한국인 마이크로바이옴 NGS 데이터 생산

계약

요약 AI 요약

한국인 샘플 DNA를 활용하여 차세대 염기서열 분석(NGS) 데이터를 생산함으로써, 건강 상태 진단 및 정밀 식이 가이드 제안을 위한 기반 정보를 구축하는 사업입니다.

• Illumina 플랫폼 기반의 1,200개 샘플 16S rRNA 유전자 앰플리콘 분석 데이터 생산
• Illumina 플랫폼 기반의 180개 샘플 메타게놈 샷건 분석 데이터 생산
• 샘플당 70,000개 이상의 유효 리드(Read) 확보(앰플리콘 분석)
• 샘플당 최소 10Gbp 이상의 유효 서열 양 확보(샷건 분석)
• 어댑터 및 프라이머 제거, Q20 기준 테일 트리밍, 평균 품질 Q30 이상의 품질 관리(QC) 수행
• 분석 결과에 대한 원천 데이터(Raw data) 제공

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평가 · 배점

기술 : 가격 — 기술 80점 · 가격 20점

협상 대상 기준 · 기술능력평가 점수가 기술능력 평가분야 배점한도의 85%(68점) 이상인 자를 협상적격자로 선정합니다.

참가 자격 · 제한

업종제한

학술.연구용역(1169)

지역제한

제한 없음

공동수급

공동수급불허

입찰참가 제한

없음

실적경쟁 · PQ

해당 없음

국제입찰

국내입찰

제출 방법

전자입찰

입찰 일정

가격

추정가격

218,040,000원

배정예산

239,844,000원

기초금액

235,047,120원 (예비가격 -2% ~ +2%)

예정가격 방식

복수예가

공고 정보

공고종류

등록공고 (일반공고)

게시일

07/30(목)

공고번호

R26BK01657638-000

참조번호

26-04473

공고기관

한국식품연구원

수요기관

한국식품연구원

계약방법

일반경쟁

낙찰방법

협상에의한계약

계약유형

총액계약

예정가격 방식

복수예가

추정가격

218,040,000원

배정예산

239,844,000원

공공조달분류

연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 식품연구조사서비스

사전규격번호

R26BD00251946

재공고

아니오

출처

나라장터

첨부파일

• HWP · (공고문) 한국인 마이크로바이옴 NGS 데이터 생산.hwp · 공고규격서
• PDF · (공고문) 한국인 마이크로바이옴 NGS 데이터 생산_변환본.pdf · 공고규격서
• HWP · 2026_NGS_제안요청서_20260729.hwp · 공고규격서

첨부 내용을 정리한 글 — 자격 · 배점 · 일정 · 발췌 ›

문서 발췌

과업·요구

=== 2026_NGS_제안요청서_20260729.hwp === “한국인 마이크로바이옴 NGS 데이터 생산”

제안요청서

2026. 7.

한국식품연구원

1. 사업개요

가. 개요 □ 사 업 명 : 한국인 마이크로바이옴 NGS 데이터 생산 □ 사업기간 : 계약 후 90일 이내 □ 납품장소 : 전북 완주군 이서면 농생명로 245, 한국식품연구원 □ 사업예산 : 239,844,000원 (VAT 포함) □ 계약방법 : 일반 경쟁 입찰 및 협상에 의한 계약 나. 추진배경 및 필요성 □ 한국식품연구원은 기본사업의 일환으로 “생애주기 마이크로바이옴 DB 기반의 정밀 식이 플랫폼 개발” 사업을 진행 중임 □ 인체의 장내미생물은 각종 암, 장관질환, 면역/대사질환 및 뇌질환 등과 관련 있는 것으로 보고되고 있으며, 인체의 장내미생물은 각 나라 혹은 지역에 따라 고유한 특징을 가지는 것으로 알려져 있음. - 인체 마이크로바이옴 연구를 위해서는 대규모 NGS (Next-generation sequencing) 기술에 기반한 데이터 생산과 해석이 필수적임 - 미국, 유럽, 중국 등은 HMP (Human microbiome project)나 MetaHit (Metagenomics of the human intestinal track) 등의 진행을 통해 자국민의 마이크로바이옴 정보를 구축 완료하고 헬스케어 분야로의 활용단계에 진입해 있음 - 하지만, 수 천 명을 대상으로 한 한국인의 마이크로바이옴-헬스정보는 아직 부족한 상태로, 한국인의 마이크로바이옴 정보에 기반한 질환 발전 예측 및 정밀식이 개발 등의 활용 연구를 위해서는 population 수준의 마이크로바이옴 기본 정보 구축이 선행되어야 함 □ 본 사업의 목적은 한국인 마이크로바이옴 정보를 바탕으로 개인의 건강 상태나 질환 진단 기술의 기반을 구축하고 마이크로바이옴 정보에 기반한 식이 및 생활 가이드를 제안하고자 하는 주관기관의 목표 달성을 위해, 제공된 한국인 샘플 DNA를 활용하여 NGS 데이터 (amplicon 및 shotgun)를 생산하는 것임. 다. 사업 내용 □ NGS 데이터 생산 기본 사항  주관기관에서 보유하고 있는 데이터와의 호환을 위해, 본 사업에서 진행하는 마이크로바이옴 분석은 Illumina platform을 사용해야 함.  16S rRNA gene의 amplicon sequencing 진행시 target region은 발주 기관에서 지정한 region을 대상으로 하여야 하며, amplicon sequencing은 발주 기관의 최소 유효 read 수를 충족하여야 함.  Metagenomic shotgun sequencing 진행시 발주 기관의 최소 유효 read 수를 충족하여야 함.  발주 기관의 최소 유효 서열 양을 미충족시 추가 분석을 통해 제안서 내용을 충족해야함.

