[일반용역](중앙,협상)국가줄기세포은행 자원의 세포 품질 평가 및 특성 규명을 위한 고해상도 전사체 분석

요약 AI 요약

국가줄기세포은행이 보유한 임상등급 줄기세포 자원과 3D 오가노이드의 분화·감염 과정에서 나타나는 유전자 발현 변화를 집단 전체(bulk)와 단일세포 수준에서 연계 분석하여 세포 품질을 평가하고 특성을 규명하고자 한다.

• 줄기세포 및 3D 오가노이드 86개에서 세포 해리·특정 세포 분리(RNA 보존 냉동, single cell RNA Seq용 해리, FACS/MACS 항체 분리 3가지 방식)
• Bulk RNA-sequencing 86건: RNA 추출·QC(1ug 이상, 65ng/ul 이상, RIN 6 이상), 라이브러리 구축, Illumina NovaSeq 6000 이상에서 Raw data 6G 이상·Q30 90% 이상 생산, expression profiling·DEG 분석 및 DEG viewer tool 제공
• Single cell RNA-sequencing 10건: 10x Genomics Flex Apex 프로토콜에 따른 단일세포 분리·고정, 시료당 10,000개 세포·세포당 평균 10,000 read, Q30 80% 이상 데이터 생산
• GFP·long non-coding RNA·virus·microbe·other mRNA 등 기존 probe set에 없는 유전자에 대한 custom detection probe 설계·제작(타깃당 2~3개 probe set)
• Cell Ranger 기반 분석: Fastq summary(html), cluster 간 유전자 발현 비교 결과(엑셀·cloupe), Loupe Browser 매뉴얼 제공, custom probe 검출 결과와 단일세포 전사체 연계 해석 지원
• 최종 결과보고서 제출: Raw data 포함 모든 분석 결과를 이동식 저장장치에 담아 제출, 남은 시료 발주부서 반납

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핵심요약

걸리는 것

장비 보유

장비 보유

세포 해리·분리 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 하며, 제안서에 구체적 세포 해리·분리 방법과 오가노이드 적용 경험을 명시해야 한다.

발주부서와 논의하여 세포 특성 규명 목적에 따라 시료를 ① RNA 보존 시약에 그대로 얼렸을 때 ② single cell RNA Seq과 동일한 방법으로 세포 해리 했을 때 ③ FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)를 이용해 세포 분리를 했을 때의 3가지 방법 나누어 해리가 가능한 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 함.

입찰 전

사전 참가신청·등록

입찰 전 따로 할 절차 · 사전 참가신청·등록

입찰참가자격 등록을 전자입찰서 제출마감일 전일 18:00까지 나라장터에 해야 함. 제안서는 나라장터를 통해 온라인 전자 제출(별도 방문·우편·팩스 아님).

(입찰참가자격 등록) 조달청 경쟁입찰참가자격 등록은 수시로 가능하며, 입찰참가를 위해서는 전자입찰서 제출마감일 전일 18:00까지 등록을 하여야 합니다.

제안서(증빙서류 등 포함)는 반드시 국가종합전자조달시스템(나라장터)를 통하여 전자적으로 제출하여 주시기 바랍니다.

업종·면허 조합

여럿 모두

유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539]를 모두 등록해야 함. 코드 밖 자격(법·조례 허가·지정·등록, 업태·종목, 전문매장)은 없음. 중소기업·소상공인 확인서는 규모·신분 조건이라 이 질문 아님.

• 코드 밖 자격 · 없음 법·조례가 정한 허가·지정·등록이나 사업자등록증 업태·종목, 전문매장 보유 같은 별도 자격 요구는 문서에 없음.

유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539]을 모두 등록한 업체

국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정에 따라 반드시 전자입찰서 제출 마감일 전일까지 나라장터(G2B시스템)에 아래의 사항을 모두 입찰참가자격으로 등록한 자

문서 분석

일의 분량

Bulk RNA-seq 시료 86개 · Single cell RNA-seq 시료 10개 · 시료 1건당 target 세포수 10,000개

사업예산 114,620,000원(부가가치세 포함), 추정가격 104,200,000원(부가가치세 제외).

• 열린 분량 · 정해짐

- Bulk RNA-seq: 86개

- Single cell RNA-seq: 10개

- 시료 1건 당 10,000개 세포를 target으로 하고, 세포 당 평균 10,000 read 수준으로 시퀀싱하여

문서 분석

가격

추정가격

104,200,000원

배정예산

115,801,110원

예정가격 방식

비예가

첨부파일

• HWPX · 2.제안요청서(고해상도 전사체 분석)_구매업무협의안 반영.hwpx · 제안요청서
• HWPX · 재공고서(국가,제한,협상,자체)_R26BK01759449.hwpx · 공고규격서
• PDF · 재공고서(국가,제한,협상,자체)_R26BK01759449.pdf · 공고규격서

첨부 내용을 정리한 글 — 자격 · 배점 · 일정 · 발췌 ›

참가 자격 · 제한

업종제한

유전자검사기관(5331) 그리고 데이터분석제공사업자(6539)
문서: 업종·면허 조합 · 여럿 모두

지역제한

제한 없음
문서: 지역 조건 · 없음

실적경쟁 · PQ

해당 없음
문서: 실적 · 없음

제출 방법

전자입찰
문서: 입찰 전 절차 · 사전 참가신청·등록

공동수급

공동수급불허
문서: 공동수급 · 막음

입찰참가 제한

없음

국제입찰

국내입찰

입찰 일정

평가 · 배점

기술 : 가격 — 기술 90점 · 가격 10점

협상 대상 기준 · 제안서평가결과 기술능력평가점수가 기술능력평가분야 배점한도의 85% 이상인 자를 협상적격자로 선정

사업 내용 · 이 공고에 든 일

중심 · 고해상도 전사체 분석 (Bulk·Single cell RNA-seq 데이터 생산 및 분석)

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

줄기세포·오가노이드 시료에서 RNA 추출·QC, 라이브러리 구축, 시퀀싱 데이터 생산과 전사체 분석·해석을 수행하는 실험실 분석(CRO) 용역이다.

• 시료 수거(발주부서 방문)
• 세포 해리·특정 세포 분리(FACS/MACS)
• 10x Genomics flex apex 기반 단일세포 고정 및 사전 품질 테스트
• Custom detection probe 설계·제작
• Bulk RNA-seq 라이브러리 구축 및 시퀀싱(86건)
• Single cell RNA-seq 라이브러리 제작 및 시퀀싱(10건)
• Cell Ranger·Loupe 기반 데이터 분석 및 DEG viewer tool 제공
• 결과보고서·Raw data 제출 및 잔여 시료 반납

걸리는 것 · 입찰 전 할 일

걸리는 조건

장비 보유

세포 해리·분리 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 하며, 제안서에 구체적 세포 해리·분리 방법과 오가노이드 적용 경험을 명시해야 한다.

발주부서와 논의하여 세포 특성 규명 목적에 따라 시료를 ① RNA 보존 시약에 그대로 얼렸을 때 ② single cell RNA Seq과 동일한 방법으로 세포 해리 했을 때 ③ FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)를 이용해 세포 분리를 했을 때의 3가지 방법 나누어 해리가 가능한 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 함.

입찰 전 할 일

• 입찰 전 따로 할 절차 · 사전 참가신청·등록

  입찰참가자격 등록을 전자입찰서 제출마감일 전일 18:00까지 나라장터에 해야 함. 제안서는 나라장터를 통해 온라인 전자 제출(별도 방문·우편·팩스 아님).

  (입찰참가자격 등록) 조달청 경쟁입찰참가자격 등록은 수시로 가능하며, 입찰참가를 위해서는 전자입찰서 제출마감일 전일 18:00까지 등록을 하여야 합니다.

  제안서(증빙서류 등 포함)는 반드시 국가종합전자조달시스템(나라장터)를 통하여 전자적으로 제출하여 주시기 바랍니다.

더 확인할 것

회사 규모·신분

중소기업만 · 소기업·소상공인만

중소기업자 또는 소상공인으로서 중소기업·소상공인 확인서를 소지한 자. 비영리법인은 확인서 없이 참가 가능.

「중소기업기본법」 제2조에 따른 중소기업자 또는 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 중소기업(소상공인) 확인서를 소지한 업체일 것.

대학·연구소 참가

그렇다

비영리법인은 중소기업·소상공인 확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있음.

또한 「중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령」 제2조의3 제1항 제2호 가목에 해당하는 경우, 비영리법인은 중소기업(소상공인) 확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있음

하도급

막음

선정된 입찰 참가자는 승인 없이 사업의 전부 또는 일부를 제3의 사업자에게 넘길 수 없음(하도급 금지, 공동수급 금지).

