전장유전체 시퀀싱 단가계약(재공고)

요약 AI 요약

환자 유래 조직·혈액 검체 230건 이상에 대해 전장유전체 시퀀싱(Whole-Genome DNA Sequencing)을 수행하여 원시 시퀀싱 데이터를 생산하고, 이를 축적해 임상 유전체 통합 데이터베이스를 구축·실용화하는 사업이다.

• 환자 유래 230건 이상 조직/혈액 시료에서 gDNA 추출 및 정량·품질검사(QC) 후 성적서 제공
• PCR-free library 방식으로 라이브러리 구축
• NovaSeqX-plus 또는 그에 상응하는 최신 장비로 30X 이상, 150PE paired-end 시퀀싱 데이터 생산
• Q30 90% 이상, 평균 Mapping depth 30X 이상 충족하는 데이터 QC
• 원시데이터(FASTQ)를 lane 및 read group별로 발주처 요청 형식에 맞춰 이동식 저장장치(HDD)에 담아 제출
• Sample QC·DATA QC·Raw-data 성과물 제출

AI에게 이 공고를 물어볼 때 · ChatGPT · Claude에 이 링크를 함께 주면 공고문과 첨부를 정리한 글을 읽고 답합니다. /ai/projects/R26BK01751100 · 베타 기간 무료

사업 내용 · 이 공고에 든 일

중심 · 전장유전체 시퀀싱 데이터 생산

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

환자 유래 검체의 DNA 추출·QC부터 PCR-free 라이브러리 구축, NovaSeqX-plus 기반 30X WGS 데이터 생산까지 실험실 분석 업무를 수행하는 용역이다.

• gDNA 추출 및 Fluorometer·CE 정량/QC 성적서 제공
• Library 구축 및 QC
• Raw Sequence QC(Q30>90%, 평균 Mapping depth 30X 이상)
• FASTQ 원시데이터 생성 및 HDD 제출
• 미달 데이터 재생산
• 잔여 시료 반납 및 데이터 3개월 보관

평가 · 배점

협상 대상 기준 · 평가 점수의 합계가 85점 이상인 경우 적합으로 평가

참가 자격 · 제한

업종제한

제한 없음

지역제한

제한 없음

공동수급

공동수급불허

입찰참가 제한

없음

실적경쟁 · PQ

해당 없음

국제입찰

국내입찰

제출 방법

직찰

입찰 일정

가격

추정가격

79,454,545원

배정예산

87,400,000원

예정가격 방식

단일예가

공고 정보

공고종류

재공고 (재입찰공고)

게시일

09/30(수)

공고번호

R26BK01751100-000

참조번호

2026-0635

공고기관

분당서울대학교병원

수요기관

분당서울대학교병원

계약방법

일반경쟁

낙찰방법

규격가격동시입찰

계약유형

일반단가계약

예정가격 방식

단일예가

추정가격

79,454,545원

배정예산

87,400,000원

공공조달분류

연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 기타연구조사서비스

사전규격번호

R26BD00267034

재공고

재공고

출처

나라장터

첨부파일

• HWP · 1. 재공고(2026-0635).hwp · 공고규격서
• PDF · 1. 재공고(2026-0635).pdf · 공고규격서
• HWP · 2. 과업지시서.hwp · 공고규격서
• HWP · 3. 평가기준.hwp · 공고규격서

첨부 내용을 정리한 글 — 자격 · 배점 · 일정 · 발췌 ›

문서 발췌

과업·요구

󰊱 목 적 ○ 환자 유래 조직/혈액 DNA에 대해 Whole-Genome DNA Sequencing을 진행하고 생산된 유전체 데이터를 축적하여 임상 유전체 통합 데이터베이스 구축 및 실용화 󰊲 내 용 ○ (사 업 명) Genome-EHR 정밀의료코호트 전장유전체 시퀀싱 데이터뱅크 구축 ○ (계약기간) 계약시작일로부터 3년 ○ (과업범위) - 환자 유래 230건 이상의 조직/혈액 검체에 대해 전장 유전체 시퀀싱(Whole- Genome DNA Sequencing)을 진행하여 원시 시퀀싱 데이터 생산

