체에 대한 통보는 생략

Ⅵ 평가방법 및 기준

1. 제안서(기술)평가

○ 제안서 평가 - 선정방식: 서면심의를 통한 평가 - 평가주체: 유전체연구기술개발과(수요부서) ○ 평가항목 및 배점 (90점)

배점·평가

과업·요구