• 하도급 한도 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 한도 규정 없음

선정된 입찰 참가자는 본 사업 부분을 질병관리청 국립보건연구원의 승인 없이 금번 사업의 전부 또는 일부를 제3의 사업자에게 넘길 수 없음(하도급 금지, 공동수급 금지)

근무 장소

현장과 우리 쪽에 나눠

시료 수거는 발주부서에 방문하고, RNA 추출·QC·데이터 생산·분석은 수행기관 실험실에서 하며, 남은 시료는 발주부서로 반납한다. 납품장소는 과업내역에 따름으로만 적혀 있다.

• 현장에 있을 사람 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 시료 수거 시 방문 외에 현장에 누가 있어야 하는지 정한 문장이 없다.
• 원격 접속 · 해당 없음 발주처 시스템·망에 원격으로 붙어 하는 일이 아니고, 원격 접속을 정한 문장도 없다.

분석의뢰접수: 발주부서에 방문하여 시료 수거

발주부서에서 제공한 시료에서 RNA 추출 및 QC 확인

분석에 사용하고 남은 시료는 발주부서로 반납

일하는 주기

한 번·정해진 횟수

Bulk RNA-seq 86건, Single cell RNA-seq 10건의 데이터 생산과 분석, 결과보고서 제출을 계약일로부터 2026.12.15.까지 한 사업으로 수행한다. 발주부서가 실험군에 따라 여러 차례에 나누어 시료를 제공하나, 이는 시료 제공 방식이고 정기 방문·상주·요청마다로 정한 문장은 없다.

사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

발주부서는 실험군에 따라 여러 차례에 나누어 시료 제공

수행 기간

사업 기간 2026.12.15

계약일로부터 2026.12.15까지. 납품기한 2026/12/15.

• 옮길 수 없는 끝 날짜 · 있음 사업 기간·납품기한이 2026.12.15로 정해져 있음.

  3. 사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

3. 사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

○ 납품기한: 2026/12/15

여러 해 계약

단년 한 번

사업 기간이 계약일로부터 2026.12.15까지로 단일 회차. 장기계속·연장·연속 사업 문구 없음.

3. 사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

여러 과제로 나뉨

나뉘지 않음

단일 입찰건(입찰공고번호 R26BK01759449-000)으로 과제·권역·그룹·입찰번호로 나뉜 내용이 없음.

• 여러 개 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 나뉘지 않아 해당 사항 없음.

입찰공고번호: R26BK01759449-000

총액·단가 방식

총액

총액계약, 제한(총액)협상에의한계약. 사업예산 114,620,000원(부가가치세 포함), 추정가격 104,200,000원(부가가치세 제외).

• 정산 · 확정 금액 총액계약으로 계약금액이 확정. 다만 일할 계산 조항이 있음.

  일할 계산하여 용역대금이 산정되는 경우 대금지급은 계약체결 후 실제 용역 제공일수에 따라 일할 계산하여 지급합니다.

• 단가 조정 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 단가 조정에 관한 조항 없음.

계약구분: 총액계약

계약입찰방법: 제한(총액)협상에의한계약

큰 배점 항목

기술평가표(붙임3)의 배점 큰 항목: ① 사업수행 방법의 적절성 및 구체성 20점, ② 사업내용의 이해도 및 전문성 15점, ③ 사업목표 달성을 위한 수행체계의 효율성 10점(사업과 관련된 업무수행 경험 등 인력의 전문능력 10점, 사업수행에 필요한 환경확보 및 분석 전문능력 10점도 동일).

기술평가 90점 + 가격평가 10점. 기술평가 항목별 배점은 붙임3 참조.

ㅇ 수행체계 및 방법의 적절성 등 | 5. 사업수행 방법의 적절성 및 구체성 | 20

ㅇ 사업제안내용평가 | 1. 사업내용의 이해도 및 전문성 | 15

ㅇ 수행체계 및 방법의 적절성 등 | 4. 사업목표 달성을 위한 수행체계의 효율성 | 10

평가 자리 발표

서면 평가만

제안요청서에 '제안 발표: 제안서 서면평가'로 명시. 공고문에는 '별도 공지 없이 서면 평가할 수도 있으니'라는 문구가 있다.

• 빠지면 · 해당 없음 발표가 없으므로 해당 없음.

3. 제안 발표: 제안서 서면평가

보관 조건

의무 · 계약 뒤 지킬 일

시료에서 RNA 추출 및 QC, 세포 해리·고정, 남은 시료 반납 등 시료 취급 조건.

• 대상 · 기타 줄기세포·오가노이드 시료의 RNA 보존 시약 냉동, 세포 해리·고정 등 시료 취급

  발주부서와 논의하여 세포 특성 규명 목적에 따라 시료를 ① RNA 보존 시약에 그대로 얼렸을 때 ② single cell RNA Seq과 동일한 방법으로 세포 해리 했을 때 ③ FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)를 이용해 세포 분리를 했을 때의 3가지 방법 나누어 해리가 가능한 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 함

○ 분석에 사용하고 남은 시료는 발주부서로 반납

공고 정보

공고종류

재공고 (재입찰공고)

게시일

10/07(수)

공고번호

R26BK01759449-000

참조번호

-

공고기관

조달청 충북지방조달청

수요기관

질병관리청 국립보건연구원

계약방법

제한경쟁

낙찰방법

협상에의한계약

계약유형

총액계약

예정가격 방식

비예가

추정가격

104,200,000원

배정예산

115,801,110원

공공조달분류

연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 보건복지연구조사서비스

사전규격번호

R26BD00272213

재공고

재공고

출처

나라장터

문서 분석 전체

이 분야에서 갈리는 것 · 이 일에 맞는 지정·등록과 숙련도 적합·CAP 같은 외부 인정을 갖췄나, 특정 병원체 이력·상급종합병원 거래 같은 좁은 실적 벽이 있나, IRB·IND 승인을 마친 과제여야 하나, 건수와 현장 채혈·매일 수거 같은 손이 감당되나에서 갈린다.

질문 91개 · 꼭 5 · 좋음 18 · 안 봐도 됨 68

주제 · 참가 자격 10개

업종·면허 조합

여럿 모두

유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539]를 모두 등록해야 함. 코드 밖 자격(법·조례 허가·지정·등록, 업태·종목, 전문매장)은 없음. 중소기업·소상공인 확인서는 규모·신분 조건이라 이 질문 아님.

• 코드 밖 자격 · 없음 법·조례가 정한 허가·지정·등록이나 사업자등록증 업태·종목, 전문매장 보유 같은 별도 자격 요구는 문서에 없음.

유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539]을 모두 등록한 업체

국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정에 따라 반드시 전자입찰서 제출 마감일 전일까지 나라장터(G2B시스템)에 아래의 사항을 모두 입찰참가자격으로 등록한 자

면허 세부 범위

없음

업종코드 5331·6539 등록 외에 주력분야·종별 등 세부 범위를 요구하는 문장이 없음.

지역 조건

없음

본점 지역 제한 외에 사업장·인력 소재, 지역 업체 공동수급, 지역 가점 등 지역 조건이 문서에 없음.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 평가표에 지역 관련 배점 항목이 없음.
• 대상 · - 해당하는 지역 조건 없음.

실적

없음

참가 자격으로 실적을 요구하지 않음. 다만 과제수행 요구사항에 「동일(유사) 과업 수행 이력을 보유한 기업 참여 필요」가 있고, 기술평가 항목에 「사업과 관련된 업무수행 경험 등 인력의 전문능력」 10점이 있음.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 실적 배점 항목의 최고·최저가 문서에 없음.
• 조건 · 유사·동등 이상 실적 인정 「동일(유사) 과업 수행 이력」을 보유한 기업 참여 필요로 적음.

  데이터 생산에 대한 툴 직접 개발 등 과업 관련 발생가능한 문제 해결을 위한 자체 전문기술 보유 및 동일(유사) 과업 수행 이력을 보유한 기업 참여 필요

데이터 생산에 대한 툴 직접 개발 등 과업 관련 발생가능한 문제 해결을 위한 자체 전문기술 보유 및 동일(유사) 과업 수행 이력을 보유한 기업 참여 필요

업력

없음

업력(설립·개업 후 경과 햇수)을 참가 조건이나 점수로 보는 문장이 없음.

• 요구 업력 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 요구 업력이 문서에 없음.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 업력 배점 항목이 없음.

공동수급

막음

제안요청서에서 하도급 금지, 공동수급 금지로 적음. 공고서에도 공동계약 및 구성방식: 불가로 적음.

• 자격을 나눠 채우기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 공동수급이 금지되어 자격 분담을 따질 자리가 없음.

