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전장유전체 시퀀싱 단가계약

유찰 · 분당서울대학교병원 · 실험실 분석

결과
유찰
참가
0곳 · 개찰 09/30(수)

요약 AI 요약

환자 유래 조직·혈액 검체 230건 이상에 대해 전장유전체 시퀀싱(Whole-Genome DNA Sequencing)을 수행하여 원시 시퀀싱 데이터를 생산하고, 이를 축적해 임상 유전체 통합 데이터베이스를 구축·실용화하는 사업이다.

  • gDNA 추출 및 정량·품질검사(Fluorometer, Capillary Electrophoresis) 후 성적서 제공
  • PCR-free 라이브러리 구축 및 QC
  • NovaSeqX-plus 또는 그에 상응하는 최신 장비로 30X 이상(Paired-end, 150PE) 시퀀싱 데이터 생산
  • Q30 90% 이상, 평균 Mapping depth 30X 이상 충족하는 데이터 QC
  • 원시데이터(FASTQ)를 lane 및 read group별로 이동식 저장장치(HDD)에 담아 제출
  • Sample QC·DATA QC·Raw-data 성과물 제출

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사업 내용 · 이 공고에 든 일

중심 · 전장유전체 시퀀싱 데이터 생산

용역 › 시험·분석·측정 › 실험실 분석

환자 유래 검체의 DNA 추출·QC부터 PCR-free 라이브러리 구축, NovaSeqX-plus 30X 시퀀싱, FASTQ 원시데이터 생산까지 유전체 분석 서비스를 제공하는 용역이다.

  • gDNA 추출 및 Fluorometer·CE 정량/QC 성적서 제공
  • Library 구축 및 QC(Illumina NovaSeqX-plus 기준)
  • Raw Sequence QC(Q30>90%, 평균 Mapping depth 30X 이상)
  • 미달 시 추가 라이브러리 구축·재해독
  • 원시데이터(FASTQ) HDD 제출 및 3개월 데이터 보관
  • 잔여 시료 반납

평가 · 배점

협상 대상 기준 · 평가 점수의 합계가 85점 이상인 경우 적합으로 평가

배점표 (AI 요약)
평가 항목배점
유사용역 이행실적 (최근 5년 이내 단일 계약건 100건 이상 WGS 수행 이행완료실적)10점
신용평가등급10점
용역사업 수행계획 - 제안서 적합성 및 충실성, 용역 과제의 이해도15점
용역사업 수행계획 - 용역 수행방식의 적정성10점
기술, 지식능력 - 과업 수행능력10점
기술, 지식능력 - 참여 인력의 전문성10점
기술, 지식능력 - 기관 사업 및 기관에 대한 이해도5점
운용 안정성 - 사업 수행 기관 적정성(참여인력 규모의 적절성 및 역할분담 체계, 장비 보유 현황 등)10점
운용 안정성 - 용역 수행을 위한 품질 시스템 구축 여부10점
상호협력 및 일정관리 - 이해관계자 의견 수렴 및 조절 방안의 적절성, 결과 도출 및 성과물 제출 기간의 타당성10점
합계(항목을 더한 값)100점

참가 자격 · 제한

업종제한
제한 없음
지역제한
제한 없음
공동수급
공동수급불허
입찰참가 제한
없음
실적경쟁 · PQ
해당 없음
국제입찰
국내입찰
제출 방법
직찰

입찰 일정

진행일시남은 날
공고 게시09/17(목)지남
개찰09/30(수) 11:00지남

가격

추정가격
79,454,545원
배정예산
87,400,000원
예정가격 방식
단일예가

공고 정보

공고종류
등록공고 (일반공고)
게시일
09/17(목)
공고번호
R26BK01734922-000
참조번호
2026-0598
공고기관
분당서울대학교병원
수요기관
분당서울대학교병원
계약방법
일반경쟁
낙찰방법
규격가격동시입찰
계약유형
일반단가계약
예정가격 방식
단일예가
추정가격
79,454,545원
배정예산
87,400,000원
공공조달분류
연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 기타연구조사서비스
사전규격번호
R26BD00267034
재공고
아니오
출처
나라장터

첨부파일

첨부 내용을 정리한 글 — 자격 · 배점 · 일정 · 발췌 ›

문서 발췌

과업·요구

󰊱 목 적 ○ 환자 유래 조직/혈액 DNA에 대해 Whole-Genome DNA Sequencing을 진행하고 생산된 유전체 데이터를 축적하여 임상 유전체 통합 데이터베이스 구축 및 실용화 󰊲 내 용 ○ (사 업 명) Genome-EHR 정밀의료코호트 전장유전체 시퀀싱 데이터뱅크 구축 ○ (계약기간) 계약시작일로부터 3년 ○ (과업범위) - 환자 유래 230건 이상의 조직/혈액 검체에 대해 전장 유전체 시퀀싱(Whole- Genome DNA Sequencing)을 진행하여 원시 시퀀싱 데이터 생산

