[일반용역](협상)백신 접종자 단일세포 전사체 데이터 및 세포성 면역반응 분석

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공고 개요

유찰 · 질병관리청 국립보건연구원 · 실험실 분석

결과

유찰

참가

0곳 · 개찰 09/29(화)

요약 AI 요약

코로나19·인플루엔자 백신 접종자의 단일세포 전사체 데이터를 재분석하고, 접종 전후 검체로 ICS 시험을 수행해 세포성 면역반응을 분석하는 사업이다. 기존 항체분석 결과와 연계해 반복접종·백신 플랫폼 이력에 따른 면역세포·전사체 특성과 IgG4 증가 양상의 연관성을 규명하는 표준화된 결과자료를 산출한다.

• LP.8.1 및 계절인플루엔자 백신 접종자 접종 전·후 검체 총 80건에 대해 IFN-γ, IL-2, TNF-α 등 사이토카인 발현 기반 CD4+·CD8+ T세포 기능적 면역반응(ICS) 분석
• LP.8.1 및 계절인플루엔자 백신 접종자 검체 중 32건 단일세포 전사체 분석 및 결과 해석, 기존 코로나19 백신 접종자 단일세포 전사체 데이터 45건 재분석
• 10x Genomics single-cell gene expression 데이터 QC, normalization, dimensionality reduction, clustering, cell type annotation 수행
• 주요 면역세포 subtype별 차등발현유전자(DEG)·pathway 분석, IFN·NF-κB 관련 경로 및 interferon-stimulated gene 발현 특성 분석
• 세포 간 상호작용(cell-cell interaction) 및 주요 면역세포 활성화 특성 분석, ICS 사이토카인 반응과 단일세포 전사체 결과 간 연관성 분석
• 반복접종 전·후 및 백신 접종이력에 따른 면역세포 구성·전사체 특성 비교, QC 결과·figure·table·원본/가공 데이터·최종 종결보고서 등 산출물 제출

사업 내용 · 이 공고에 든 일

중심 · 단일세포 전사체 데이터 분석

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

10x Genomics scRNA-seq 데이터 QC·정규화·클러스터링·DEG·pathway·cell-cell interaction 등 실험실 수준의 전사체 데이터 분석을 수행하는 일로, 시퀀싱·검체 분석을 대행하는 실험실 분석에 해당한다.

• 기존 코로나19 백신 접종자 단일세포 전사체 데이터 45건 재분석
• LP.8.1·인플루엔자 백신 접종자 검체 32건 단일세포 전사체 분석 및 결과 해석
• 데이터 QC, normalization, dimensionality reduction, clustering, cell type annotation
• 주요 면역세포 subtype별 DEG·pathway enrichment·cell-cell interaction 심화 분석
• IFN·NF-κB 경로 및 interferon-stimulated gene 발현 특성 분석
• 분석 parameter·방법 협의 및 figure·table·원본/가공 데이터 산출
• 월별 수행 점검회의 및 종결보고서 작성

중심 · ICS 세포성 면역반응 분석

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

백신 접종 전·후 검체 80건에 대해 IFN-γ·IL-2·TNF-α 사이토카인 발현 기반 CD4+/CD8+ T세포 기능적 면역반응을 분석하는 실험실 검체 분석 업무다.

• 접종 전·후 시점별 CD4+·CD8+ T세포 발현 비교
• ICS 분석 raw data 및 통계분석 결과 산출
• ICS 기반 사이토카인 반응과 단일세포 전사체 결과 간 연관성 분석
• 반복접종·백신 접종이력에 따른 면역세포 구성 및 전사체 특성 비교

평가 · 배점

기술 : 가격 — 기술 80점 · 가격 20점

협상 대상 기준 · 기술능력평가 결과점수가 배점한도의 85% 이상인 자를 협상적격자로 선정

참가 자격 · 제한

업종제한

학술.연구용역(1169) 그리고 기타자유업종(9999)

지역제한

제한 없음

공동수급

공동수급불허

입찰참가 제한

없음

실적경쟁 · PQ

해당 없음

국제입찰

국내입찰

제출 방법

전자입찰

입찰 일정

가격

추정가격

72,727,273원

배정예산

80,000,000원

예정가격 방식

비예가

공고 정보

공고종류

등록공고 (일반공고)

게시일

09/17(목)

