담수생물 유전체 기반 마커 개발을 위한 담수동식물 6종 유전정보 확보

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끝난 공고 · 결과

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공고 개요

경북대학교 산학협력단 · 실험실 분석

낙찰업체

주식회사 씨더스 농업회사법인

낙찰금액

52,800,000원 · 낙찰률 94.674%

낙찰하한율

-

참가

1곳 · 개찰 07/01(수)

계약

요약 AI 요약

국내 자생 담수동식물 6종의 고품질 유전체 정보를 확보하여, 종 간 유전다양성 파악 및 유전체 마커 개발을 위한 기반 데이터를 구축하는 사업입니다.

• 담수생물 6종(식물 2종, 곤충 2종, 어류 2종) 총 576개 DNA 샘플의 품질 검사
• GBS 라이브러리 구축 및 Illumina 플랫폼 기반 시퀀싱 수행
• 종별 100~150G 규모의 시퀀싱 원천 데이터(Raw data) 생산
• 데이터 분리(de-multiplexing) 및 전처리(QC) 수행
• 원시 데이터(FASTQ), 바코드 목록, 품질 리포트 제출
• 최종 분석결과 보고서(PDF) 제출

평가 · 배점

협상 대상 기준 · 기술능력평가분야 배점 한도의 85% 이상인 자를 협상적격자로 선정

참가 자격 · 제한

업종제한

제한 없음

지역제한

제한 없음

공동수급

공동수급불허

입찰참가 제한

없음

실적경쟁 · PQ

해당 없음

국제입찰

국내입찰

제출 방법

전자시담

입찰 일정

가격

추정가격

50,700,000원

배정예산

55,770,000원

예정가격 방식

단일예가

공고 정보

공고종류

등록공고 (일반공고)

게시일

06/30(화)

공고번호

R26BK01608961-000

참조번호

연구관리부-6037

공고기관

경북대학교 산학협력단

수요기관

경북대학교 산학협력단

계약방법

수의계약

낙찰방법

수의시담

계약유형

총액계약

예정가격 방식

단일예가

추정가격

50,700,000원

배정예산

55,770,000원

공공조달분류

연구조사서비스 › 학술연구서비스 › 수자원연구조사서비스

사전규격번호

-

재공고

아니오

출처

나라장터

문서 발췌

과업·요구

가. 과업 범위 (1) 담수생물 6종의 genomic DNA를 이용한 GBS 라이브러리 구축 및 시퀀싱 데이터 생산 나. 세부과업 내용 (1) 분석 재료: 담수생물 6종 DNA 샘플 - 식물 2종: 말즘, 여뀌바늘 - 곤충 2종: 고려비단벌레, 금줄풍뎅이 - 어류 2종: 줄납자루, 참붕어 (2) 분석 규모: 담수식물 및 담수어류 총 576개 DNA 샘플 (6종 x 96개체) (3) 수행내용 가) 담수생물 6종에 대한 GBS library 구축 및 QC 수행 나) Illumina platform 기반 paired-end sequencing 수행 다) GBS sequencing raw data 생산 라) 담수동식물 6종에 대한 GBS로 생산된 데이터의 de-multiplexing 및 데이터 품질 점검 2. 주요 산출물 가. 결과 보고서 (1) raw data(FASTQ), 바코드 목록, Quality 리포트 포함 (2) 분석결과 보고서(PDF) 및 다운로드 링크 등의 매체 형태로 제출 Ⅳ. 추진체계

Ⅴ. 추진일정 1. 용역사업 입찰공고 및 계약 체결: 2026. 5. ~ 계약일 2. 용역수행 시작: 계약일로부터 7일 이내 3. 용역 결과보고서 제출: 계약종결일 4. 용역 수행 일정 가. 추진일정 (계약체결일로부터 12주 이내)

배점·평가

과업·요구

○ 예산 : 55,770,000원 (부가가치세 포함) 용역 수행 방안 가. 용역 범위 ○ 담수동식물 6종의 genomic DNA를 이용한 GBS 라이브러리 구축 및 시퀀싱 수행 나. 주요내용 ○ 담수동식물 6종 genomic DNA를 이용한 GBS 라이브러리 구축 및 시퀀싱 수행 - 대상: 담수동식물 6종(식물 2종: 말즘, 여뀌바늘, 곤충 2종: 고려비단벌레, 금줄풍뎅이, 어류 2종: 줄납자루, 참붕어) - 담수동식물 6종에 대한 GBS 라이브러리 제작 - 담수동식물 6종에 대한 GBS 데이터 생산 (종별 100~150G 생산) 다. 세부과업 내용 ○ DNA 샘플 수령 및 품질검사 - 용역수행기관에서 gDNA 샘플을 수거 - 용역수행기관에서 DNA의 Quality check(QC) 진행, 결과 통보 후 시퀀싱 진행 여부 협의 ○ GBS 라이브러리 제작 및 Sequencing 수행 - 담수동식물 6종 gDNA로 GBS 데이터 생산용 라이브러리(library) 구축 • 담수생물 유전체에 적정한 제한효소(restriction enzyme)를 처리하여 단편화 • 용역수행기관에서 개발하여 보유하고 있는 바코딩 정보를 활용하여 multiplexing 작업 수행 • 개체 별 바코딩이 수행된 샘플을 pooling 후 Purification 작업 진행 • Pooling 된 샘플을 enrichment PCR 실시하여 증폭 후 purification 실시 • GBS library 품질 점검 후 llumina NovaSeq 장비로 150 bp paired-end sequencing 진행 • 품질: Q30 이상의 base가 적어도 85% 이상 되는지 품질 검사하여 시퀀싱 quality 확보 ○ GBS로 생산된 데이터의 de-multiplexing 및 데이터 품질 점검 • 용역수행기관에서 개발한 개체 별 barcode 서열 정보를 기반으로 de-multiplexing 기술을 적용하여 short-reads 데이터를 각 개체 별로 분리 및 할당 • QC 과정(Adapter trimming, low-quality read 제거 등)을 통해 시퀀싱 데이터의 전처리를 진행 • QC 후 남은 cleaned reads 데이터가 원시 데이터 대비 80% 이상의 기준을 만족하는 데이터 확보 ○ 최종성과물 제출 • raw data (FASTQ), 바코드 목록, 품질 리포트를 포함 • 분석결과 보고서(PDF) 및 다운로드 링크 등의 매체 형태로 제출