선정된 입찰 참가자는 본 사업 부분을 질병관리청 국립보건연구원의 승인 없이 금번 사업의 전부 또는 일부를 제3의 사업자에게 넘길 수 없음(하도급 금지, 공동수급 금지)

공동계약 및 구성방식:

불가

회사 규모·신분

중소기업만 · 소기업·소상공인만

중소기업자 또는 소상공인으로서 중소기업·소상공인 확인서를 소지한 자. 비영리법인은 확인서 없이 참가 가능.

「중소기업기본법」 제2조에 따른 중소기업자 또는 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 중소기업(소상공인) 확인서를 소지한 업체일 것.

대학·연구소 참가

그렇다

비영리법인은 중소기업·소상공인 확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있음.

또한 「중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령」 제2조의3 제1항 제2호 가목에 해당하는 경우, 비영리법인은 중소기업(소상공인) 확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있음

사업 성격

아니다(적지 않음)

공고가 스스로 소프트웨어사업·국가연구개발사업·학술연구용역으로 분류하거나 그 규정 적용을 적은 문장이 없음.

행정처분 이력

없음

이 공고·이 업에 건 행정처분·영업정지·벌점·사고 이력 조건은 없음. 부정당업자·조세포탈 등 결격사유 일반 조항만 있음.

• 보는 기간 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 처분 이력을 보는 기간이 문서에 없음.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 처분·사고 이력 배점 항목이 없음.

주제 · 인증·보유 요건·직접 수행 7개

안전보건수준평가

없음

안전보건수준평가 대상 사업이라는 문장이 없고, 중대재해처벌법에 따른 안전·보건 의무 준수와 수요기관의 평가·점검 협조만 적혀 있다.

제조사 확약서

없음

제조사·공식 공급원에게서 받아 오는 공급 확약서·기술지원 확약서·정품보증서·수입신고필증 같은 서류 요구가 없다.

• 대상 · - 해당 서류 없음
• 조건 · 없음 제조사 면제 규정 없음

제품 인증

없음

납품 제품·자재에 대한 인증·허가·시험성적서 요구가 없다. 다만 QC 기준(quantity ≥ 1 ug, concentration ≥ 65 ng/ul, RIN ≥ 6)과 데이터 품질 기준(Q30 90% 이상 등)은 분석 결과물의 성능 기준이다.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 평가표에 인증 배점 없음
• 대상 · - 해당 인증 없음
• 조건 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 인증·성적서 갈음 규정 없음

장비·시설 보유

벽 · 못 맞추면 탈락

세포 해리·분리 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 하며, 제안서에 구체적 세포 해리·분리 방법과 오가노이드 적용 경험을 명시해야 한다.

• 갖출 때 · 입찰 때(공고일·마감일 기준) 제안서에 명시

  * 제안서 내 구체적인 세포 해리, 분리 방법, 오가노이드 적용 경험 여부 등을 반드시 명시

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 장비·시설 배점 없음
• 조건 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 임차·소유 조건 없음

발주부서와 논의하여 세포 특성 규명 목적에 따라 시료를 ① RNA 보존 시약에 그대로 얼렸을 때 ② single cell RNA Seq과 동일한 방법으로 세포 해리 했을 때 ③ FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)를 이용해 세포 분리를 했을 때의 3가지 방법 나누어 해리가 가능한 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 함.

하도급

막음

선정된 입찰 참가자는 승인 없이 사업의 전부 또는 일부를 제3의 사업자에게 넘길 수 없음(하도급 금지, 공동수급 금지).

• 하도급 한도 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 한도 규정 없음

선정된 입찰 참가자는 본 사업 부분을 질병관리청 국립보건연구원의 승인 없이 금번 사업의 전부 또는 일부를 제3의 사업자에게 넘길 수 없음(하도급 금지, 공동수급 금지)

직접 생산

없음

직접생산확인·제조 등록·OEM 금지·한 제조사 제품 요구가 없다. 입찰참가 등록은 유전자검사기관[5331] 및 데이터분석제공사업자[6539] 모두 등록이 요건이다.

• 참가 등록 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 제조·공급 구분 등록 요건 없음(업종코드 5331·6539 등록)
• 직생 범위 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 직생 공고 아님
• 대상 · - 해당 없음

품질 인증

없음

회사나 제조사의 품질·환경·안전·정보보호 인증(ISO 등)을 참가 조건이나 점수로 보지 않는다.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 인증 배점 없음
• 대상 · - 해당 인증 없음

주제 · 결과물·검수·보고 10개

지정 제품·공법

지정 — 동등 이상 허용

Bulk RNA-seq 라이브러리 구축에 TruSeq® Stranded specific mRNA library kit (illumina)를, 시퀀싱에 Illumina NovaSeq 6000 이상의 플랫폼을, single cell 분석에 10x genomics flex apex protocol 및 Cell Ranger·Loupe Browser 프로그램을 지정. 동등 이상 허용 문구는 없음.

• 동등 입증 때 · 해당 없음 동등 이상 허용 문구가 없어 적합 판정 시점 규정 없음

TruSeq® Stranded specific mRNA library kit (illumina)을 이용해 라이브러리를 구축하고, Illumina NovaSeq 6000 이상의 플랫폼으로 약 Raw data 6G 이상, 고품질 (Q30) 데이터는 90% 이상을 충족

검수

발주처 검수만

검사/검수기관은 수요기관/수요기관으로 기재되어 있고, 결과보고서 제출·검사 및 결과보고서 자료 제출로 종료. 외부 기관 심의·승인·감리·성과심사 문구 없음.

검사/검수기관: 수요기관 / 수요기관

○ 검사 및 결과보고서 자료 제출

합격선

숫자 기준 있음

Bulk RNA-seq: QC(quantity ≥ 1 ug, concentration ≥ 65 ng/ul, RIN ≥ 6), Raw data 6G 이상, Q30 90% 이상. Single cell: 시료 1건당 10,000개 세포, 세포당 평균 10,000 read, Quality Score 30 기준 최소 80% 이상.

• 따를 표준·지침 · 10x genomics flex apex protocol, TruSeq® Stranded specific mRNA library kit (illumina), Illumina NovaSeq 6000 이상 플랫폼, 10x Genomics Cell Ranger 프로그램, Loupe Browser 프로그램 10x genomics flex apex protocol에 따라 단일세포 분리·고정, Cell Ranger로 분석, Loupe Browser input 가능 형식 제공

  single cell RNA Seq 데이터 생산을 위한 줄기세포 및 오가노이드 (10개)는 10x genomics flex apex protocol에 따라 단일세포 분리 및 고정 (fixation)을 수행.

  각 샘플의 Fastaq 파일을 10x Genomics에서 지원하는 Cell Ranger 프로그램을 이용하여 html 형식의 summary 파일 제공

QC (quantity ≥ 1 ug, concentration ≥ 65 ng/ul, RIN ≥ 6)에서 부적합한 것이 있을 경우, 발주부서와 협의 후 분석 진행 여부 결정

Illumina NovaSeq 6000 이상의 플랫폼으로 약 Raw data 6G 이상, 고품질 (Q30) 데이터는 90% 이상을 충족

시료 1건 당 10,000개 세포를 target으로 하고, 세포 당 평균 10,000 read 수준으로 시퀀싱하여 10x genomics사에서 가이드하는 최소 이상의 데이터 생산

Quality Score 30 기준 최소 80% 이상 충족하며, 각 해독 데이터 생산조건 미달성 시 추가 샘플링 또는 라이브러리 재구축 진행

성과 목표

목표 없음

숫자로 정한 성과 목표·성능 보증 및 미달 시 불이익 조항 없음. 데이터 생산 조건 미달 시 추가 샘플링·라이브러리 재구축은 검수 합격선에 해당.

• 목표의 성격 · 해당 없음 성과 목표 자체가 없음

시험·검사

우리 부담(대가 안)

QC, 라이브러리 구축, 시퀀싱, 데이터 분석 등 품질 시험·분석을 수행기관이 수행하며 별도 정산 문구 없음. 시험 단위·장소 규정 없음.

• 시험 단위 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 시험 단위 규정 없음
• 시험 장소 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 시험 장소 규정 없음

발주부서에서 제공한 시료에서 RNA 추출 및 QC 확인

추출된 RNA를 이용하여 데이터 생산

원자료

발주처 몫

발주부서가 줄기세포·3D 오가노이드 모델 및 시료(Bulk RNA-seq 86개, Single cell RNA-seq 10개)를 제공하고, 수행기관이 방문 수거. antibody(bead, 형광 항체)도 발주처 제공 예정.

• 시료 제공

- Bulk RNA-seq: 86개

- Single cell RNA-seq: 10개

발주부서에서 줄기세포 및 3D 오가노이드 모델 제공

FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)

시안 승인

해당 없음

시안·샘플·제작도·중간검수 승인 단계 규정 없음. 분석 단계별 진행상황 보고만 있음.