공고번호

R26BK01734965-000

참조번호

국립보건연구원 공고 제2026-461호

공고기관

질병관리청 국립보건연구원

수요기관

질병관리청 국립보건연구원

계약방법

제한경쟁

낙찰방법

협상에의한계약

계약유형

총액계약

예정가격 방식

비예가

추정가격

72,727,273원

배정예산

80,000,000원

공공조달분류

연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 보건복지연구조사서비스

사전규격번호

R26BD00273724

재공고

아니오

출처

나라장터

문서 발췌

과업·요구

5. 수행내용 및 추진방법 ❍ 백신 접종자 ICS 분석 - LP.8.1 백신 및 계절인플루엔자 백신 접종자의 접종 전·후 시점 검체 총 80건에 대해 IFN-γ, IL-2, TNF-α 등 사이토카인 발현을 기반으로 CD4+ 및 CD8+ T세포의 기능적 면역반응 분석 ❍ 단일세포 전사체 데이터 분석 - LP.8.1 백신 및 계절인플루엔자 백신 접종자 검체 중 32건에 대한 단일세포 전사체 분석 및 결과 해석 - 기존 코로나19 백신 접종자에서 확보된 단일세포 전사체 데이터 45건 분석 ❍ 분석결과 정리 및 산출물 제공 - 접종 전·후 시점별 CD4+ 및 CD8+ T세포 발현 및 전사체 변화 비교 결과 - 주요 면역세포 subtype별 차등발현유전자(DEG) 및 관련 pathway 분석 - IFN 및 NF-κB 관련 경로와 interferon-stimulated gene 발현 특성 분석 - 세포 간 상호작용(cell-cell interaction) 및 주요 면역세포 활성화 특성 분석 - ICS 기반 사이토카인 반응과 단일세포 전사체 결과 간 연관성 분석 - 반복접종 전·후 및 백신 접종이력에 따른 면역세포 구성 및 전사체 특성 비교 ❍ 10x Genomics single-cell gene expression 데이터를 대상으로 적절한 분석 프로그램을 활용하여 데이터 QC, normalization, dimensionality reduction, clustering 및 cell type annotation을 수행 ❍ 면역세포별 세포 구성 변화, 차등발현유전자(DEG), pathway enrichment, cell-cell interaction 등 백신 접종 전·후 면역반응을 규명하기 위한 심화 분석을 수행 ❍ 분석방법 및 세부 parameter는 데이터 특성에 따라 발주부서와 협의하여 결정 필요

6. 추진일정 7. 제출자료 ❍ 최종 산출물은 다음 사항을 포함하여 제출 필요 - scRNA-seq 데이터 QC 결과 - cell type annotation 및 세포 구성 분석 결과 - 주요 비교군별 DEG 및 pathway 분석 결과 - cell-cell interaction 등 심화 분석 결과 - ICS 분석 raw data 및 통계분석 결과 - 분석에 사용된 주요 parameter 및 분석방법 - 논문·보고서 작성에 활용 가능한 figure 및 table - 분석 결과 원본 및 가공 데이터 - 최종 종결보고서 8. 연구결과에 대한 기대효과 및 활용계획 ❍ 백신접종 후 면역 특성 규명을 위한 자료로 사용할 계획이며, 연구결과는 신·변종 바이러스에 대한 백신개발 및 임상연구시 과학적 근거로 활용 예정 【제안요청서】 백신 접종자 단일세포 전사체 데이터 및 세포성 면역반응 분석 2026. 9. 질병관리청 국립보건연구원 국립감염병연구소 공공백신개발·지원센터 백신임상연구과

Ⅰ 사업개요

❍ 사 업 명: 백신 접종자 단일세포 전사체 데이터 및 세포성 면역반응 분석 ❍ 사업기간: 계약체결일로부터 2026년 12월 20일까지 ❍ 사업예산: 80,000,000원(부가가치세 포함) * 면세기관의 경우 부가가치세 포함하여 투찰, 사업선정 시 부가세 차감 계약 ❍ 계약방법: 제한경쟁 및 협상에 의한 계약 체결 ❍ 사업자 선정방식: 제안서 서면평가

Ⅱ 배경 및 목표

❍ 국립보건연구원 백신임상연구과는 코로나19 및 인플루엔자 백신 접종자를 대상으로 항체반응, 세포성 면역반응 및 단일세포 전사체 분석 등을 통해 백신 접종 후 면역 특성을 연구 중임 ❍ 이에, 기존 코로나19 백신 접종자에서 확보된 단일세포 전사체 데이터에 대한 전문적인 재분석과 함께, 접종 전, 후 검체을 활용한 ICS 시험 수행을 통해 세포성 면역반응 결과 확보가 필요함 ❍ 또한, 기존 확보한 항체분석 결과 등과 연계하여 반복 접종 및 백신 플랫폼 이력에 따른 면역세포·전사체 특성과 IgG4 증가 양상과의 연관성을 분석하고자 함 ❍ (목표) 기존 단일세포 전사체 데이터의 재분석과 접종자 검체 활용 ICS 시험 및 분석을 수행하고, 관련 면역반응 자료를 연계한 표준화된 결과자료를 산출하고자 함

