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[일반용역](견적공고)SFTSV 감염 부위의 공간 전사체 분석을 통한 초기 숙주-바이러스 상호작용 규명

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공고 개요

유찰 · 질병관리청 국립보건연구원 · 실험실 분석

결과
유찰
참가
0곳 · 개찰 09/18(금)

요약 AI 요약

중증열성혈소판감소증후군 바이러스(SFTSV) 감염 마우스 조직의 공간전사체 분석을 통해, 초기 감염 시 숙주 면역 반응과 바이러스 간의 상호작용을 규명하기 위한 기초자료를 확보하는 사업입니다.

사업 내용 · 이 공고에 든 일

중심 · 공간전사체 실험·시퀀싱 및 생물정보학 분석

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

SFTSV 감염 마우스 조직의 QC·절편·H&E·이미징·라이브러리 제작·NGS 시퀀싱과 공간전사체 생물정보학 분석을 일괄 수행하는 실험실 분석 용역이다.

참가 자격 · 제한

업종제한
학술.연구용역(1169) 그리고 유전자검사기관(5331) 또는 학술.연구용역(1169) 그리고 데이터분석제공사업자(6539)
지역제한
제한 없음
공동수급
공동수급불허
입찰참가 제한
없음
실적경쟁 · PQ
해당 없음
국제입찰
국내입찰
제출 방법
전자입찰

입찰 일정

진행일시남은 날
공고 게시09/14(월)지남
입찰서 제출 시작09/15(화) 10:00지남
입찰참가자격 등록 마감09/17(목) 18:00지남
입찰서 제출 마감09/18(금) 10:00지남
개찰09/18(금) 11:00지남

가격

추정가격
44,700,000원
배정예산
49,170,000원
기초금액
49,170,000원 (예비가격 -2% ~ +2%)
낙찰하한율
88%
예정가격 방식
복수예가

공고 정보

공고종류
등록공고 (일반공고)
게시일
09/14(월)
공고번호
R26BK01729113-000
참조번호
국립보건연구원 공고 제2026-451호
공고기관
질병관리청 국립보건연구원
수요기관
질병관리청 국립보건연구원
계약방법
수의계약
낙찰방법
소액수의견적
계약유형
총액계약
예정가격 방식
복수예가
추정가격
44,700,000원
배정예산
49,170,000원
공공조달분류
연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 보건복지연구조사서비스
사전규격번호
-
재공고
아니오
출처
나라장터

문서 발췌

과업·요구

구 분담당 업무 및 기능
국립보건연구원
신종바이러스연구센터
(급성바이러스연구과)		○시료제공
‐ SFTSV 감염 마우스 조직(근육) 조직 검체
‐ SFTSV 타깃 probe 제공
○사업 진도 관리 및 결과보고서 확인
‐ 착수회의 및 월별 진행 상황 점검
‐ 최종 공간전사체 데이터 및 결과보고서 검토 및 승인
과업 수행기관○공간전사체 플랫폼 기반 실험 수행
‐ 제공 조직의 품질 검증(QC)
‐ FFPE 제작 및 조직 절편화, 슬라이드 부착 및 H&E 염색
‐ 고해상도 brightfied 또는 형광 현미경 이미징
‐ 공간전사체 시퀀싱 라이브러리 제작 및 NGS 시퀀싱
○생물정보학 기반 데이터 분석
‐ 공간 바코드 mapping, 스팟별 전사체 정량화 및 SFTSV RNA 검출 및 mappin
‐ 조직 미세환경 내 감염 스팟 및 인접 비감염 스팟 클러스터링(spatial clustering)
‐ 초기 숙주 면역반응 유전자 공간적 발현(DEG) 분석
‐ 바이러스-숙주 상호작용 신호전달경로(Pathway/GSEA) 및 세포 간 상호작용(Cell-cell communication) 분석
○ 최종 결과보고서 제출
‐ 데이터 QC 보고서, 분석 결과 포함 최종보고서 작성 및 제출