󰊱 세부규격 조건 ○ 세부 사양 Library 구축 및 데이터 생산 (Whole-Genome DNA Sequencing) - platform : NovaseqX-plus 나 그에 상응하는 최신 platform 사용 - Total read base : 30X 이상 - Type of reads : Paired-end - Library type : PCR free library kit - Read 길이 : 150PE ○ Whole-Genome DNA Sequencing 건별 표준 OUTPUT 사양 - Mappable 30X 이상 (오차범위 ± 10%) ○ 세부 규격 - DNA 추출 및 QC - Library QC(Illumina NovaSeqX-plus 기준) - Raw Sequence QC - Q30>90% 이상 충족 기준 - 평균 Mapping depth 최소 30X 이상 󰊲 사업의 범위 및 내용 ○ 환자 유래 230개 이상의 조직/혈액 시료 확인 - 조직/혈액 시료는 발주 기관에서 준비함 - 발주 기관과 합의하여 계약 이후 샘플 전달 일정 조정 - 계약기관이 채택하고 있는 방법을 이용하여 발주처에서 제공하는 샘플에서 gDNA를 추출하고 Fluorometer 및 Capillary Electrophoresis를 이용한 정량 및 Quality check 진행 후 성적서를 제공 - Quality check 기준에 만족하지 못할 경우 발주기관에 즉시 보고 - 선정 업체는 각 시료에 대한 Quality Control 수행 및 보고서 제출 - 모든 남은 시료는 계약 종료 시 결과보고서와 함께 동시 반납 ○ Library 구축 및 데이터 생산 - WGS에 적합한 PCR-free library 방법 사용 - PCR-free 라이브러리 구축 실패 시 원인 분석 리포트 제공 및 재실험 프로세스를 제시 - NovaseqX-plus 또는 그에 상응하는 최신 platform 사용하여 30X이상 생산 - 생산된 데이터의 품질은 Quality Score 30 기준 90%이상 충족해야함 - 각 해독 데이터 생산 조건 미달성시 추가 라이브러리 구축 및 해독 진행 필수기관에서 정한 기준으로 QC를 통과한 결과에 해당하는 대상에 대해 서만 인정함 - 원시데이터(FASTQ)만 제공을 조건으로 함 󰊳 요구사항 ○ 과업 수행 조건 - NovaSeqX-plus 에 준하는 최신 대용량 NGS 장비 보유 필수, 하도급 불가 - 자격 증명을 위하여 국가종합전자조달시스템 입찰참가자격 등록규정 제9조1항에 따라 유효한 1169(학술,연구용역)와 5331(유전자검사기관) 코드를 입찰 공고일 전까지 보유하여야 함.

○ A/S 기간 등 기타 사항 - Library 보관 기간 : 3개월 이내 - 성과물 발송 후 3개월 데이터 보관 ○ 추진 일정 - Sample QC 자료 제출 : 샘플 전달 후 7일 이내 - Raw-data 및 보고서 제출 : Sample QC 이후부터 12주내 발송 ○ 성과물 - Sample QC, DATA QC, Raw-data - 발주처가 요청하는 형식으로의 각 lane 및 unique 한 read group 별 FASTQ 파일 - Raw data는 이동식 저장 장치(HDD)에 담아 제출 ○ 기타사항 - 제시한 세부규격 및 QC 기준에 적합하지 않은 데이터가 생산 되었을 경우, 그 기준에 적합한 데이터 재생산을 요구할 권리가 요청자에게 있으며. 상기 조건들에 대해 상호 협의 가능함. - Total read base는 발주 부서와 협의 가능함 󰊴 과업 관련 준수사항 ○ 본 과업의 성실하고 원활한 수행을 위하여 과업수행처는 신의와 책임의식을 갖고 추진하며 병원과 긴밀한 협조 체제를 유지한다. ○ 본 과업 내용상에 명시되지 않은 사항은 관계법령, 규정, 지침 등에 의하여 병원과 협의하여 결정한다. ○ 과업수행과정에서 발생하는 지적재산권 분쟁 등, 제반책임 및 행정적, 기술적 비용과 문제처리는 병원과 협의하여 처리한다. ○ 원칙적으로 공동수급 및 제3자 하도급 불가하며, 타 기관 장비를 대여하거나 국외로 샘플을 반출하여 분석하는 방식은 허용하지 않음 ○ 데이터 생산의 연속성과 장비 장애 발생 시 리스크 최소화를 위해, 계약상대자는 공고일 현재 NovaSeqX-plus 시스템 (또는 그에 상응하는 최신 platform)을 국내 자체 실험실 내에 최소 2대 이상 설치하여 상시 가동 중임을 증명해야 함. (※ 증빙서류: 제조사 발행 설치 확인서 필수 제출). 󰊵 기타 : 개인정보보호 등 보안 관련 ○ 계약상대자는 본 사업추진을 위해 수집한 개인정보를 위탁업무 수행 목적 및 범위 내에서만 사용하여야 한다. ○ 계약상대자는 위탁 받은 개인정보의 처리 업무를 제3자에게 재 위탁할 수 없다. ○ 계약상대자는 위탁받은 업무와 관련하여 개인정보를 처리하는 과정에서 개인정보보호법 및 계약상대자가 준수해야할 의무를 위반하여 발생하는 손해에 대해서는 병원과 협의하여 처리한다. ○ 계약상대자는 위탁받은 개인정보가 분실‧도난‧유출‧변조 또는 훼손되지 않도록 주의하여야 하며, 병원이 개인정보 처리실태를 위해 실시하는 감독 및 점검에 성실하게 응해야 한다. ○ 본 과업은 환자 유래 조직/혈액을 다루는 정밀의료 코호트 사업으로, 민감정보인 유전체 데이터의 유출 방지 및 철저한 개인정보 보호가 필수적임. ○ 계약상대자는 공고일 현재 국제 표준 정보보호 경영시스템 인증인 ISO/IEC 27001 및 개인정보보호 경영시스템 인증인 ISO/IEC 27701을 모두 보유하고 있어야 함. 또한, 국내 최고 권위의 국가 공인 개인정보보호 관리체계 인증인 ISMS-P(개인정보보호 관리체계 인증)를 획득하여 유지해야 함.