Ⅲ 제안(과업) 내용

LP.8.1 및 계절인플루엔자 백신 접종 후 유도된 면역반응을 단일세포 전사체 및 세포면역 분석을 통해 기능적 면역반응 분석 결과 제공 ❍ 백신 접종자 ICS 분석 - LP.8.1 백신 및 계절인플루엔자 백신 접종자의 접종 전·후 시점 검체 총 80건에 대해 IFN-γ, IL-2, TNF-α 등 사이토카인 발현을 기반으로 CD4+ 및 CD8+ T세포의 기능적 면역반응 분석 ❍ 단일세포 전사체 데이터 재분석 - LP.8.1 백신 및 계절인플루엔자 백신 접종자 검체 중 32건에 대한 단일세포 전사체 분석 및 결과 해석 - 기존 코로나19 백신 접종자에서 확보된 단일세포 전사체 데이터 45건 재분석 ❍ 분석결과 정리 및 산출물 제공 - 접종 전·후 시점별 CD4+ 및 CD8+ T세포 발현 및 전사체 변화 비교 결과 - 주요 면역세포 subtype별 차등발현유전자(DEG) 및 관련 pathway 분석 - IFN 및 NF-κB 관련 경로와 interferon-stimulated gene 발현 특성 분석 - 세포 간 상호작용(cell-cell interaction) 및 주요 면역세포 활성화 특성 분석 - ICS 기반 사이토카인 반응과 단일세포 전사체 결과 간 연관성 분석 - 반복접종 전·후 및 백신 접종이력에 따른 면역세포 구성 및 전사체 특성 비교

Ⅴ 과업수행 시 요구사항

❍ 10x Genomics single-cell gene expression 데이터를 대상으로 적절한 분석 프로그램을 활용하여 데이터 QC, normalization, dimensionality reduction, clustering 및 cell type annotation을 수행 ❍ 면역세포별 세포 구성 변화, 차등발현유전자(DEG), pathway enrichment, cell-cell interaction 등 백신 접종 전·후 면역반응을 규명하기 위한 심화 분석을 수행 ❍ 분석방법 및 세부 parameter는 데이터 특성에 따라 발주부서와 협의하여 결정 ❍ 최종 산출물은 다음 사항을 포함하여 제출 필요 - scRNA-seq 데이터 QC 결과 - cell type annotation 및 세포 구성 분석 결과 - 주요 비교군별 DEG 및 pathway 분석 결과 - cell-cell interaction 등 심화 분석 결과 - ICS 분석 raw data 및 통계분석 결과 - 분석에 사용된 주요 parameter 및 분석방법 - 논문·보고서 작성에 활용 가능한 figure 및 table - 분석 결과 원본 및 가공 데이터 - 최종 종결보고서 ❍ 데이터 인수·인계 시 인수인계서 제출 ❍ 실험 데이터의 면역학적 분석 방향을 발주부서와 논의하여 고품질의 데이터 분석결과를 확보 ❍ 산출된 raw data 및 최종 분석 결과 일체를 USB 또는 외장하드로 전달 ❍ 기타 예외 사항에 대해서는 선정업체와 연구기관 사이에 긴밀한 상호협의 하에 결정 ❍ 월별 용역 수행 점검회의 개최

Ⅵ 추진일정

❍ 용역사업 입찰공고* 및 계약체결: 2026. 9. ~ 계약일 * 입찰공고: 10일 ❍ 용역 수행 시작: 계약일로부터 7일 이내 ❍ 용역 최종 보고서 제출: 계약종결일 이전 7일 이내