□ 1,200 샘플 amplicon sequencing 데이터 생산 및 제공  16S rRNA sequencing은 Illumina Miseq platform을 기반으로 수행되어야 하며, 16S rRNA gene의 variable V3-4 region 전체를 포함하는 conserved primer를 이용하여 진행되어야함.  샘플당 QC 기준을 통과한 유효 read 수는 반드시 70,000/sample 이상이여야 함.  Sequence read의 QC 기준은 adapter/primer 제거하고, Q20기준으로 tail trimming하며, 평균 quality는 Q30 이상이여야 함. □ 180 샘플 shotgun sequencing 데이터 생산 및 제공  Metagenomic shotgun sequencing은 Illumina platform을 기반으로 수행되어야 하며 QC 통과한 서열 양이 최소 10Gbp 이상 되어야 함.  Sequence read의 QC 기준은 adapter 제거 후, Q20기준으로 tail trimming하며, 평균 quality는 Q30 이상이여야 함. 라. 성과품

* read QC 기준: adapter/primer 제거, Q20기준 tail trimming, 평균 quality Q30 이상 **샘플당 유효 sequence read는 70,000으로, merged reads의 최종길이 400bp 이상인 유효 sequence read를 기준함

2. 사업 참가 신청 및 제안서 제출

가. 참가자격  국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률시행령 제12조 제1항 및 동법 시행규칙 제14조 제1항에 의한 경쟁입찰 참가자격을 구비한 자  공고 마감일 기준, 국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령 제27조 및 동법 시행령 76조(부정당업자의 입찰참가자격 제한)에 해당하지 않는 업체 및 기관  본 사업에 적합한 학술연구용역으로 조달청에 입찰 참가 자격을 등록한 자  공동계약 방식은 불허하며, 참가자격에 결격사항이 있는 업체는 기술제안서 평가 없이 탈락 나. 입찰참가 방식 및 선정절차  입찰방식: 일반 경쟁 입찰  계약방법: 협상에 의한 계약 (총액, 기술평가)  선정절차: 공고 → 접수 → 평가 → 협상자 선정 → 협상 및 계약 다. 제안서 제출  제출장소 및 방법: 공고문 참조  제출서류: [별첨1]의 「제안서 양식」 에 따라 작성된 제안서  서류제출: 정성 제안서, 정량 제안서, 발표자료 (발표 15분/질의응답 5분), 기타 서류 각 1부 [각주 1] 서면평가로 대체할 수 있음  유의사항 - 제안된 제안서의 내용은 발주기관이 요청하지 않는 한 변경할 수 없으며, 계약체결 시 계약조건의 일부로 간주함. - 발주기관은 입찰 참가자에 대하여, 추가 자료를 요청할 수 있으며, 이에 따라 제출된 자료는 제안서와 동일한 효력을 가짐. - 추가자료 요청 시, 제안 기관은 이에 성실히 임하여야 하며, 미제출에 따른 불이익은 제안자에게 있음 (제안서 검토시, 추후 요청) - 발주기관의 요청에 따라 제안자가 수정, 변경, 보완한 내용은 계약서에 명시하지 않더라도 계약서와 동일한 효력을 가지나, 계약서에 명시된 내용의 경우는 계약서가 우선함. - 발주기관에서 요구하는 기한까지 수정, 변경, 보완된 제안 내용이 제출되지 않을 경우에는 당초 제출한 서류로만 평가함. 라. 제안서 및 발표자료 작성방법 및 유의사항  작성방법 - 제안자는 [별첨1]의 「제안서 양식」에 따라 정성 및 정량 제안서를 작성하여야 함. 정성 제안서는 총 10 페이지 이내를 권고하며, 정량 제안서는 제한 없음. - 제안서의 각 페이지는 쉽게 참조할 수 있도록 페이지 하단 중앙에 일련번호를 부여할 것. - 제안서의 내용을 객관적으로 입증할 수 있는 관련 자료는 제안서에 별첨으로 제시하는 것을 원칙으로 함. - 제안서의 내용은 명확한 용어를 사용하여 표현하여야 하며, “사용 가능하다”. “고려하고 있다” 등과 같은 모호한 표현은 평가시 불가능한 것으로 간주되고 계량화가 가능한 지표는 반드시 계량화하여 제시할 것.