• 수정 횟수 · 해당 없음 수정 횟수 규정 없음
• 승인 기간 · 해당 없음 승인 기간 규정 없음

인허가·검사

절차 없음

이 용역에 필요한 인허가·신고·심의·법정 검사 절차 규정 없음. 입찰참가자격으로 유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539] 등록 요건만 있음.

• 비용 · 해당 없음 인허가 절차가 없어 비용 규정 없음

보고 주기

수시

정기 보고 주기 규정 없음. 용역수행기관 담당자는 별도 요청이 없더라도 분석 단계별 진행상황을 발주부서 담당자에게 보고. 보고회·작업 기록·증빙 규정 없음.

• 보고회 · 해당 없음 보고회 규정 없음
• 작업 기록·증빙 · 요구 없음 작업 기록·증빙 규정 없음

○ 용역수행기관 담당자는 별도의 요청이 없더라도 분석 단계별 진행상황을 발주부서 담당자에게 보고하여야 함

넘길 산출물

원자료·해석 입력 자료

최종 결과는 Raw data를 포함한 분석된 모든 결과 자료를 이동식 저장 장치에 담아 제출. Fastaq 파일, Cell Ranger html summary, 엑셀 및 cloupe 형식 결과 제공. 남은 시료는 발주부서로 반납.

• 정해진 형식 · 그렇다 html, 엑셀, cloupe 형식 및 이동식 저장 장치 지정

  Cell Ranger 프로그램을 이용하여 Single cell RNA seq 분석 후 Cluster 간의 유전자 발현을 비교 분석한 결과를 엑셀 및 cloupe* 형식으로 제공

○ 최종 결과는 Raw data를 포함한 분석된 모든 결과 자료를 이동식 저장 장치에 담아 제출

각 샘플의 Fastaq 파일을 10x Genomics에서 지원하는 Cell Ranger 프로그램을 이용하여 html 형식의 summary 파일 제공

Cell Ranger 프로그램을 이용하여 Single cell RNA seq 분석 후 Cluster 간의 유전자 발현을 비교 분석한 결과를 엑셀 및 cloupe* 형식으로 제공

주제 · 인력·수행 방식 8개

인력 자격

없음

제안요청서는 세포 해리·분리 실험실 환경과 경험, 오가노이드 적용 경험, 자체 전문기술 보유 및 동일(유사) 과업 수행 이력을 갖춘 기업 참여를 요구하나, 이는 업체 차원의 경험·기술 요건이고 특정 인력의 자격·등급·학위·경력·교육 이수를 요구하는 문장은 없다. 기술평가표에도 인력 자격·경력 배점 항목이 없다.

제안서 내 구체적인 세포 해리, 분리 방법, 오가노이드 적용 경험 여부 등을 반드시 명시

데이터 생산에 대한 툴 직접 개발 등 과업 관련 발생가능한 문제 해결을 위한 자체 전문기술 보유 및 동일(유사) 과업 수행 이력을 보유한 기업 참여 필요

근무 장소

현장과 우리 쪽에 나눠

시료 수거는 발주부서에 방문하고, RNA 추출·QC·데이터 생산·분석은 수행기관 실험실에서 하며, 남은 시료는 발주부서로 반납한다. 납품장소는 과업내역에 따름으로만 적혀 있다.

• 현장에 있을 사람 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 시료 수거 시 방문 외에 현장에 누가 있어야 하는지 정한 문장이 없다.
• 원격 접속 · 해당 없음 발주처 시스템·망에 원격으로 붙어 하는 일이 아니고, 원격 접속을 정한 문장도 없다.

분석의뢰접수: 발주부서에 방문하여 시료 수거

발주부서에서 제공한 시료에서 RNA 추출 및 QC 확인

분석에 사용하고 남은 시료는 발주부서로 반납

소속 직원

없음

제안서 표지에 사업참여자 총 인원과 사업책임자·직원 구분을 적는 서식이 있을 뿐, 투입 인력이 우리 회사 소속 직원이어야 한다는 요구나 재직 기간·고용 형태 조건, 프리랜서·외부 전문가 활용 조건은 없다.

고용승계

없음

고용승계를 요구하는 문장이 문서 어디에도 없다.

근무 시간

해당 없음

근무 요일·시간·교대 형태나 운영 시간을 정한 내용이 없다. 사업 기간은 계약일로부터 2026.12.15.까지이고, 추진일정은 계약시점 기준 1~3개월로 데이터 생산·분석·보고서 작성 단계가 제시되어 있을 뿐이다.

보안 조치

없음

출입 승인·보안서약·보안교육, 기기·저장매체 반입 제한, 작업 PC·망 통제, 자료 반출 금지·삭제·반납, 개인정보 처리 위탁계약을 이 일에 요구하는 문장이 없다. 제안요청서에 제공 자료·정보를 관계기관 외 타 기관에 제공할 수 없다는 일반 문구만 있다.

질병관리청 국립보건연구원에서 제공한 자료 및 정보에 대해서는 제안참여업체의 관계기관 외 타 기관에 제공할 수 없음

신원 조건

없음

투입 인력에 대한 범죄경력 조회, 신원조회 결격, 운전 적격·교통안전 조회, 건강검진을 요구하는 문장이 없다. 입찰참가자격 제한(조세포탈 등 유죄판결)은 업체 자격 요건이다.

일하는 주기

한 번·정해진 횟수

Bulk RNA-seq 86건, Single cell RNA-seq 10건의 데이터 생산과 분석, 결과보고서 제출을 계약일로부터 2026.12.15.까지 한 사업으로 수행한다. 발주부서가 실험군에 따라 여러 차례에 나누어 시료를 제공하나, 이는 시료 제공 방식이고 정기 방문·상주·요청마다로 정한 문장은 없다.

사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

발주부서는 실험군에 따라 여러 차례에 나누어 시료 제공

주제 · 과업 범위·규모·기간 11개

다른 업 섞임

섞임 — 직접 해야 함

입찰참가자격으로 유전자검사기관[업종코드 5331]과 데이터분석제공사업자[업종코드 6539]를 모두 등록해야 하고, 선정된 입찰참가자는 사업의 전부 또는 일부를 승인 없이 제3자에게 넘길 수 없음(하도급 금지, 공동수급 금지). 공동계약 및 구성방식도 불가.

국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정에 따라 반드시 전자입찰서 제출 마감일 전일까지 나라장터(G2B시스템)에 아래의 사항을 모두 입찰참가자격으로 등록한 자

- 유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539]을 모두 등록한 업체

○ 선정된 입찰 참가자는 본 사업 부분을 질병관리청 국립보건연구원의 승인 없이 금번 사업의 전부 또는 일부를 제3의 사업자에게 넘길 수 없음(하도급 금지, 공동수급 금지)

○ 공동계약 및 구성방식: 불가

하는 일

국가줄기세포은행이 보유한 임상등급 줄기세포 및 3D 오가노이드 자원의 세포 품질 평가와 특성 규명을 위한 고해상도 전사체 분석 용역. 줄기세포·오가노이드에서 세포 해리·특정 세포 분리 후 Bulk RNA-seq(86건)와 Single cell RNA-seq(10건) 데이터를 생산하고, custom detection probe 설계·제작 및 bioinformatics 분석 결과와 결과보고서를 제출한다.

○ 국가줄기세포은행에서 보유한 자원의 품질 및 특성 분석

○ 전사체 서열 생산 (86건)

○ 라이브러리 제작 및 데이터 생산 (10건)

○ 최종 결과는 Raw data를 포함한 분석된 모든 결과 자료를 이동식 저장 장치에 담아 제출

기존 시스템과 이어짐

기존 제조사 제품에 묶임

10x genomics flex apex protocol 및 10x Genomics의 Cell Ranger·Loupe Browser 프로그램 사용을 전제로 함. 기존 시스템과의 연동·연속 사업·상대편 비용 부담은 문서에 없음.

○ single cell RNA Seq 데이터 생산을 위한 줄기세포 및 오가노이드 (10개)는 10x genomics flex apex protocol에 따라 단일세포 분리 및 고정 (fixation)을 수행.

- 각 샘플의 Fastaq 파일을 10x Genomics에서 지원하는 Cell Ranger 프로그램을 이용하여 html 형식의 summary 파일 제공

일의 분량

Bulk RNA-seq 시료 86개 · Single cell RNA-seq 시료 10개 · 시료 1건당 target 세포수 10,000개

사업예산 114,620,000원(부가가치세 포함), 추정가격 104,200,000원(부가가치세 제외).

• 열린 분량 · 정해짐

- Bulk RNA-seq: 86개

- Single cell RNA-seq: 10개

- 시료 1건 당 10,000개 세포를 target으로 하고, 세포 당 평균 10,000 read 수준으로 시퀀싱하여

수행 기간

사업 기간 2026.12.15

계약일로부터 2026.12.15까지. 납품기한 2026/12/15.

