[일반용역](견적공고/3차)백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석

계약

요약 AI 요약

백신 접종 후 SARS-CoV-2에 감염된 마우스의 폐와 비강 림프 조직에서 면역 반응이 조직 내 어디서 어떻게 일어나는지 고해상도 공간전사체(Stereo-seq)로 분석·시각화하는 연구용역이다.

• 포르말린 고정 폐·비강 림프 조직(NALT)을 파라핀 블록(FFPE)으로 제작하고 5~10μm 연속 절편 제작(1개는 Stereo-seq 칩 부착, 1개는 H&E 염색)
• Stereo-seq 플랫폼으로 조직 절편에서 cDNA 합성 후 칩에서 방출
• cDNA 정제 후 증폭·indexing·adaptor ligation을 거쳐 DNA Nanoball(DNB) 제작, MGI DNBSEQ-T7로 시퀀싱
• 원시 데이터 처리 및 마우스 유전체 매핑, 상피층·혈관 등 미세 구조와 세포 집단의 공간적 분포 분석
• CellChat/CellPhoneDB로 세포-세포 상호작용 분석, GO·KEGG 경로 분석, IFN 반응·T세포 활성화 유전자 등 염증·회복 마커의 공간적 추적
• FASTQ 원본 데이터 포함 염기서열 결과보고서 및 최종 분석 결과보고서 작성·제출

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사업 내용 · 이 공고에 든 일

중심 · 공간전사체 분석 용역

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

FFPE 조직 절편 제작부터 Stereo-seq 라이브러리 제작·시퀀싱·공간전사체 데이터 분석·결과보고서 작성까지 실험실 분석 일체를 수행하는 위탁연구 용역이다.

• FFPE 파라핀 블록 제작 및 5~10μm 연속 절편 제작
• Stereo-seq 칩 부착 및 H&E 염색
• cDNA 합성·방출·정제·증폭·indexing·adaptor ligation
• DNB 제작 및 MGI DNBSEQ-T7 시퀀싱
• 원시 데이터 처리 및 마우스 유전체 매핑
• 미세구조·세포집단 공간분포 분석, CellChat/CellPhoneDB 세포-세포 상호작용 분석
• GO·KEGG enrichment 분석, IFN 반응·T세포 활성화 마커 공간 추적
• FASTQ 원본 데이터, Library QC·시퀀싱·최종 분석 결과보고서 제출

딸린 일 · 시료 제공 및 진도관리

용역 › 기타

발주부서가 직접 수행하는 시료 제공·결과보고서 검토로, 수행사가 맡는 일이 아니라 사업 수행체계상 발주부서 역할이다.

참가 자격 · 제한

업종제한

학술.연구용역(1169) 그리고 유전자검사기관(5331) 또는 학술.연구용역(1169) 그리고 데이터분석제공사업자(6539)

지역제한

제한 없음

공동수급

공동수급불허

입찰참가 제한

없음

실적경쟁 · PQ

해당 없음

국제입찰

국내입찰

제출 방법

전자입찰

입찰 일정

가격

추정가격

76,236,364원

배정예산

83,860,000원

기초금액

83,860,000원 (예비가격 -2% ~ +2%)

낙찰하한율

88%

예정가격 방식

복수예가

공고 정보

공고종류

재공고 (재입찰공고)

게시일

09/17(목)

공고번호

R26BK01735737-000

참조번호

국립보건연구원 공고 제2026-466호

공고기관

질병관리청 국립보건연구원

수요기관

질병관리청 국립보건연구원

계약방법

수의계약

낙찰방법

소액수의견적

계약유형

총액계약

예정가격 방식

복수예가

추정가격

76,236,364원

배정예산

83,860,000원

공공조달분류

연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 보건복지연구조사서비스

사전규격번호

-

재공고

재공고

출처

나라장터

첨부파일

• HWPX · [견적공고문](3차)공고 제2026-466호_백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석.hwpx · 공고규격서
• PDF · [견적공고문](3차)공고 제2026-466호_백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석.pdf · 공고규격서
• HWPX · 과업내용서(자격완화)_백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석.hwpx · 공고규격서
• HWPX · 산출내역서(공내역)_백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석v2.hwpx · 공고규격서