배점·평가

평가구분평가항목세부평가항목배점제출서류
기술
능력
평가
(100)
이행
능력
/
경영
상태
평가
(20)
유사용역
이행실적
(10)
◦ 입찰공고일 기준 최근 5년 이내, 단일 계약건으로
100건 이상의 WGS 수행한 이행완료실적
(실적증명서 제출)
※ 세부배점
10실적
증명서
신용
평가등급
(10)
신용평가등급 평가기준 참조신용평가
등급확인서
제안
평가
(80)
용역사업
수행계획
(25)
- 제안서 적합성 및 충실성
- 용역 과제의 이해도
15제안서
- 용역 수행방식의 적정성10
기술,
지식능력
(25)
- 과업 수행능력
- 참여 인력의 전문성
- 기관 사업 및 기관에 대한 이해도5
운용
안정성
(20)
- 사업 수행 기관 적정성
(참여인력 규모의 적절성 및 역할분담 체계, 장비 보유 현황 등)
10
- 용역 수행을 위한 품질 시스템 구축 여부
상호협력
및 일정관리
(10)
- 이해관계자에 대한 의견 수렴 및 조절 방안의 적절성
- 결과 도출 및 성과물 제출 기간의 타당성
합 계100
기준배점
입찰 공고일 기준 최근 5년 이내에 단일 계약건으로 100건 이상의 WGS 수행한 과제 실적증명서 제출 건수105건 이상3~4건2건 이하
1074
※ 신용평가등급 평가기준
회사채에 대한 신용평가등급기업어음에 대한 신용평가등급기업신용평가 등급평 점(점)
회사채에 대한 신용평가등급기업어음에 대한 신용평가등급기업신용평가 등급10점
AAA
AA+, AA0
AA-
A+
A0
A-
A1
A2+
A20
A2-
AAA
(회사채에 대한 신용평가등급 AAA에 준하는 등급)
AA+, AA0, AA- 이상
(회사채에 대한 신용평가등급 AA+, AA0, AA-에 준하는 등급)
A+
(회사채에 대한 신용평가등급 A+에 준하는 등급)
A0
(회사채에 대한 신용평가등급 A0에 준하는 등급)
A-
(회사채에 대한 신용평가등급 A-에 준하는 등급)
10
BBB+A3+BBB+
(회사채에 대한 신용평가등급 BBB+에 준하는 등급)
9.8
BBB0A30BBB0
(회사채에 대한 신용평가등급 BBB0에 준하는 등급)
9.6
BBB-A3-BBB-
(회사채에 대한 신용평가등급 BBB-에 준하는 등급)
9.4
BB+, BB0B+BB+, BB0
(회사채에 대한 신용평가등급 BB+, BB0에 준하는 등급)
9.2
BB-B0BB-
(회사채에 대한 신용평가등급 BB-에 준하는 등급)
9.0
B+, B0, B-B-B+, B0, B-
(회사채에 대한 신용평가등급 B+, B0, B-에 준하는 등급)
8.8
CCC+ 이하C 이하CCC+ 이하
(회사채에 대한 신용평가등급 CCC+에 준하는 등급)
7.0

「신용정보의 이용 및 보호에 관한 법률」 제4조제2항 또는 「자본시장과 금융투자업에 관한 법률」 제335조의3에 따라 업무를 영위하는 신용정보회사 또는 신용평가회사로부터 입찰공고일 이전에 평가받아 유효기간 내에 있는 가장 최근의 회사채, 기업어음 및 기업신용평가등급으로 평가함

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