• 옮길 수 없는 끝 날짜 · 있음 사업 기간·납품기한이 2026.12.15로 정해져 있음.

  3. 사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

3. 사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

○ 납품기한: 2026/12/15

여러 해 계약

단년 한 번

사업 기간이 계약일로부터 2026.12.15까지로 단일 회차. 장기계속·연장·연속 사업 문구 없음.

3. 사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

최소 투입 인원

해당 없음

최소 투입 인원·공수(MD) 규정이 문서에 없음.

• 조 편성 · 해당 없음

다른 일정에 묶임

아니다

다른 공사·사업 일정에 묶였다는 문구 없음.

부가 작업

분석의뢰접수 시 발주부서에 방문하여 시료 수거, 남은 시료 발주부서 반납, 분석 단계별 진행상황을 발주부서 담당자에게 보고, Loupe Browser 사용 매뉴얼 제공.

• 분석의뢰접수: 발주부서에 방문하여 시료 수거

• 남은 시료는 발주부서로 반납

○ 용역수행기관 담당자는 별도의 요청이 없더라도 분석 단계별 진행상황을 발주부서 담당자에게 보고하여야 함

* Loupe Browser 프로그램에 input 가능한 형식의 파일로, 해당 프로그램 사용에 대한 매뉴얼 발주부서에 제공

교육·기술이전

모름 · 문서로 확인 안 됨

교육·시연·기술이전 횟수는 문서에 없음. Loupe Browser 사용 매뉴얼 제공만 있음.

• 무상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨

* Loupe Browser 프로그램에 input 가능한 형식의 파일로, 해당 프로그램 사용에 대한 매뉴얼 발주부서에 제공

일의 형태

조사·측정 · 계획·연구·자문

시료에서 RNA 추출·QC, 세포 해리·분리, 시퀀싱 데이터 생산(조사·측정)과 bioinformatics 분석·결과 보고서 작성(계획·연구·자문).

○ 86개 줄기세포 및 오가노이드에서 RNA 추출 및 QC 수행

○ 전사체 서열 생산 (86건)

○ 생산된 데이터를 바탕으로 데이터 분석 및 발주부서 제공

○ 최종 결과는 Raw data를 포함한 분석된 모든 결과 자료를 이동식 저장 장치에 담아 제출

주제 · 입찰 절차·보증 7개

참가 범위

공개 경쟁

제한경쟁입찰로, 중소기업·소상공인 확인서를 소지하고 나라장터에 유전자검사기관[5331] 및 데이터분석제공사업자[6539] 모두로 등록한 자가 참가 가능. 조건을 갖추면 누구나 낼 수 있는 제한경쟁이므로 공개 경쟁.

계약방법: 제한경쟁입찰

국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정에 따라 반드시 전자입찰서 제출 마감일 전일까지 나라장터(G2B시스템)에 아래의 사항을 모두 입찰참가자격으로 등록한 자

- 유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539]을 모두 등록한 업체

여러 과제로 나뉨

나뉘지 않음

단일 입찰건(입찰공고번호 R26BK01759449-000)으로 과제·권역·그룹·입찰번호로 나뉜 내용이 없음.

• 여러 개 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 나뉘지 않아 해당 사항 없음.

입찰공고번호: R26BK01759449-000

입찰 전 절차

사전 참가신청·등록

입찰참가자격 등록을 전자입찰서 제출마감일 전일 18:00까지 나라장터에 해야 함. 제안서는 나라장터를 통해 온라인 전자 제출(별도 방문·우편·팩스 아님).

(입찰참가자격 등록) 조달청 경쟁입찰참가자격 등록은 수시로 가능하며, 입찰참가를 위해서는 전자입찰서 제출마감일 전일 18:00까지 등록을 하여야 합니다.

제안서(증빙서류 등 포함)는 반드시 국가종합전자조달시스템(나라장터)를 통하여 전자적으로 제출하여 주시기 바랍니다.

현장설명회

없음

사업 설명회 없음(개별 문의).

2. 사업 설명회: 없음(개별 문의, 043-249-2531)

공채·채권

모름 · 문서로 확인 안 됨

공채·채권 매입 비율을 이 공고에서 정한 문장이 없음. 일반조건·특수조건의 정형 조항만 있음.

입찰보증금

면제·지급각서로 갈음

입찰보증금은 위 사항(채무불이행자 등)을 제외하고는 납부 면제, 입찰보증금 지급각서 제출. 계약보증금은 「조달청 내자구매업무 처리규정」 제48조의2, 하자보수보증금은 제59조(용역 계약금액의 100분의 2) 적용.

• 입찰보증금 비율 · 해당 없음 납부 면제·지급각서 갈음이므로 해당 없음.
• 계약·하자 보증 비율 · 2% 하자보수보증금 용역 계약금액의 100분의 2(조달청 내자구매업무 처리규정 제59조). 계약보증금은 「조달청 내자구매업무 처리규정」 제48조의2 적용으로 비율 미기재.

  제59조(하자보수 보증금) ①계약담당과장은 물품 및 용역의 특성상 하자보수보증이 필요하다고 인정되는 경우에는 물품(용역)별 하자담보 책임기간을 정하고 계약상대자로 하여금 물품의 경우 계약금액의 100분의 3, 용역의 경우 계약금액의 100분의 2(｢국가계약법 시행규칙｣ 제72조제1항 및 ｢지방계약법 시행규칙｣ 제70조제1항에서 정한 경우에는 그 금액)에 해당하는 하자보수 보증금을 납부하게 할 수 있다.

(납부면제) 위 사항을 제외하고는 이 입찰에서 입찰보증금의 납부는 면제하되, 입찰보증금 지급각서를 제출하여야 합니다.

계약보증금 및 하자보증금은 「조달청 내자구매업무 처리규정」 제48조의2(계약보증금), 제59조(하자보수 보증금)의 적용을 받습니다.

문서끼리 다른 곳

아니다

문서끼리 어긋난 값을 찾을 수 없음. 입찰공고서와 과업내용서가 다르면 입찰공고서가 우선한다는 정형 조항만 있음.

이 입찰집행과 관련하여 입찰공고서와 과업내용서(제안요청서 등 입찰 첨부서류 일체)의 내용이 서로 다를 경우 입찰공고서가 우선하여 적용됩니다.

주제 · 현장 작업·유지보수 9개

출동 시한

없음

고장·장애·긴급 호출에 따른 현장 도착·착수 시한이나 야간·휴일 대응 요구가 문서에 없다. 시료 상태·QC 미충족·일정 변경 등 문제 발생 시 즉시 발주부서와 협의하여 대응 방안을 확정한 후 진행하라는 조항만 있다.

• 도착 시한 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 도착·착수 시한을 정한 문장이 없다.

시료의 상태, 해리 효율, 품질 관리(QC) 미충족, 일정 변경 등 문제 발생 시, 수행기관은 즉시 발주부서와 협의하여 대응 방안을 확정한 후 진행할 것

처리 시한

정해지지 않음

요청·장애 처리 시한을 정한 문장이 없다. 분석 단계별 진행상황을 별도 요청이 없더라도 발주부서 담당자에게 보고하라는 의무만 있다.

• 기점 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 처리 시한을 세는 기점이 적혀 있지 않다.

용역수행기관 담당자는 별도의 요청이 없더라도 분석 단계별 진행상황을 발주부서 담당자에게 보고하여야 함

부품·소모품

해당 없음

이 공고는 전사체 분석 용역으로 유지보수(점검·수리) 계약이 아니다. 부품·소모품·예비품 무상 교체 여부를 정한 조항이 없다.

현장·납품지

1곳

납품장소는 과업내역에 따름으로만 적혀 있고, 시료 수거는 발주부서에 방문하여 수행한다. 해외·섬·개별 가정 배송은 없다.

• 열린 분량 · 정해짐 납품장소가 과업내역에 따름으로 정해져 있고, 시료 수거는 발주부서 방문으로 특정된다.

  납품장소: 과업내역에 따름

• 범위 · 없음(국내 보통 현장) 해외·섬·개별 가정 배송에 관한 내용이 없다.

납품장소: 과업내역에 따름

분석의뢰접수: 발주부서에 방문하여 시료 수거

현장 여건

실험실 환경에서 줄기세포·오가노이드 해리·분리·고정·QC·시퀀싱·바이오인포매틱스 분석을 수행하는 실내 실험·분석 용역이다. 발주부서가 시료를 제공하고, 수행기관이 방문 수거한다. 부대공사·현장 준비나 위험작업에 관한 조항은 없다.

부대공사·현장 준비와 위험작업에 관한 요구가 문서에 없다.