4. 사업내용 가. 목적 및 필요성 ⃝ 중증열성혈소판감소증후군(Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome, SFTS) 감염병 대응을 위해 내부연구과제 ⌜중증열성혈소판감소증후군 바이러스-숙주 상호작용 규명을 통한 항바이러스 타깃 발굴⌟를 추진하고 있음. ⃝ SFTSV는 감염 초기 근육, 비장, 간 등 주요 림프구 및 실질 장기 미세환경을 급격히 파괴하고 사이토카인 폭풍(Cytokine storm)을 유발하나, 기존 Bulk RNA 시퀀싱 방식은 감염 미세환경의 공간적 이질성과 바이러스 직접 침투 세포 주변의 숙주 면역 반응을 국소적으로 분리·규명하는 데 한계가 있음. ⃝ SFTSV 감염 부위 마우스 근육 조직에서 면역 반응의 변화를 이해하고, 세포 간 상호작용 및 공간적 특성을 파악하여 바이러스-숙주 상호작용을 규명할 필요가 있음. ⃝ 이에 SFTSV 감염부위 조직에 대한 공간전사체 분석을 통해 감염 시간에 따른 조직 내 유전자 발현의 공간적 변화와 세포면역 미세환경의 특성을 분석하고, SFTSV 초기 감염 및 병인에 관여하는 주요 숙주 반응과 바이러스-숙주 상호작용을 규명하기 위한 기초자료 확보하고자 함. 나. 과업 내용 ⃝ 시료 제공(발주부서) - 비감염과 SFTSV 감염 야생형(wild-type) 마우스(C57BL/6J) 대퇴부 근육 조직(3개) - 비감염과 SFTSV 감염 인터페론 1형 수용체 결핍 마우스(Ifnar KO) 대퇴부 근육 조직(3개) - SFTSV 타깃 probe 제공 ⃝ 조직 QC 및 슬라이드 제작 (과업수행기관) - 제공 조직의 형태 보존성 및 RNA 온전성 평가 - 공간전사체 전용 캡처 슬라이드 규격에 맞춘 초정밀 조직 절편 및 슬라이드 배치 - 조직 형태학적 분석을 위한 H&E 염색 - 고해상도 현미경 이미징(Fiducial Frame 정합) ⃝ 공간전사체 라이브러리 제작 및 시퀀싱 (과업수행기관) - 조직 투과화(Permeabilization) 최적화 조건 수립 및 공간 바코드 프로브 혼성화/역전사 수행 - Spatial Transcriptome 라이브러리 구축 및 QC(Bioanalyzer/TapeStation 검증) - 10x Genomics사의 Visium CytAssist 장비 및 Visium HD WT Panel(또는 동등 이상의 공간전사체 플랫폼)을 이용하여 공간전사체 분석 ⃝ SFTSV 매핑 및 숙주–바이러스 상호작용 생물정보학(BI) 분석 (과업수행기관) - 10x Genomics Space Ranger를 이용한 원시 데이터(FASTQ) 처리 및 품질관리

- 공간 이미지 좌표와 전사체 시퀀싱 데이터의 정렬(Image-to-transcriptome alignment) 마우스 숙주 표준 유전체(mm10/GRCm39) 및 SFTSV 게놈 동시 정렬을 통한 조직 내 바이러스 전사체 공간 분포도 작성 - 세포 유형별 표지 유전자(marker gene)를 기반으로 한 세포 유형 분류(Cell type annotation) - 바이러스 고발현 스팟, 인접 전파 스팟, 원거리 비감염 스팟 간의 차등 발현 유전자(DEG) 발현 패턴 비교 - 초기 선천면역 반응(Type I/III IFN, ISG 반응), 염증성 사이토카인/케모카인 경로 및 세포 사멸 경로의 공간적 활성화 분석 - 공간적 세포 간 상호작용(Spatial ligand-receptor interaction) 및 미세환경 면역세포 침윤 양상 디컨볼루션(Deconvolution) 분석 ⃝ 최종 종합 분석보고서 작성 및 데이터화 (과업수행기관) - 각 조직 절편의 고배율 H&E 영상과 유전자 발현 맵의 오버레이 시각화(Spatial feature plots) - 군별 바이러스 RNA 카피 수 및 숙주 면역반응 상관성 정량 그래프 첨부 - 전체 원시 데이터(Raw Fastq), 가공 행렬(Count Matrix, Seurat/Spatial object), 인터랙티브 시각화 파일(Loupe browser 파일 등) 제작 및 제출 - 연구자가 직접 결과 데이터를 분석할 수 있는 공간전사체 분석 툴(C-DIAM) 제공 다. 추진체계 ⃝ 발주부서 (급성바이러스연구과) - 감염 동물 조직 검체 제공 및 실험 목적에 부합하는 공간 분석 타깃 영역 협의 - 각 단계별(조직 QC, 라이브러리 제작, 1차 데이터 파이프라인 분석) 진행 상황 점검 및 검수 ⃝ 과업수행기관 - 조직 QC, 절편 제작, 공간전사체 실험 및 NGS 시퀀싱 일괄 수행 - 전문 생물정보학 인력을 통한 SFTSV 특이적 감염 미세환경 심층 분석 - Raw 시퀀싱 데이터, 처리 데이터 및 최종 결과보고서 작성·제출 - 분석 결과물 해석 및 보고서 작성을 위한 발주부서와의 긴밀한 사전 협의 라. 과제수행 시 요구사항 ⃝ 공간전사체(Spatial Transcriptomics) 플랫폼 장비(10x Genomics Visium CytAssist 또는 동등 이상의 공간전사체 플랫폼) 및 초정밀 조직 동결/박절기, NGS 시퀀서 등 필수 연구 시설 및 전문분석 인력을 보유하고 바이러스성 감염 조직 또는 감염병 모델 조직에 대한 전사체/공간유전체 분석 경험이 있어야 함.