첨부 내용을 정리한 글 — 자격 · 배점 · 일정 · 발췌 ›

문서 발췌

=== 과업내용서(자격완화)_백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석.hwpx ===

과 업 내 용 서

1. 계약명 : 백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석 2. 계약 기간 : 계약체결일 ~ 2026. 12. 31. 3. 사업 예산 : 83,860,000원(부가세포함) 4. 사업수행체계 :

5. 사업 추진 배경 및 목표 □ 추진 배경 및 필요성  코로나19 팬데믹은 전 세계적으로 심각한 건강 위협을 초래했으며, mRNA 백신은 이에 대응하는 핵심 전략으로 자리매김하였음. 기존 SARS-CoV-2 연구들은 주로 말초혈액 단핵구(PBMC) 분석에 초점을 맞추거나, 조직 내 혼합된 세포 집단을 분석하여 바이러스가 염증 조직에 미치는 영향에 대한 깊이 있는 통찰력을 제공하는 데 한계가 있었음  폐와 같은 복잡한 조직에서는 바이러스 감염 및 백신 유도 면역 반응이 특정 미세 구조 내에서 국소적으로 발생하므로, 고해상도 공간 정보가 필수적임. 코로나19 백신 접종 후 SARS-CoV-2 감염 마우스의 폐와 비강 림프 조직에서 면역 반응의 변화를 이해하고, 세포 간 상호작용 및 공간적 특성을 파악하여 백신 효능 및 감염 방어 기전을 규명할 필요가 있음 □ 과업 목표  백신 접종 마우스에서 SARS-CoV-2 감염에 대한 폐와 비강 림프 조직의 공간적 해상도에서 면역 반응을 심층적으로 규명하기 위해 폐와 비강 림프 조직의 미세 구조 내에서 백신 효과가 바이러스 유발 염증 및 조직 손상에 미치는 영향을 고해상도 공간전사체(Stereo-seq) 분석을 통해 분석하고 시각화함 6. 추진 체계 및 과업 내용 ❍ 시료 제공(발주부서) - 대상 시료: 백신 접종 후 SARS-CoV-2 감염 마우스의 폐와 비강 림프 조직(NALT) (감염 후 3일 째에 채취하여 포르말린 고정) 총 8 샘플 [4개 그룹(그룹별 1마리씩) × 2개 조직(폐, NALT)] ❍ 조직 절편 제작 및 mRNA 포획(과업수행기관) - 포르말린으로 고정된 폐조직을 파라핀 블록(FFPE)으로 제작한 후, 조직의 구조적 손상을 최소화하여 적절한 두께(5~10μm)로 연속 절편을 제작함. 제작된 절편 중 한 개는 Stereo-seq 칩 표면에 부착하고, 한 개는 H&E 염색을 통한 형태학적 확인에 사용함 - 공간전사체 분석은 Stereo-seq (Spatial Enhanced REsolution Omics-sequencing) 플랫폼을 활용하여 수행 - Stereo-seq 칩에 부착된 조직 절편으로부터 cDNA를 합성한 후, cDNA를 칩에서 방출시킴 ❍ 라이브러리 제작 및 시퀀싱(과업수행기관) - 방출된 cDNA 혼합물은 정제하여 목표 크기의 cDNA를 수집 - 정제된 cDNA는 증폭, indexing 및 adaptor ligation 단계를 포함한 라이브러리 준비 과정을 통해 DNA Nanoball (DNB)로 제작 - 생성된 DNB는 MGI DNBSEQ-T7 시퀀서를 사용하여 시퀀싱 진행 ❍ 데이터 전처리 및 분석(과업수행기관) - 원시 데이터 처리 및 마우스 유전체 매핑 수행 - 폐 및 비강 림프 조직의 상피층, 혈관 등 주요 미세 구조 및 세포 집단의 공간적 분포를 분석