• 부대공사·현장 준비 · 해당 없음 실험·분석 용역으로 부대공사·현장 준비 항목이 없다.
• 위험작업 · 없음 밀폐공간·고소·중량물·굴착·도로·수상 작업 등 위험작업이 문서에 없다.

발주부서에서 줄기세포 및 3D 오가노이드 모델 제공

분석의뢰접수: 발주부서에 방문하여 시료 수거

작업 시기

해당 없음

일할 수 있는 때를 묶는 제약(야간·주말·휴일, 정해진 기간, 운영 중 시설, 교통통제, 계절·기상, 정해진 시기 집중)이 문서에 없다. 사업기간만 계약일로부터 2026.12.15.까지로 정해져 있다.

사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지

경비 부담

우리 부담(대가 안)

사업예산 114,620,000원(부가가치세 포함)에 실험·분석에 드는 비용이 포함된 총액계약이다. 발주부서는 시료와 특정 antibody(bead, 형광 항체)를 제공한다. 관급 금액은 적혀 있지 않다.

• 관급 금액 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 발주처가 제공하는 antibody의 금액이 적혀 있지 않다.
• 관급 설치 · 해당 없음 관급 기기·자재 설치에 관한 내용이 없다.

사업 예산: 114,620,000원(부가가치세 포함)

FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)

폐기물 처리 몫

해당 없음

실험·분석 용역으로 폐기물·부산물 처리에 관한 조항이 없다. 남은 시료는 발주부서로 반납하도록만 정해져 있다.

분석에 사용하고 남은 시료는 발주부서로 반납

하자보수

해당 없음

결과물·납품물의 무상 하자보증·교환 기간을 정한 조항이 없다. 하자보수보증금은 조달청 내자구매업무 처리규정에 따른다는 정형 조항만 있다.

• 기점 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 보증 기간을 세는 기점이 적혀 있지 않다.
• 보증 기간 정기점검 · 없음 보증 기간 정기점검에 관한 요구가 없다.
• 소모성·정기정비 부품 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 보증 기간 소모성·정기정비 부품 무상 여부가 적혀 있지 않다.

계약보증금 및 하자보증금은 「조달청 내자구매업무 처리규정」 제48조의2(계약보증금), 제59조(하자보수 보증금)의 적용을 받습니다.

주제 · 가격·대금·계약 조건 11개

대금 방식

발주처가 대금 지급

수요기관(질병관리청 국립보건연구원)이 사업예산 114,620,000원(부가가치세 포함)을 지급하는 용역. 이용자·수혜자가 비용을 대는 구조는 없음.

• 이용자 몫 수납 · 해당 없음 이용자·수혜자가 내는 몫이 없음.

사업 예산: 114,620,000원(부가가치세 포함)

사업금액: 114,620,000원(부가가치세 포함)

총액·단가 방식

총액

총액계약, 제한(총액)협상에의한계약. 사업예산 114,620,000원(부가가치세 포함), 추정가격 104,200,000원(부가가치세 제외).

• 정산 · 확정 금액 총액계약으로 계약금액이 확정. 다만 일할 계산 조항이 있음.

  일할 계산하여 용역대금이 산정되는 경우 대금지급은 계약체결 후 실제 용역 제공일수에 따라 일할 계산하여 지급합니다.

• 단가 조정 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 단가 조정에 관한 조항 없음.

계약구분: 총액계약

계약입찰방법: 제한(총액)협상에의한계약

물량 변동

확정

Bulk RNA-seq 86건, Single cell RNA-seq 10건, 시료 수량·사양이 입찰 때 확정. 다만 86개 시료의 해리 방법은 발주부서와 논의 후 결정.

Bulk RNA-seq: 86개

Single cell RNA-seq: 10개

또한 86개 시료에 대한 해리 방법은 발주부서와 논의 후 결정

발주처 단가 기준

적혀 있지 않음

발주처가 정한 단가·품셈·요율 등 산정 기준이 공고에 없음. 사업예산·추정가격만 제시.

계약 상대

공고 낸 기관 직접

조달청 충북지방조달청이 공고·계약을 대행하고 수요기관은 질병관리청 국립보건연구원. 계약·대금 상대는 공고 낸 기관(조달청)이며 수요기관이 검사·검수.

검사/검수기관: 수요기관 / 수요기관

그대로 넘길 돈

아니다

계약금액 안에 다른 곳에 넘기거나 정해진 곳에 그대로 써야 하는 돈이 있다고 적혀 있지 않음.

• 넘길 돈 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 항목 없음.
• 투찰 때 반영 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 지시 없음.

견적 근거

공개 안 됨

설계서·내역서·도면 등 견적 근거가 첨부·공개되어 있지 않음. 제안요청서에 사업 내용만 기술.

• 이윤 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 원가계산서·산출내역이 공개되지 않음.

대금 받는 때

끝난 뒤 한 번에

사업기간 계약일로부터 2026.12.15.까지, 납품기한 2026/12/15. 지급 시기·방식에 관한 구체 조항은 없음.

• 선금 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 선금 비율에 관한 조항 없음.
• 지급 기한 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 청구 후 지급 기한에 관한 조항 없음.

납품기한: 2026/12/15

보험 가입

없음

이 일 때문에 들어야 하는 보험·공제 요구가 공고에 없음.

• 보상 한도 · 해당 없음 보험 요구 없음.
• 보험료 · 해당 없음 보험 요구 없음.
• 대상 · 해당 없음 보험 요구 없음.

계약 변동 가능

그렇다

제안요청서에 사업추진내용·추진일정 등은 계획사항이며 발주기관 사정에 따라 변경될 수 있다고 적음.

• 바뀔 수 있는 것 · 금액·물량·기간이 바뀔 수 있음 사업추진내용·추진일정이 발주기관 사정에 따라 변경될 수 있음.

  제안요청서에 기재된 사업추진내용, 추진일정 등은 계획사항이며 질병관리청 국립보건연구원의 사정에 따라 변경될 수 있음

제안요청서에 기재된 사업추진내용, 추진일정 등은 계획사항이며 질병관리청 국립보건연구원의 사정에 따라 변경될 수 있음

부가세 과세

과세

사업예산 114,620,000원(부가가치세 포함), 추정가격 104,200,000원(부가가치세 제외). 입찰금액은 부가가치세를 포함한 가격.

• 투찰가에 부가세 · 넣는다 입찰금액은 부가가치세를 포함한 가격으로 투찰. 면세사업자인 경우에도 부가가치세 포함 가격으로 투찰하고 낙찰 시 계약금액에서 부가가치세 상당액을 차감.

  입찰금액은 부가가치세를 포함한 가격입니다.

  입찰자가 면세사업자인 경우 입찰금액은 반드시 부가가치세를 포함한 가격으로 투찰해야 하며, 입찰결과 낙찰자가 면세사업자인 경우 계약금액은 낙찰금액에서 부가가치세 상당액을 차감한 금액으로 합니다.

사업예산 및 입찰금액은 부가가치세를 포함한 가격입니다.

추정가격: 104,200,000원(부가가치세 제외)

뽑는 방식 · 입찰 방식 10개

회사 속성 우대

없음

평가표·공고문 어디에도 창업·여성·장애인·사회적기업·소기업·고용실적·인증·산업재해율 우대 규정이 없다. 중소기업·소상공인 확인서는 참가자격(벽)일 뿐 우대가 아니다.

• 우대 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 문서에 우대 대상 자체가 규정되어 있지 않다.
• 가점 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 가점 규정이 없다.

신용등급·경영상태

없음

신용평가등급·기술신용평가·재무비율·매출·지급여력 등 경영상태를 참가 조건이나 점수로 보는 규정이 없다. 기술평가표에도 해당 항목이 없다.

• 등급이 없을 때 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 등급 평가 자체가 없어 규정이 없다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 배점이 없다.
• 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 대상이 없다.

보유 인력

없음

회사가 보유한 인력의 수·등급을 참가 조건이나 점수로 보는 규정이 없다. 기술평가표의 '인력의 전문능력'은 업무수행 경험 등 정성 평가 항목이다.

• 기준 인원 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 기준 인원 규정이 없다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 배점이 없다.

전담 인력

없음

투입 인력의 전담·겸직 금지·참여율 상한·업무중첩도 감점 규정이 없다. 제안서 작성 항목에 조직·인원을 제시하라는 정도만 있다.

• 참여율 상한 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 참여율 규정이 없다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 배점이 없다.
• 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 대상이 없다.

큰 배점 항목

기술평가표(붙임3)의 배점 큰 항목: ① 사업수행 방법의 적절성 및 구체성 20점, ② 사업내용의 이해도 및 전문성 15점, ③ 사업목표 달성을 위한 수행체계의 효율성 10점(사업과 관련된 업무수행 경험 등 인력의 전문능력 10점, 사업수행에 필요한 환경확보 및 분석 전문능력 10점도 동일).