참가자격

❍ 용역 수행 일정

Ⅶ 제안안내 사항

󰊱 사업자선정 □ 제안자격 ❍ 본 사업의 수행이 가능한 법인, 비영리 등의 기관으로 아래의 요건을 충족하는 기관 - 전자입찰서 입찰(개찰)일 전일까지 국가종합전자조달시스템(나라장터)에 연구용역(업종코드: 1169) 기타자유업(업종코드: 9999) 으로 입찰참가자격을 등록한 기관 - 제시된 과업을 단독으로 수행이 가능한 사업자(공동수급, 하도급 불가) - 「중소기업기본법」 제2조에 따른 「소기업 또는 소상공인보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 소기업·소상공인확인서(전자입찰서 제출 마감일 전일까지 발급된 것으로 유효기간 내야 있어야 함)를 소지한자 - 중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령 제2조의3제2호에 따라 비영리법인은 소기업·소상공인확인서가 없어도 입찰에 참가 가능함 - 국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령 제 12조(경쟁입찰의 참가 자격)에 해당하고, 동법시행령 제76조(부정당업자의 입찰참가자격 제한)에 저촉되지 않은 경쟁입찰 참가조건을 구비한 자 □ 계약조건 ❍ 국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령 제43조에 의한 「협상에 의한 계약체결」 ※ 공동계약(공동이행 또는 분담이행) 불가 □ 낙찰자 선정절차 ❍ (절차) 낙찰자 선정을 위해 입찰공고하여 제안서에 대한 가격 및 기술평가(가격평가 포함)를 실시하고, 종합점수 상위 기관부터 순차적으로 협상하여 본 사업에 가장 적합하다고 인정되는 기관을 사업자로 선정

배점·평가

□ 평가 기준 및 배점 ❍ 평가방법: 기술과 가격에 대한 종합평가(배점: 기술 80%, 가격 20%) ❍ 평가주체: 자체평가(공공백신개발지원센터 백신임상연구과) ❍ 입찰가격 평가 - (계약예규) 협상에 의한 계약체결기준*에 따라 협상적격자 및 협상순위 선정 * 재정경제부예규 제40호(2026.1.2.) ❍ 기술능력평가 - 제안사항을 종합적으로 고려하여 총점 80점 기준으로 각 평가항목에 대한 점수를 합산 - 평가위원의 평가항목별 점수계산 및 제안서 평가항목 및 배점 ※ 기술능력평가 결과점수가 배점한도의 85% 이상인 자를 협상적격자로 선정

【평가항목 및 지표】 ❍ 협상순서는 협상적격자의 제안서 평가점수와 입찰가격 평가점수를 합산하여 합산점수의 고득점 순에 의하여 결정 ※ 단, 합산점수가 동일한 제안자가 2인 이상일 경우에는 기술능력평가 점수가 높은 제안자를 선순위자로 하고, 기술능력평가 점수도 동일한 경우 세부배점항목중 전담인력의 전문성에서 높은 점수를 얻은 자를 선순위자로 함 □ 협상 절차 ❍ 평가결과 결정된 협상순위에 따라 대상자와 협상을 하며, 협상이 성립된 때에는 다른 협상적격자와 협상을 실시하지 아니함 ❍ 협상대상자와 협상이 성립되지 않으면 동일한 기준과 절차에 따라 순차적으로 차순위 협상적격자와 협상을 실시함 ❍ 모든 협상적격자와 협상이 결렬될 경우에는 재공고 입찰을 실시함 □ 협상내용 및 범위 ❍ 협상대상자의 제안서 내용(사업추진 계획 및 가격 등) 검토 및 일부 조정 ❍ 협상기준가격은 사업 예산 내에서 협상대상자가 제안한 가격으로 함 ❍ 협상대상자가 제안한 내용을 가감하는 경우에는 그 가감되는 내용에 상당하는 금액을 당해 해당 사업 예산 범위 내에서 조정할 수 있음 ❍ 그 외 사항에 대해서는 협상에 의한 계약체결기준*에 따름 * 재정경제부예규 제40호(2026.1.2.) 󰊲 제안서 작성 및 관련서류 제출 안내 □ 일반사항 ❍ 제출된 서류는 일체 반환되지 않으며, 본 제안과 관련된 일체의 소요비용은 제안기관의 부담으로 함 * 낙찰되지 않은 자가 요청시 제안서는 반환함 ❍ 제안서의 내용은 객관적으로 입증 가능하여야 하며, 그 내용이 허위 일 경우 또는 입증요구에 입증하지 못하는 경우는 평가대상에서 제외함 ❍ 계약 후 제안된 내용이 사실과 다르거나 허위로 판명될 경우, 국가계약법 등 관련규정에 의해 처리함 ❍ 발주기관에 제공된 사업계획서 내 자료 및 정보는 대상자 선정과 계약을 위해서만 사용함 ❍ 기타 규정되지 않은 사항은 발주기관의 유권해석에 따름 □ 제안서 작성 방법

입 찰 공 고 서

국내입찰(협상에 의한 계약)