- 세포-세포 상호작용 분석: CellChat 또는 CellPhoneDB와 같은 R 패키지를 활용하여 백신 접종이 SARS-CoV-2 감염 마우스 폐에서 유도하는 차등 세포-세포 상호작용을 공간적 맥락에서 분석 수행 - 경로 및 기능 enricnment 분석: 차등 발현 유전자에 대해 Gene Ontology (GO) 및 KEGG Pathway entrichment 분석을 수행하여 주요 생물학적 경로 및 분자 메커니즘 분석 - 염증 및 회복 마커 분석: IFN 반응 유전자 및 T 세포 활성화 관련 유전자 등 발현 변화를 공간적으로 추적하여 백신 효과와 병태생리학적 결과의 연관성을 평가 ❍ 최종 산출물 및 결과보고서 작성 및 제출(과업수행기관) - 원본 데이터(FASTQ 파일)를 포함한 염기서열 결과보고서 및 최종 분석 결과보고서 작성 - 각 단계별 방법 및 결과에 대한 보고서 작성 7. 추진 체계  발주부서(감염병백신연구과) - 시료 제공: 백신 접종 후 SARS-CoV-2 감염 마우스의 폐와 비강 림프 조직 총 8개 샘플  과업수행기관 - 폐 및 비강 림프 조직 절편을 이용한 공간전사체용 슬라이드 부착 및 처리 - 공간전사체 라이브러리 제작 및 시퀀싱 수행 - 원본 데이터(FASTQ 파일)를 포함한 염기서열 결과보고서 및 최종 결과보고서 제공 8. 과제수행 시 요구사항  발주부서 요청 시 공간전사체 시퀀싱 및 분석에 필요한 장비(일루미나 플랫폼 NovaSeq6000, NovaSeq X plus, MGI T7, G400 장비 등) 및 연구시설 보유와 관련한 증빙서류 제출 필요  계약된 용역 업체가 직접 수행해야함(하도급 불가)  사업 수행에 필요한 전반적인 추진 상황 및 변경사항 발생 시 발주부서와 사전 논의하여 진행  과제 수행 단계별, 특이사항 보고  실험 raw data 및 종결보고서 제출 9. 사업관리

나. 결과물 등 제출  염기서열 원본 데이터(fastq file, 온라인 전송 또는 USB/외장하드)  Library QC 결과보고서  염기서열(sequencing) 결과보고서  최종 분석 결과보고서(상기 3종의 보고서는 통합 형태로 제출 가능)  Raw data 및 최종 분석 결과 일체를 USB 또는 외장하드로 전달  최종 보고서에는 발주부서가 요청하는 분석 결과물을 최대한 포함하여 자세히 작성하며, 최종 결과보고서 제출 시 원본 데이터는 전자파일로 별도 제출 10. 참가 자격 요건  계약방법: 소액수의(총액)견적입찰  참가자격: 본 사업의 수행이 가능한 법인, 비영리 등의 기관으로 아래의 요건을 충족하는 기관 - 「국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정」에 따라 입찰(개찰)일 전일까지 나라장터에 학술연구용역(업종코드 1169) 및 유전자검사기관(업종코드: 5331) 소지자 또는 학술연구용역(업종코드 1169) 및 데이터분석제공업자(업종코드: 6539) 소지자로 입찰 참가 등록한 자(공동계약 불가) - 비영리 법인 참여 가능 - 국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령 제12조 (경쟁입찰의 참가 자격)에 해당하고, 동법시행령 제76조(부정당업자의 입찰참가자격 제한)에 저촉되지 않은 경쟁입찰 참가조건을 구비한 기관 - 「중소기업기본법」제2조에 따른 중·소기업자 및「소상공인 보호 및 지원에 관한 법률」제2조에 따른 소상공인으로서「중소기업 범위 및 확인에 관한 규정」에 따라 발급된 <중·소기업·소상공인 확인서>를 소지한 자 === [견적공고문](3차)공고 제2026-466호_백신 접종 마우스 폐 및 비강 림프 조직에서의 SARS-CoV-2 감염 후 면역 반응 공간전사체 분석.hwpx ===