차세대 염기서열 분석 장비

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끝난 공고 · 결과

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• 공고서(26-06)_차세대 염기서열 분석 장비.pdf · 공고규격서
• 규격서등_차세대 염기서열 분석 장비.zip · 공고규격서

공고 개요

한국재료연구원 · 이화학 분석기기

낙찰업체

주식회사 파이지노믹스

낙찰금액

91,630,000원 · 낙찰률 98.112%

낙찰하한율

- · 기초금액 9,344만원

참가

2곳 · 개찰 04/17(금)

요약 AI 요약

유전체 정보를 생산·분석하기 위한 차세대 염기서열 분석 장비 1대를 구매하는 사업이다. 병원체 검출·감시, 유전체 분석, 16S 메타지노믹스, 항생제 내성 유전자 확인 등 연구에 활용한다.

• 벤치 탑 형태(0.5m² 이내)로 클러스터 생성·DNA 증폭·염기서열분석·데이터 분석을 장치 내에서 모두 수행
• 1회 반응으로 최대 15Gb 데이터 생산, single end 기준 2,500만개 이상 클러스터 생산
• 짧은 염기 분석 4시간 이내, 작은 전장유전체 8시간 이내 데이터 생산
• 6종류 이상 플로우셀 지원(5M/25M, read length 100~1000bp)
• 2차 분석 IT 플랫폼 내장(FASTQ 5배 무손실 압축, BCL conversion·Mapping·Alignment·Variant calling 등, 16S metagenomics 등 앱 제공)
• 카트리지형 플로우셀 실온 보관, 주기적 wash 불필요, 자동 클러스터 생성

평가 · 배점

협상 대상 기준 · 기술평가 점수가 배점한도(100점)의 85% 이상인 자를 기술평가 적격자로 선정한다

참가 자격 · 제한

업종제한

제한 없음

지역제한

제한 없음

공동수급

공동수급불허

입찰참가 제한

모름

실적경쟁 · PQ

모름

국제입찰

국내입찰

제출 방법

전자입찰

입찰 일정

가격

추정가격

86,500,000원

배정예산

95,150,000원

기초금액

93,436,000원 (예비가격 -2% ~ +2%)

부가세

8,650,000원

예정가격 방식

복수예가

납품

품명

DNA서열분석기 (4111581101)

수량

1 sys

납품

계약 후 90일

인도조건

모름

제조물품

아니오

세부품명 등록

등록 필요

공고 정보

공고종류

등록공고 (일반공고)

게시일

04/06(월)

공고번호

R26BK01444788-000

참조번호

제2026-06호

공고기관

한국재료연구원

수요기관

한국재료연구원

계약방법

제한경쟁

낙찰방법

규격가격동시입찰

계약유형

총액계약

예정가격 방식

복수예가

추정가격

86,500,000원

배정예산

95,150,000원

사전규격번호

R26BD00206953

재공고

아니오

출처

나라장터

문서 발췌

과업·요구

규 격 : 세부사양 참조 납품기한 : 계약 후 90일 이내 라. 납품장소 : 경남 창원시 성산구 창원대로 797 한국재료연구원 입찰방법 : 규격․가격 동시입찰(제한총액) 추정금액 : 95,150,000 원 (부가세포함) 하자책임담보기간 : 1년