규격 착오 또는 규정의 미숙지 등으로 입찰자가 계약을 체결하지 않거나, 계약을 체결하고 불이행하는 경우 관계법령에 의거 부정당업자로 제재되어 일정기간 입찰참여가 제한되는 등 불이익을 받으실 수 있사오니, 본 입찰공고서의 규격서 및 계약관련규정을 철저히 숙지하신 후 입찰에 참가하여 주시기 바랍니다. 1. 입찰에 부치는 사항 가. 용 역 명 : [일반용역] 백신 접종자 단일세포 전사체 데이터 및 세포성 면역반응 분석 나. 용역기간 : 계약일로부터 2026년 12월 20일 다. 용역내용 : [붙임] 제안요청서 참조 라. 사업금액 : 금 80,000,000원(부가가치세 포함) 마. 계약방법 : 제한경쟁(협상에의한 계약) 바. 입찰방식 : 전자입찰 사. 입찰서접수기간 : 2026. 9. 18. 10:00부터 ~ 2026. 9. 29. 10:00까지 아. 입찰서 개찰 일시 : 평가위원회 제안서 평가완료 후 개찰 자. 공동계약 및 구성방식: 하도급 불가/ 공동수급 불가 ◆ 입찰자가 숙지할 사항 ㅇ 본 입찰에 참가하고자 하는 자는 반드시 다음의 내용을 열람하고 숙지하여야 하며, 숙지하지 못한 책임은 입찰자에게 있습니다. 가. 용역입찰유의서(기획재정부 계약예규) 나. 협상에 의한 계약 체결기준(기획재정부 계약예규)

참가자격

① 경쟁입찰 참가자격을 갖추고, 조달청 입찰참가자격 등록증을 소지한 사업자 ②「국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정」에 의하여 입찰마감일 전일까지 국가종합전자조달시스템(나라장터(G2B))에 학술·연구용역(업종코드: 1169) 및 기타자유업(업종코드: 9999)으로 입찰참가자격을 모두 등록한자 ③ 국가를 당사자로하는 계약에 관한 법률」제27조 및 동법 시행령 제76조(부정당업자의 입찰참가자격 제한)에 해당되지 않은 업체 나.「중소기업 기본법」제2조에 따른 소기업 또는「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」제2조에 따른 소상공인으로서「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 ‘소기업·소상공인 확인서’를 소지한 자. ※ <소기업·소상공인확인서>가 ‘중소기업제품 공공구매 종합정보망(http://www.smpp.go.kr)’에서 확인이 안 될 경우 입찰 참가자격이 없습니다. - 단, <소기업·소상공인확인서>는 전자입찰서 제출 마감일 전일까지 신청한 것으로 유효기간 내에 있어야 합니다. - 다만, <소기업·소상공인확인서>를 전자입찰서 제출 마감일 전일까지 신청한 업체는 입찰참가가 가능하나, 제안서 제출일로부터 5일 이내에 중소기업공공구매 종합정보망에서 확인이 되지 않거나 입찰참가자격상 기업구분이 다른 경우에는 참가자격이 없습니다. -「중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령」제2조의3(중소기업자와의 우선조달계약에 대한 예외)에 의거 본 사업에 비영리법인 참여 가능

라. 기타 유의사항 ○ 제안서 및 관련 서류는 한글표기를 원칙으로 하며, 제시된 제안서 목차 및 제안서 세부 작성지침을 준용하여 작성하여야 합니다. ○「전자조달의 이용 및 촉진에 관한 법률」제11조(전자문서의 송신·수신) 제4항 및 같은법 시행령 제5조(전자적 형태의 입찰서 제출) 제6항을 준용하여 처리합니다. ○ 우선협상대상자는 수요부서에서 확인을 위하여 추가자료 요청 또는 추가제안을 할 수 있으며, 대상자는 이에 응하여야 합니다. 4. 제안서 발표 및 평가 관련사항 가. 평가주체 : 발주부서(백신임상연구과) 나. 제안서의 공정한 평가를 위해 전문가로 구성된 기술평가위원회를 구성하여 객관적이고 공정한 기준과 절차를 적용하여 우수사업자를 선정합니다. 다. 제안서 평가는 대면평가 원칙이나 서면평가로 변경 가능하며, 입찰참가자에게 별도 통보 예정이오니 평가 관련 사항은 반드시 발주부서에 문의하시기 바랍니다. 라. 기타 세부사항은 발주부서 제안요청서 등에 의합니다. 5. 협상대상자 선정 및 협상기준 가. 협상은 제안서 기술평가(80%)와 가격평가(20%)를 종합평가한 결과 고득점자순으로 합니다. 다만, 제안서 평가결과 기술능력평가 점수가 기술능력 평가분야 배점한도의 85% 이상인 자를 협상적격자로 선정합니다. 나. 기타 사항은「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령」 제43조 협상에 의한 계약체결 및 기획재정부「협상에 의한 계약 체결기준」에 의합니다.

과업·요구