기술평가 90점 + 가격평가 10점. 기술평가 항목별 배점은 붙임3 참조.

ㅇ 수행체계 및 방법의 적절성 등 | 5. 사업수행 방법의 적절성 및 구체성 | 20

ㅇ 사업제안내용평가 | 1. 사업내용의 이해도 및 전문성 | 15

ㅇ 수행체계 및 방법의 적절성 등 | 4. 사업목표 달성을 위한 수행체계의 효율성 | 10

가점

없음

특허·신기술·수상·우수업체 선정·기술개발 투자·신규 고용에 대한 가점 규정이 없다.

• 가점 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 가점 대상 규정이 없다.
• 가점 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 가점 규정이 없다.

샘플·시안 선제출

없음

입찰·제안·규격평가 단계에서 시안·샘플·견본·조감도·시험번역·예약확인서를 미리 만들어 내거나 평가 자리에서 시연·성능시험을 받는 규정이 없다. 제안서는 서면평가로 한다.

• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 배점이 없다.
• 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 대상이 없다.

무상 추가 제공

없음

무상 유지보수·사후지원 기간이나 과업 밖 추가 제공을 점수로 보거나 최소 기간을 요구하는 규정이 없다. '추가제안이나 자료를 추가 요청할 수 있음'은 정형 문구다.

• 요구 기간 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 유지보수·사후지원 기간 규정이 없다.
• 크기 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 배점이 없다.
• 대상 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 해당 대상이 없다.

평가 자리 발표

서면 평가만

제안요청서에 '제안 발표: 제안서 서면평가'로 명시. 공고문에는 '별도 공지 없이 서면 평가할 수도 있으니'라는 문구가 있다.

• 빠지면 · 해당 없음 발표가 없으므로 해당 없음.

3. 제안 발표: 제안서 서면평가

차등점수제

아니다

차등점수제 적용 문구가 없다. 기술평가는 심사위원 점수를 산술평균(최고·최저 제외)하여 점수화한다.

• 순위 간 점수차 · 모름 · 문서로 확인 안 됨 차등점수제가 없어 순위 간 점수차 규정이 없다.

카테고리 · 시험·분석·측정 8개

시험기관 인정

없음

입찰참가자격은 유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539] 등록, 중소기업·소상공인 확인서 소지뿐이며 KOLAS 인정·정도관리 검증서·인증기관 인정 요구는 없다.

측정·분석 대상

그 밖(짧은 글)

줄기세포 및 3D 오가노이드 시료의 RNA를 대상으로 Bulk RNA-seq(86건)와 Single cell RNA-seq(10건) 전사체 분석을 수행한다.

• 항목 변동 · 그렇다 QC 부적합 시 발주부서와 협의 후 분석 진행 여부 결정, 시료 상태·해리 효율·QC 미충족·일정 변경 등 문제 발생 시 협의하여 대응 방안 확정

  QC (quantity ≥ 1 ug, concentration ≥ 65 ng/ul, RIN ≥ 6)에서 부적합한 것이 있을 경우, 발주부서와 협의 후 분석 진행 여부 결정

  시료의 상태, 해리 효율, 품질 관리(QC) 미충족, 일정 변경 등 문제 발생 시, 수행기관은 즉시 발주부서와 협의하여 대응 방안을 확정한 후 진행할 것

○ 국가줄기세포은행에서 보유한 자원의 품질 및 특성 분석

○ 86개 줄기세포 및 오가노이드에서 RNA 추출 및 QC 수행

○ 라이브러리 제작 및 데이터 생산 (10건)

무상·저가 추가 일

없음

계약 단가·위탁료 안에서 무료·감액으로 해야 하는 일에 대한 요구가 문서에 없다.

채취 전 조건

지점·범위·일정 사전 협의·승인

86개 시료에 대한 해리 방법은 발주부서와 논의 후 결정, custom probe 설계도 발주부서와 논의하여 진행.

또한 86개 시료에 대한 해리 방법은 발주부서와 논의 후 결정

발주부서와 논의하여 GFP, long non-coding RNA, virus, microbe, other mRNA 등 10x genomics flex apex 기반 gene expression probe set에 없는 유전자에 대한 특이 custom probe 설계를 진행함

분석 품질 보증

정도관리(QA/QC) 계획 제출·내부정도관리

RNA 추출 및 QC(quantity ≥ 1 ug, concentration ≥ 65 ng/ul, RIN ≥ 6) 수행, 세포 고정 전 형광 염색으로 품질 측정, 데이터 생산조건 미달성 시 추가 샘플링 또는 라이브러리 재구축 진행.

○ 86개 줄기세포 및 오가노이드에서 RNA 추출 및 QC 수행

Quality Score 30 기준 최소 80% 이상 충족하며, 각 해독 데이터 생산조건 미달성 시 추가 샘플링 또는 라이브러리 재구축 진행

일의 법적 성격

법정 틀 없이 발주처가 스스로 사는 일

국가줄기세포은행 자원의 품질·특성 분석 및 내부 연구과제 성과 창출을 위한 자체 연구용역.

○ 국가줄기세포은행에서 제공하는 임상등급 줄기세포의 품질수준 제고

○ 내부 연구과제 수행 계획에 따라 성과 창출을 위해 활용

보관 조건

의무 · 계약 뒤 지킬 일

시료에서 RNA 추출 및 QC, 세포 해리·고정, 남은 시료 반납 등 시료 취급 조건.

• 대상 · 기타 줄기세포·오가노이드 시료의 RNA 보존 시약 냉동, 세포 해리·고정 등 시료 취급

  발주부서와 논의하여 세포 특성 규명 목적에 따라 시료를 ① RNA 보존 시약에 그대로 얼렸을 때 ② single cell RNA Seq과 동일한 방법으로 세포 해리 했을 때 ③ FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)를 이용해 세포 분리를 했을 때의 3가지 방법 나누어 해리가 가능한 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 함

○ 분석에 사용하고 남은 시료는 발주부서로 반납

연구 윤리 승인

없음

입찰 전 IRB·IND·IACUC 등 윤리·규제 승인을 마친 과제여야 참가할 수 있다는 요구가 문서에 없다.

문서 발췌

과업·요구

Ⅰ. 사업 개요

1. 용역 사업명 ○ 국가줄기세포은행 자원의 품질평가 및 세포 특성 규명 2. 사업 목적 ○ 국가줄기세포은행에서 보유한 자원의 품질 및 특성 분석 - 임상등급 줄기세포 자원의 분화 과정에서 유전자 발현 변화를 집단 전체 및 단일세포 수준에서 연계 분석하여 세포 특성을 규명하고자 함 - 국가줄기세포은행 자원을 활용한 3D 오가노이드의 감염 모델에서의 유전자 발현 변화를 집단 전체 및 단일세포 수준에서 연계 분석하여 세포 특성을 규명하고자 함 3. 사업 기간: 계약일로부터 ~ 2026.12.15. 까지 4. 사업 예산: 114,620,000원(부가가치세 포함) 5. 사업 수행체계

6. 사업 추진일정

Ⅱ. 사업 내용

1. 사업 세부내용 가. 줄기세포 및 오가노이드로부터 세포 해리 및 특정 세포 분리 ○ 줄기세포 및 오가노이드 (86개)에서 세포 해리 및 특정 세포 분리 - 발주부서에서 줄기세포 및 3D 오가노이드 모델 제공 - 발주부서와 논의하여 세포 특성 규명 목적에 따라 시료를 ① RNA 보존 시약에 그대로 얼렸을 때 ② single cell RNA Seq과 동일한 방법으로 세포 해리 했을 때 ③ FACs, MACs 등을 이용해서 특정 antibody (bead, 형광 항체를 발주처가 제공 예정)를 이용해 세포 분리를 했을 때의 3가지 방법 나누어 해리가 가능한 실험실 환경 및 경험을 갖추어야 함. 또한 86개 시료에 대한 해리 방법은 발주부서와 논의 후 결정 * 제안서 내 구체적인 세포 해리, 분리 방법, 오가노이드 적용 경험 여부 등을 반드시 명시 - 상기 준비된 시료는 bulk RNA Seq, Single Cell RNA Seq 데이터 생산 및 국가줄기세포은행 QC 결과로 활용됨 ○ single cell RNA Seq 데이터 생산을 위한 줄기세포 및 오가노이드 (10개)는 10x genomics flex apex protocol에 따라 단일세포 분리 및 고정 (fixation)을 수행. - 세포 고정 전 단일세포 수준에서 형광 염색을 통해 해리 및 분리된 세포의 품질을 측정. 농도, 세포수, 생존률, 세포 응집 및 세포외 기질 찌꺼기를 종합적으로 판단해 발주부서에 고품질의 데이터를 만들기 위한 기준 및 사전 테스트 결과를 제공해야 함 - 최적 조건을 확보하기 위한 사전 실험 용도의 줄기세포 및 오가노이드는 발주부서에서 제공할 수 있음 나. Bulk RNA-sequencing ○ 86개 줄기세포 및 오가노이드에서 RNA 추출 및 QC 수행 - QC (quantity ≥ 1 ug, concentration ≥ 65 ng/ul, RIN ≥ 6)에서 부적합한 것이 있을 경우, 발주부서와 협의 후 분석 진행 여부 결정 - 발주부서는 실험군에 따라 여러 차례에 나누어 시료 제공 ○ 전사체 서열 생산 (86건) - TruSeq® Stranded specific mRNA library kit (illumina)을 이용해 라이브러리를 구축하고, Illumina NovaSeq 6000 이상의 플랫폼으로 약 Raw data 6G 이상, 고품질 (Q30) 데이터는 90% 이상을 충족 - 생성된 raw data를 de-multi 하여 processing 후 expression profiling 및 DEG 결과 제공 등 분석 데이터 제공 (DEG 분석 시 적합한 알고리즘 및 비교 평준화 근거를 제시할 것)