Ⅱ 입찰 안내

입찰방식 입찰방식은 “국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령” 제18조(2단계 경쟁등의 입찰)에 의한 “규격(기술) · 가격 동시입찰” 입찰참가자격 “국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령〃제12조 규정에 의한 입찰참가 자격을 갖춘 업체 『국가를 당사자로 하는 계약에 관한 법률 시행령』 제21조 및 동법 시행령 제76조의 규정에 의거 입찰참가자격 제한을 받지 않는 자 「국가종합전자조달시스템 입찰참가자격등록규정」에 의하여 국가종합전자조달시스템 (나라장터)에 입찰참가자격등록 마감일시까지 DNA서열분석기 (세부품명번호 : 4111581101)를 제조 또는 공급 물품으로 입찰참가 등록한 자 입찰시 제출서류 입찰에 참여하고자 하는 자는 본 요청서에서 정하는 모든 사항을 숙지하여 구매자 요구사항을 충분히 수용할 수 있어야 함. 2) 입찰시 입찰자는 한국재료연구원에서 기술평가를 할 수 있도록 다음 서류 및 제안서를 반드시 나라장터를 통하여 전자적으로 제출하여야 한다. 만약 기술 제안서가 임의적이거나 다르게 제출되었다면 해당항목 평가는 최하점을 부여한다.

배점·평가

과업·요구

Ⅰ. 용도(End-user's Use) - 구매 예정 장비는 유전체 정보를 생산 및 분석하기 위한 용도로 사용될 것이며, 병원체 검출 및 감시, 유전체 분석, 16S 메타지노믹스 분석, 항생제 내성 유전자 확인 등 광범위한 유전자 관련 연구에 활용될 수 있다. - 메타지노믹스 분석 시스템은 주요 감염병 원인 병원체를 대상으로 한 전장 유전체 분석을 통해 병원체 고유의 분자 역학적 특성을 데이터화하고 병원체 간 연관이 가능하도록 관련 정보를 제공함으로써 감염원 및 감염경로를 추적하기 위한 목적으로 사용될 수 있다. - 또한, 다양한 종에 대한 생명현상을 관찰, 이해, 조절하는 연구에 활용하면서, 이를 통해 생물에 대한 이해를 높이고 유용한 바이오마커를 발굴, 분류하는 연구에 활용되며 생명과학 및 의학의 주요 목표인 질병의 진단 및 정밀치료를 위한 연구를 위해 운영될 것이다. Ⅱ. 장비의 구성(Configurations of Goods) 1. 메타지노믹스 분석 시스템 본체(Main body) 1 SET - 장비본체 1 개 - 내장 컴퓨터 및 분석 소프트웨어 1 개 - 내장 컴퓨터 모니터 1 개 Ⅲ. 성능 및 규격(Performance and Specification) 1. 성능기준 가. 장비는 실험실 공간 내 소모를 최소화 하도록 0.5m2 이내 크기 내 설치가 가능한 하나의 벤치 탑 형태로 구성되고 장치 내에서 클러스터 생산, DNA증폭, 염기서열분석, 데이터 분석이 모두 가능해야 한다.

나. 장비는 시퀀싱 연구의 확장을 지원하기 위해 미생물 유전체학연구, 표적 유전자 시퀀싱, 미생물 군집 연구 등 데이터 아웃풋이 필요한 어플리케이션에 지원될 수 있어야 한다. 이를 위해 한번 반응으로 최대 15Gb 크기 유전자 분석의 데이터를 생산하고, single end read 염기서열 분석 진행 시 최대 이천오백만개 이상의 클러스터를 생산해야 한다. 다. 장비는 신속한 병원체 감염 분석을 위해 짧은 염기 분석에 대해서는 4시간 이내에 샘플로 부터 원하는 데이터를 생산할 수 있어야 한다. 또한, 작은 전장유전체 샘플에 대해서는 8시간 이내에 데이터를 생산해야 한다. 라. Terminator-based 방법 등을 이용한 합성을 통해 전장 DNA 가닥 중 한 개의 염기도 확실하게 분석할 수 있어야 하며, 장비 자체에서 특이적인 염기서열, 호모폴리머(homopolymers), 반복서열(repetitive sequence regions)과 같은 서열에서 발생 되는 에러 제거할 수 있어 양질을 데이터를 확보할 수 있어야 한다. 마. 장비의 효율적인 운용을 위하여 대용량의 데이터 생산이 필요한 어플리케이션 뿐만 아니라, 다양한 데이터 크기의 유전자 분석의 데이터 생산이 가능하도록, 여러 종류의 플로우셀 타입이 지원가능해야 한다. 플로우셀은 싱글 리드로 오백만개 ~ 이천오백만개 read를 생산, read length는 100~1000bp의 다양한 분석 길이에 대해 분석할 수 있어야 한다.