* 발주부서 요청 시 해당 장비 보유 증명원 또는 플랫폼 인증서, 분석 실적 증빙을 제출할 수 있어야 함. ⃝ 계약된 용역 업체가 직접 수행해야 함. (하도급 불가) ⃝ 사업 수행에 필요한 전반적인 추진 및 변경사항 발생 시 발주부서와 사전 협의 후 진행하여야 함. ⃝ 조직 시료 수령 즉시 RNA 품질 테스트를 수행하고, 품질 기준 미달 시 발주부서에 즉시 보고 및 대응 방안 협의하여야 함. ⃝ 시퀀싱 데이터는 Q30 ≥ 80% 이상의 고품질 데이터를 확보하여야 하며, 데이터 오류 또는 불량 발생 시 재시퀀싱을 무상으로 수행해야 함. ⃝ 최종 결과보고서에는 발주부서가 요청하는 상세 공간 시각화 맵, 바이러스-숙주 상호작용 네트워크, 주요 면역 타깃 유전자 발현 정량 분석을 포함해야 하며, 원본 데이터(Raw FASTQ, Matrix, 클러스터링 오브젝트)와 함께 전자파일(한글 및 PDF)로 별도 제출함. ⃝ 연구자가 직접 결과 데이터의 QC, clustering, 세포 타입 예측(cell type prediction), 조직내 유전자 발현차 분석(differential expression analysis), 마커 유전자 탐색(marker gene identification) 등을 분석할 수 있는 공간전사체 분석 툴(C-DIAM)을 제공해야 함. 5. 사업관리 가. 추진일정

내용기간(개월)비고
내용1234비고
조직 QC 및 절편 슬라이드 안착
H&E 염색, 이미징 및 공간전사체 라이브러리 구축
NGS 염기서열 분석
SFTSV-숙주 공간 mapping, 및 생물정보학 기반 데이터 분석
최종결과보고서 작성 및 산출물(데이터) 제출

* 추진 일정은 실험 상황에 따라 발주부서와 수행기관의 협의 하에 변경될 수 있음. 나. 보고서 등 제출 ⃝ 최종 결과 산출물 - 최종결과보고서(전자파일) 제출 • 조직 형태학적 이미지(H&E) 및 공간전사체 고해상도 오버레이 이미지 • SFTSV 발현 국소부위 식별 및 비감염 부위 간 발현 차이(DEG) 분석 결과 • 초기 면역반응(인터페론 경로, 사이토카인 폭풍 메커니즘 등) 공간 경로 분석(GSEA, Pathway) 그래프 및 표 - Raw 데이터(USB/외장하드) 제출 • NGS 원시 데이터 (Raw FASTQ 파일) • 유전자 발현 매트릭스 (Filtered Count Matrix) 및 바코드 공간 좌표 데이터 • R/Python 분석 오브젝트 (Seurat / Scanpy / Spatial Experiment RDS 파일) • 인터랙티브 분석 파일 - 분석 후 남은 시료 제출 ⃝ 공간전사체 분석 툴(예시: C-DIAM) 제공 - 데이터의 QC, clustering, 세포 타입 예측(cell type prediction), 조직내 유전자 발현차 분석(differential expression analysis), 마커 유전자 탐색(marker gene identification) 등 분석 가능 6. 입찰참가자격 ⃝ 계약방법: 소액수의(견적)총액계약 ⃝ 참가자격: 「국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정」에 따라 입찰(개찰)일 전일까지 나라장터에 학술연구용역[업종코드: 1169]와 유전자검사기관(업종코드: 5331), 또는 학술연구용역[업종코드 1169]와 데이터분석제공업자(업종코드: 6539)으로 입찰 참가 등록한 자 ⃝ 제시된 과업(공간전사체 실험 및 고난도 생물정보학 바이러스-숙주 상호작용 분석)을 단독으로 수행이 가능한 사업자(공동수급 및 하도급 불가) ⃝ 「중소기업기본법」제2조에 따른 소기업자 및「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」제2조에 따른 소상공인으로서「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 <소기업·소상공인 확인서>를 소지한 자 === [견적공고문]공고 제2026-451호_SFTSV 감염 부위의 공간전사체 분석을 통한 초기 숙주-바이러스 상호작용 규명.hwpx ===