* DEG viewer tool 제공 포함 다. Single cell RNA-seqencing ○ Custom detection probe 설계 및 제작 - 발주부서와 논의하여 GFP, long non-coding RNA, virus, microbe, other mRNA 등 10x genomics flex apex 기반 gene expression probe set에 없는 유전자에 대한 특이 custom probe 설계를 진행함 - 각 target 유전자당 2~3개의 probe set을 제작함 * 제안서 내 구체적인 probe 디자인 전략 및 경험에 대한 제안이 필요함 ○ 라이브러리 제작 및 데이터 생산 (10건) - 시료 1건 당 10,000개 세포를 target으로 하고, 세포 당 평균 10,000 read 수준으로 시퀀싱하여 10x genomics사에서 가이드하는 최소 이상의 데이터 생산 - Quality Score 30 기준 최소 80% 이상 충족하며, 각 해독 데이터 생산조건 미달성 시 추가 샘플링 또는 라이브러리 재구축 진행 ○ 생산된 데이터를 바탕으로 데이터 분석 및 발주부서 제공 - 각 샘플의 Fastaq 파일을 10x Genomics에서 지원하는 Cell Ranger 프로그램을 이용하여 html 형식의 summary 파일 제공 * 분석에 진행되는 single cell수, cell 당 read 수, cell 당 detection 되는 유전자 수, sequence quality 등 포함 - Cell Ranger 프로그램을 이용하여 Single cell RNA seq 분석 후 Cluster 간의 유전자 발현을 비교 분석한 결과를 엑셀 및 cloupe* 형식으로 제공 * Loupe Browser 프로그램에 input 가능한 형식의 파일로, 해당 프로그램 사용에 대한 매뉴얼 발주부서에 제공 - Custom detection probe를 이용하여 확보된 검출 결과를 단일세포 전사체 프로파일링 데이터와 연계하여 세포 유형별 전사 반응 특성 분석 및 해석방법 지원 * 기타 관련 사항은 발주부서와 협의 후 결정 라. 결과보고서 등 제출 ○ 최종 결과는 Raw data를 포함한 분석된 모든 결과 자료를 이동식 저장 장치에 담아 제출 ○ 검사 및 결과보고서 자료 제출 ○ 분석에 사용하고 남은 시료는 발주부서로 반납 ※ 과제수행 시 요구사항 ○ 용역수행기관 담당자는 별도의 요청이 없더라도 분석 단계별 진행상황을 발주부서 담당자에게 보고하여야 함

○ 과제 참여 수행기관(연구진)에 대한 발주부서 요구사항으로는 아래와 같음 : 데이터 생산에 대한 툴 직접 개발 등 과업 관련 발생가능한 문제 해결을 위한 자체 전문기술 보유 및 동일(유사) 과업 수행 이력을 보유한 기업 참여 필요 - 다양한 오가노이드로부터 세포 해리, 분리, 품질 평가, 고정 등에 대한 프로토콜 및 사전 경험을 보유하고 있는 곳 - 시료의 상태, 해리 효율, 품질 관리(QC) 미충족, 일정 변경 등 문제 발생 시, 수행기관은 즉시 발주부서와 협의하여 대응 방안을 확정한 후 진행할 것 - 목적한 FLEX probe 디자인 설계를 하고 단일세포 분석 등에 적용 가능할 것 2. 사업 결과활용 ○ 국가줄기세포은행에서 제공하는 임상등급 줄기세포의 품질수준 제고 ○ 국가줄기세포은행이 제공하는 줄기세포 자원의 특성에 대한 기초자료로 활용 ○ 내부 연구과제 수행 계획에 따라 성과 창출을 위해 활용

Ⅲ. 제안서 작성 기준 (권장사항)

1. 제안서 작성 지침

참가자격

Ⅳ. 안내 사항

1. 제안자격 ○ 본 사업의 수행이 가능한 업체로 아래 요건을 갖춘 사업자 - 「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」제7조(계약의 방법) 및 동법시행령 제43조(협상에 의한 계약체결)에 의거하여 검토하며, 동법시행령 제76조의 규정에 의한 부정당업자로 입찰참가 자격 제한을 받은 자는 제외함 - 입찰참가 대상자는 「중소기업기본법」 제2조에 따른 중소기업자 또는 「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」 제2조에 따른 소상공인으로서, 「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 중소기업(소상공인) 확인서를 소지한 업체일 것. 해당 확인서는 입찰서 제출 마감일까지 유효하여야 함. 또한 「중소기업제품 구매촉진 및 판로지원에 관한 법률 시행령」 제2조의3 제1항 제2호 가목에 해당하는 경우, 비영리법인은 중소기업(소상공인) 확인서가 없어도 입찰에 참가할 수 있음 - “국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령” 제12조 및 동법시행규칙 제14조의 규정에 의한 유자격자로서 동법시행령 제76조에 해당하지 않으며 국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정에 의하여 반드시 전자입찰서 제출마감일 전일까지 국가종합조달시스템에 유전자검사기관[업종코드 5331] 및 데이터분석제공사업자[업종코드 6539] 모두로 입찰참가 등록한 자 2. 사업 설명회: 없음(개별 문의, 043-249-2531)

배점·평가

3. 제안 발표: 제안서 서면평가 4. 사업자 선정방법 가. 평가 원칙 ○ 기본 방침 - 객관적이고 공정한 기준과 절차를 적용하여 경쟁에 의한 우수사업자 선정 ○ 입찰방식 : 협상에 의한 계약 체결 (국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령 제43조) - 제안서를 제출받아 기술 평가 후 기술평가점수(90점)와 가격평가점수(10점)를 합산하여 최고득점자를 우선 협상대상업체로 선정 * 기술평가 부서: 국립보건연구원 난치성질환연구과 나. 제안서 평가 원칙 ○ 제안내용에 대한 평가는 질병관리청 국립보건연구원에서 제안심사위원회를 구성하여 평가함 ○ 제안내용 중 “가능하다”, “동의한다”, “고려한다” 등의 표현은 불가능한 것으로 평가함(단, 질병관리청 국립보건연구원의 요구에 의하여 입증자료를 제출 받아 가능할 것으로 판단될 때에는 가능한 것으로 평가함) 다. 기술 평가 ○ 각 항목별 평가배점 및 방법은 [붙임 3]의 기술평가기준에 의함 ○ 각 심사위원의 평가점수를 산술 평균하여 기술평가점수로 함 - 각 심사위원의 평가점수 중 최고점수와 최저점수를 제외한 나머지 점수를 산술평균한 점수를 당해업체의 기술평가 점수로 함 - 기술평가점수가 동일할 경우, 기술평가 세부 평가 항목 중 배점이 가장 높은 항목의 점수가 높은 자를 선정 라. 우선협상대상자 선정 ○ 제안서평가결과 기술능력평가점수가 기술능력평가분야 배점한도의 85% 이상인 자를 협상적격자로 선정 ○ 기술평가점수와 가격평가점수를 합산한 점수가 최고득점자를 우선협상 대상자로 선정 - 동점자가 있을 경우는 기술평가 점수가 높은 업체를 선정 - 기술평가 점수가 동일할 경우, 기술평가 세부 평가 항목 중 배점이 가장 높은 항목의 점수가 높은 자를 선정 * 기술평가 항목 “사업수행방법>사업수행능력>사업제안내용>사업비 및 기간의 적절성” 순으로 점수가 높은 자를 선정 ○ 우선협상 대상 업체와 협상 결렬 시 차순위 업체 순으로 협상 실시 [붙임 1] 제안서 표지 사업 제안서(표지)