라. 장비는 사용자의 분석 편의성 및 효율적이고 빠른 분석을 위해 2차 분석 IT 플랫폼을 포함해야 한다. 2차분석 플랫폼은 직관적인 광범위한 분석 파이프라인을 제공해야 한다. 또한 FASTQ 파일의 5배 무손실 압축을 지원해 데이터 관리 및 데이터 전송이 용이해야 하며, BCL conversion, Mapping, Alignment, sorting, Duplicate marking 및 Variant calling 등의 솔루션이 포함되어야 한다. 마. 장비는 사용자의 편의를 고려해 조작이 단순화 되어야 하며, 주기적인 wash 과정이 없어야 한다. 플로우셀은 카트리지화 되어 실온 보관이 가능하여 실험 시 해동 과정이 필요 없어야 한다. 규격화된 워크플로우 제공으로 Hands-on 시간을 최소화하여 사용자 실수 및 실험 준비 시간을 최소화하고, 준비된 라이브러리를 카트리지에 장착된 샘플 튜브에 로딩한 후, 플로우셀 로딩 및 클러스터 생성 과정은 기기 내에서 자동으로 진행되어야 한다. 2. 규 격 가. 장비본체 (Benchtop system) - 최대 한 쌍의 분석길이(Paired-end capability): 2 × 500 bp Read Length 이거나 그 이상이어야 한다. - 최대 데이터 처리량: 25 Gb 이거나 그 이상이어야 한다. - 최대 데이터 생산량: 25 million single-end reads 이거나 그 이상이어야 한다. - 데이터 생산속도: 2 x 150 bp 생산시 8시간 이하여야 한다. - 데이터 정확도: 최대 ≥ 90% of bases higher than Q30 - 서열분석 원리: XLEAP-SBS 합성시퀀싱(Sequencing By Synthesis, SBS) 기술 - 플로우 셀 (Flow Cell) 갯수: 단일 플로우셀 시스템으로 다양한 적용을 위해 6 종류 이상의 플로우셀 지원이 가능해야 한다. - 플로우 셀 구성, 데이터 정확도, 처리량:

- 발광다이오드 (LED) 파장: 450nm, 511nm - 운영 환경 습도: 20%-80%, non-condensing - 운영 환경 온도: 15℃ - 30 ℃ - 전력 요구 사항 : AC 100–240 Vac, 50/60Hz, 300W - 크기 (WxDxH) : 40.2 x 44.8 x 47.3 cm - 무게 : 36 ㎏ 나. 내장컴퓨터 시스템 - 조작 컴퓨터 시스템은 장비 내부에 내장되어 있어야 하며, 이차 분석용 Bio IT 분석 플랫폼이 장비에 포함되어야 한다. 장비 내에서 유전체 데이터를 5배 무손실 압축할 수 있어야 하고, 초고속 매핑 기법을 사용하여 참조 유전체에 매핑할 수 있어야 한다. 또한, 아래와 같은 2차 분석 앱이 제공되어 장비 내에서 사용할 수 있어야 한다. -2차 분석 파이프라인: 16S metagenomics, Enrichment, Amplicon, Microbial amplicon, Library QC, Metagenomic, small WGS - 네트워크연결: 기기와 데이터 관리 시스템간 RJ-45를 이용해 직접 또는 네트워크를 통해 최대 2 x 2.5 GbE연결 - 네트워크 연결 대역폭: 내부 네트워크 업로드: 기기당 50Mbps, BaseSpace sequence Hub 업로드: 기기당 50 Mbps, 기기운영 데이터 업로드: 기기당 5 Mbps Ⅳ. 기타 조건(Remarks)