배점·평가

참가자격

①「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령」 제12조 및 동법 시행규칙 제14조에 의한 입찰참가자격을 갖추어야 함. ②「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조(부정당업자의 입찰참가자격 제한) 및 동법 시행령 제76조(부정당업자의 입찰참가자격 제한)의 결격사유가 없는 사업자 ③「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조의5 및 「같은 법 시행령」 제12조제3항에 따라 ‘조세포탈 등을 한 자’로서 유죄판결이 확정된 날부터 2년이 지나지 아니한 자는 입찰에 참여할 수 없음. ④ 본 사업에 적합한 학술연구용역(업종코드 1169)으로 조달청에 입찰참가 자격을 등록한 자 ⑤ 공동계약 방식 및 하도급은 불허하며, 참가자격에 결격사항이 있는 업체는 기술제안서 평가 없이 탈락 3-1. 제출서류 (나라장터 전자제출) ------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1) 나라장터에서 출력한 “경쟁입찰참가자격등록증” 1부 2) 법인 등기부등본(개인사업자인 경우 사업자등록증) 1부 3) 산출내역서 1부 4) 신용평가등급확인서(공공기관제출용) 1부 5) 전자파일(원본/사본): [별첨1] 제안요청서의 양식에 따라 작성된 제안서[정성/정량 제안서], 제안요약서, 참고자료, 발표자료(원본/사본)(발표 15분/질의응답 5분)

- 기타 세부사항은 입찰공고서에 첨부된 제안요청서 등 관련 자료를 반드시 확인 하시기 바랍니다. 2. 입찰(개찰) 일시, 방식, 장소 ------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1) 일정 등 ① 접수개시일시 : 나라장터 공고문 참조 ② 접수마감일시 : 나라장터 공고문 참조 2) 가격입찰서: 상세내용은 공고문 5번 항목 참조 3) 제안서: 상세내용은 공고문 6번 항목 참조 ① 제출장소 : 나라장터 전자제출 ② 연락처 - 사업관련: 한국식품연구원 정밀식이연구단 임미영(☎ 063-219-9135) - 계약관련: 한국식품연구원 구매자산실 우혁(☎ 063-219-9863) - 가격입찰서와 제안서는 순서에 상관없이 제출 가능하며, 가격입찰서와 제안서 중 어 느 하나라도 제출하지 않은 경우에는 무효입찰 처리됩니다. 따라서 입찰자는 가격입 찰서와 제안서가 이상 없이 제출되었음을 확인하시기 바랍니다. 3. 입찰참가 자격 ------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1) 다음 각 호의 자격을 모두 갖춘 자이어야 합니다. ①「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령」 제12조 및 동법 시행규칙 제14조 에 의한 입찰참가자격을 갖추어야 함.

②「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조(부정당업자의 입찰참가자격 제한) 및 동법 시행령 제76조(부정당업자의 입찰참가자격 제한)의 결격사유가 없는 사업자 ③「국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률」 제27조의5 및 「같은 법 시행령」 제12조 제3항에 따라 ‘조세포탈 등을 한 자’로서 유죄판결이 확정된 날부터 2년이 지나 지 아니한 자는 입찰에 참여할 수 없음. ④ 본 사업에 적합한 학술연구용역(업종코드 1169)으로 조달청에 입찰참가 자격을 등록 한 자 ⑤ 공동계약 방식 및 하도급은 불허하며, 참가자격에 결격사항이 있는 업체는 기술제안 서 평가 없이 탈락 3-1. 제출서류 (나라장터 전자제출) ------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1) 나라장터에서 출력한 “경쟁입찰참가자격등록증” 1부 2) 법인 등기부등본(개인사업자인 경우 사업자등록증) 1부 3) 산출내역서 1부 4) 신용평가등급확인서(공공기관제출용) 1부 5) 전자파일(원본/사본): [별첨1] 제안요청서의 양식에 따라 작성된 제안서[정성/정량 제안서], 1) 제안요약서, 참고자료, 발표자료(원본/사본)(발표 15분/질의응답 5분) ※ 원본과 사본 모두 제출하여야 하며, 원본은 업체명 기재, 사본은 업체명 미표기 함.