󰊱 세부규격 조건 ○ 세부 사양 Library 구축 및 데이터 생산 (Whole-Genome DNA Sequencing) - platform : NovaseqX-plus 나 그에 상응하는 최신 platform 사용 - Total read base : 30X 이상 - Type of reads : Paired-end - Library type : PCR free library kit - Read 길이 : 150PE ○ Whole-Genome DNA Sequencing 건별 표준 OUTPUT 사양 - Mappable 30X 이상 (오차범위 ± 10%) ○ 세부 규격 - DNA 추출 및 QC - Library QC(Illumina NovaSeqX-plus 기준) - Raw Sequence QC - Q30>90% 이상 충족 기준 - 평균 Mapping depth 최소 30X 이상 󰊲 사업의 범위 및 내용 ○ 환자 유래 230개 이상의 조직/혈액 시료 확인 - 조직/혈액 시료는 발주 기관에서 준비함 - 발주 기관과 합의하여 계약 이후 샘플 전달 일정 조정 - 계약기관이 채택하고 있는 방법을 이용하여 발주처에서 제공하는 샘플에서 gDNA를 추출하고 Fluorometer 및 Capillary Electrophoresis를 이용한 정량 및 Quality check 진행 후 성적서를 제공 - Quality check 기준에 만족하지 못할 경우 발주기관에 즉시 보고 - 선정 업체는 각 시료에 대한 Quality Control 수행 및 보고서 제출 - 모든 남은 시료는 계약 종료 시 결과보고서와 함께 동시 반납 ○ Library 구축 및 데이터 생산 - WGS에 적합한 PCR-free library 방법 사용 - PCR-free 라이브러리 구축 실패 시 원인 분석 리포트 제공 및 재실험 프로세스를 제시 - NovaseqX-plus 또는 그에 상응하는 최신 platform 사용하여 30X이상 생산 - 생산된 데이터의 품질은 Quality Score 30 기준 90%이상 충족해야함 - 각 해독 데이터 생산 조건 미달성시 추가 라이브러리 구축 및 해독 진행 필수기관에서 정한 기준으로 QC를 통과한 결과에 해당하는 대상에 대해 서만 인정함 - 원시데이터(FASTQ)만 제공을 조건으로 함 󰊳 요구사항 ○ 과업 수행 조건 - NovaSeqX-plus 에 준하는 최신 대용량 NGS 장비 보유 필수, 하도급 불가 - 자격 증명을 위하여 국가종합전자조달시스템 입찰참가자격 등록규정 제9조1항에 따라 유효한 1169(학술,연구용역)와 5331(유전자검사기관) 코드를 입찰 공고일 전까지 보유하여야 함.

○ A/S 기간 등 기타 사항 - Library 보관 기간 : 3개월 이내 - 성과물 발송 후 3개월 데이터 보관 ○ 추진 일정 - Sample QC 자료 제출 : 샘플 전달 후 7일 이내 - Raw-data 및 보고서 제출 : Sample QC 이후부터 12주내 발송 ○ 성과물 - Sample QC, DATA QC, Raw-data - 발주처가 요청하는 형식으로의 각 lane 및 unique 한 read group 별 FASTQ 파일 - Raw data는 이동식 저장 장치(HDD)에 담아 제출 ○ 기타사항 - 제시한 세부규격 및 QC 기준에 적합하지 않은 데이터가 생산 되었을 경우, 그 기준에 적합한 데이터 재생산을 요구할 권리가 요청자에게 있으며. 상기 조건들에 대해 상호 협의 가능함. - Total read base는 발주 부서와 협의 가능함 󰊴 과업 관련 준수사항 ○ 본 과업의 성실하고 원활한 수행을 위하여 과업수행처는 신의와 책임의식을 갖고 추진하며 병원과 긴밀한 협조 체제를 유지한다. ○ 본 과업 내용상에 명시되지 않은 사항은 관계법령, 규정, 지침 등에 의하여 병원과 협의하여 결정한다. ○ 과업수행과정에서 발생하는 지적재산권 분쟁 등, 제반책임 및 행정적, 기술적 비용과 문제처리는 병원과 협의하여 처리한다. ○ 원칙적으로 공동수급 및 제3자 하도급 불가하며, 타 기관 장비를 대여하거나 국외로 샘플을 반출하여 분석하는 방식은 허용하지 않음 ○ 데이터 생산의 연속성과 장비 장애 발생 시 리스크 최소화를 위해, 계약상대자는 공고일 현재 NovaSeqX-plus 시스템 (또는 그에 상응하는 최신 platform)을 국내 자체 실험실 내에 최소 2대 이상 설치하여 상시 가동 중임을 증명해야 함. (※ 증빙서류: 제조사 발행 설치 확인서 필수 제출). 󰊵 기타 : 개인정보보호 등 보안 관련 ○ 계약상대자는 본 사업추진을 위해 수집한 개인정보를 위탁업무 수행 목적 및 범위 내에서만 사용하여야 한다. ○ 계약상대자는 위탁 받은 개인정보의 처리 업무를 제3자에게 재 위탁할 수 없다. ○ 계약상대자는 위탁받은 업무와 관련하여 개인정보를 처리하는 과정에서 개인정보보호법 및 계약상대자가 준수해야할 의무를 위반하여 발생하는 손해에 대해서는 병원과 협의하여 처리한다. ○ 계약상대자는 위탁받은 개인정보가 분실‧도난‧유출‧변조 또는 훼손되지 않도록 주의하여야 하며, 병원이 개인정보 처리실태를 위해 실시하는 감독 및 점검에 성실하게 응해야 한다. ○ 본 과업은 환자 유래 조직/혈액을 다루는 정밀의료 코호트 사업으로, 민감정보인 유전체 데이터의 유출 방지 및 철저한 개인정보 보호가 필수적임. ○ 계약상대자는 공고일 현재 국제 표준 정보보호 경영시스템 인증인 ISO/IEC 27001 및 개인정보보호 경영시스템 인증인 ISO/IEC 27701을 모두 보유하고 있어야 함. 또한, 국내 최고 권위의 국가 공인 개인정보보호 관리체계 인증인 ISMS-P(개인정보보호 관리체계 인증)를 획득하여 유지해야 함.

배점·평가