다. 추진체계 ○ 발주처: 시료제공 및 과제관리 ○ 용역수행업체: GBS 라이브러리 제작 및 sequencing 데이터 생산 - Illumina사 NovaseqX 150 base-pair paired-end reading system을 사용, 종별 100~150G 데이터 생산 용역수행 시 요구사항 ○ 용역업체의 직접 수행을 원칙으로 함 ○ 총 576개 DNA 샘플(6종 × 96개체)에 대한 분석이 수행되어야 하며, 샘플 수는 발주처와 협의하여 조정 가능 ○ 최종 성과품(Sequencing 데이터 및 생물정보분석 결과 파일)은 계약기간 내 제출하여야 하며, 성과물의 하자로 인하여 추가 작업을 하여야 할 경우 추가작업 및 이에 소요되는 경비는 과업수행자가 부담하여야 함 ○ 과업 수행 시 과업범위의 조정 및 내용의 변경이 필요한 경우 발주처의 사업비 범위 내에서 이를 조정 또는 변경할 수 있음 ○ 과업지시서에 명기하지 아니한 사항이라도 감독관이 필요하다고 인정하는 부분에 대하여는 감독관의 지시에 따라 이를 이행하여야 함 ○ 과업수행자는 본 사업과 관련하여 취득하는 모든 정보를 외부로 유출 또는 누설하지 않아야 하며, 정보의 임의 유출에 대한 책임은 과업수행자에게 있음 ○ 최종 납품된 과업의 성과물과 관련된 저작재산권 일체와 2차 저작권을 발주기관에 양도해야 함 ○ 사업수행에 필요한 전반적인 추진 상황은 발주처와 사전 논의하여 진행할 것 ○ 용역 수행 전 과정은 발주처와 사전 협의 하에 추진하며, 단계별 중간 보고 및 검토 요청 시 이에 적극 응할 의무가 있음 용역 관리 ○ 추진일정 (계약체결일로부터 12주 이내)

○ 결과보고서 등 제출 - 생물정보 분석을 통한 분석결과는 발주처와 협의 후 단계별 분석완료시 보고 - 최종분석완료보고서는 용역수행에서 생산된 모든 자원정보, 프로토콜, 데이터 등이 포함되며 이에 대한 상세한 기술을 포함함 - 사용하고 남은 시료는 발주처에서 회수 후 보관함 - 최종보고 시 raw data 및 분석 결과는 파일로 제출 - 최종보고서 제출 전 발주처의 사전 검토 후에 제출 용역수행 시 요구사항 ○ 용역업체의 직접 수행을 원칙으로 함 ○ 총 576개 DNA 샘플(6종 × 96개체)에 대한 분석이 수행되어야 하며, 샘플 수는 발주처와 협의하여 조정 가능 ○ 최종 성과품(Sequencing 데이터 및 생물정보분석 결과 파일)은 계약기간 내 제출하여야 하며, 성과물의 하자로 인하여 추가 작업을 하여야 할 경우 추가작업 및 이에 소요되는 경비는 과업수행자가 부담하여야 함 ○ 과업 수행 시 과업범위의 조정 및 내용의 변경이 필요한 경우 발주처의 사업비 범위 내에서 이를 조정 또는 변경할 수 있음 ○ 과업지시서에 명기하지 아니한 사항이라도 감독관이 필요하다고 인정하는 부분에 대하여는 감독관의 지시에 따라 이를 이행하여야 함 ○ 과업수행자는 본 사업과 관련하여 취득하는 모든 정보를 외부로 유출 또는 누설하지 않아야 하며, 정보의 임의 유출에 대한 책임은 과업수행자에게 있음 ○ 최종 납품된 과업의 성과물과 관련된 저작재산권 일체와 2차 저작권을 발주기관에 양도해야 함 ○ 사업수행에 필요한 전반적인 추진 상황은 발주처와 사전 논의하여 진행할 것 ○ 용역 수행 전 과정은 발주처와 사전 협의 하에 추진하며, 단계별 중간 보고 및 검토 요청 시 이에 적극 응할 의무가 있음 사업대가의 지급 ○ 성과품 납품일로부터 14일 이내 검수 후 세금계산서 발행 및 대금 청구 ○ 경북대학교 산학협력단은 세금계산서 발행 후 5일 이내 대금(총액) 지급