1. 입찰개요 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 수 요 기 관: 질병관리청 국립보건연구원 입 찰 건 명: [일반용역] SFTSV 감염 부위의 공간전사체 분석을 통한 초기 숙주-바이러스 상호작용 규명 수 요 부 서: 국립보건연구원 급성바이러스연구과 계 약 방 법: 수의(총액)소액수의 구 분: 일반용역 기 초 금 액: 금 49,170,000원(부가세포함) 입 찰 방 법: 소액수의(총액)-견적입찰 용 역 기 한: 계약체결일부터 2026. 12. 31. 기 타 사 항: 제시된 과업을 단독 수행 가능한 자(공동수급 불가 및 하도급 불가) [첨부]과업지시서(입찰참가자격) 확인 본 건은 (계약예규) 정부 입찰·계약 집행기준 제 10조의2에 의거하여 결격여부를 판단하며, 과업이행능력 여부를 확인합니다. 낙찰 예정자는 계약 체결 전 과업지시서에 명시된 과업 수행에 필요한 증빙서류를 제출하여야 하며, 미제출 또는 결격사유 확인 시 계약상대자 결정에서 제외될 수 있습니다. 과업지시서 미숙지로 인한 계약 포기 시 귀책 사유가 업체에 있으니 유의하시기 바랍니다. 2. 입찰(개찰) 일시 및 장소 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 입찰(개찰)일시: 2026. 9. 18. 11:00 견적서(전자입찰서)접수개시일자: 2026. 9. 15. 10:00 견적서(전자입찰서)마감일시: 2026. 9. 18. 10:00 견적서제출방식: 전자견적서 제출 개찰장소: 질병관리청 국립보건연구원 계약담당공무원 PC

참가자격

1) 다음 자격을 모두 갖춘 자이어야 합니다. ①「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령」 제12조(경쟁입찰의 참가자격) 및 동법시행규칙 제14조(입찰 참가자격 요건의 증명)의 규정에 의한 유자격자로서 동법시행령 제76조(부정당업자의 입찰참가자격 제한)에 해당하지 않으며, 국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정에 따라 반드시 전자입찰서 제출마감일 전일까지 전자조달시스템에 ‘학술연구용역[업종코드: 1169]와 유전자검사기관[업종코드: 5331] 소지자’ 또는 ‘학술연구용역[업종코드 1169]와 데이터분석제공업자[업종코드: 6539]소지자’로 입찰 참가 등록한 자 ② 「중소기업기본법」 제2조에 따른 소기업과 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 ‘소기업·소상공인 확인서(입찰참가자격등록마감일까지 발급된 것으로 유효기간 내에 있어야 함)’를 소지한 자 - 중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령 제2조의3제2호에 따라 비영리법인은 소기업ㆍ소상공인확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있습니다. 1) 아래 각호에 어느 하나에 해당하는 경우에는 위 입찰참가자격을 모두 갖춘 경우에도 동 입찰에 참여할 수 없습니다. ① 「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령」 제12조(경쟁입찰의 참가자격) 및 동법 시행규칙 제14조의 규정에 의한 유자격자로서 동법 시행령 제76조에 해당하지 않으며

과업·요구

연번목록단가(원)수량금 액(원)
1Spatial transcriptomics (10x visiumHD
6.5mm, raw data)		3
2Standard analysis6
3Advanced analysis_cell type annotation1
4Advanced analysis_DEG & functional analysis4
소 계
부가세
합 계 (부가세 포함)

□ 일반용역 : SFTSV 감염 부위의 공간전사체 분석을 통한 초기 숙주-바이러스 상호작용 규명